🧬 معرفی کارگاه های تخصصی

تجزیه‌وتحلیل داده‌های توالی 16S rRNA با استفاده از Qiime2

• مقدمه‌ای در مورد میکروبیوم و انواع داده‌های Whole metagenome and 16S rRNA و توالی یابی نسل جدید (NGS) و سایر پلتفرم‌ها برای آنالیز داده‌های امپلیکون

• مقدمه‌ای در مورد Qiime2 و افزونه آن برای تحلیل تاکسونومیکی و عملکردی داده‌های 16S rRNA

• ایجاد متاداده برای نمونه‌ها

•کنترل کیفیت توالی و ساخت جدول ویژگی

• ایجاد درخت برای تجزیه‌وتحلیل تنوع فیلوژنتیکی

• تحلیل تاکسونومیکی

• تحلیل عملکردی با استفاده از PICRUSt2

👤 مدرس:آقای نوروزی
📅تاریخ برگزاری: دوشنبه ۱۵ اسفند(ساعت ۸-۱۲ و ۱۴-۱۸)
🔸ثبت نام

🎙 سخنرانان کلیدی همایش ICB11

‌Burkhard Morgenstren

Full Professor and head of Department of Bioinformatics at University of Göttingen since 2002

🔸 Founder and Editor of the journal `Algorithms for Molecular Biology' since 2006
🔹Group leader, Int. Grad. School of Bioinformatics and Genome Research, Univ. Bielefeld
🔹MIPS, Max-Planck-Institut, Martinsried, and GSF Research Center, Neuherberg
🔹Postdoc, GSF Research Center, Neuherberg
🔹Dr. math., Univ. Bielefeld. Thesis work on multiple sequence alignment. Supervisor: Prof. A. Dress
🔹 Diplom in Mathematics, Univ. Munich. Thesis work on partial differential equations. Supervisor: Prof. J. Batt

Editorial service
🔸BMC Bioinformatics
🔸Algorithms for Molecular Biology
🔸The Open Applied Informatics Journal
🔸Advances in Bioinformatics
🔸PeerJ
🔸NAR Genomics and Bioinformatics
🔸Mathematical Biosciences and Engineering


🌐 Personal pages:
Web of science
ResearchGate
Google Scholar

🧬 معرفی کارگاه های تخصصی

RNA-seq data analysis workshop

• A brief introduction to basic shell commands in Linux
• High-throughput technologies to study mRNAs
• Gene Expression Omnibus (GEO) and Sequence Read Archive (SRA) database
• SRA Toolkit to download short reads from SRA
• RNA-seq library preparation
• Raw fast files, e.g. fastq
• Quality control of raw files with fastqc
• Mapping/Aligning short reads to the reference genome with hisat2
• Standard formats for alignment files, e.g. SAM (Sequence Alignment Map) or BAM
• Processing SAM files with samtools
• Post-alignment quality control with RSeQC
and novel splicing events in RNA samples
• Gene transfer format (GTF) file usage
• Differential gene expression analysis across two or more conditions with DESeq2
• PCA analysis for differentially expressed genes
• Gene Set Enrichment Analysis with DAVID and GSEA packages
👤 دکتر ملک‌پور و دکتر صالحی
📅تاریخ برگزاری: پنجشنبه ۱۱ اسفند(ساعت ۸-۱۲) و جمعه ۱۲ اسفند (ساعت ۸-۱۲)
🔸ثبت نام

اهمیت شرکت حضوری در رویدادهای علمی

❓️شما پرسیدید:
چه تفاوتی بین شرکت در همایش ها به صورت حضوری یا مجازی وجود دارد؟

✅️پاسخ را از نگاه آقای دکتر مهدی صادقی، رئیس دومین همایش بین‌المللی و یازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران می شنویم.

⏰ آخرین مهلت ثبتنام جهت شرکت حضوری: ۳۰ بهمن ماه

🌐 برای اطلاعات بیشتر به سایت مراجعه فرمایید:
ICB11.IBIS.ORG.IR

🔴 اطلاعیه

تغییر در برنامه برگزاری ورکشاپ < کاربرد مدل‌های محاسباتی در مطالعات سرطان>

بنا به اعلام جناب آقای دکتر منتظری، این کارگاه تنها در روز پنجشنبه ۱۸ اسفند و در ساعات ۸ الی ۱۲ و ۱۴ الی ۱۸ برگزار میگردد.

🎙 سخنرانان کلیدی همایش ICB11

BERNHARD PALSSON

Galetti Professor of Bioengineering University of California

🔸 The Principal Investigator of the Systems Biology Research Group in the Department of Bioengineering, and Professor of Pediatrics

Patents
🔸Methods and compositions for the optimization of human hematopoietic progenitor cell cultures
🔸Method for the ex vivo replication of stem cells, for the optimization of hematopoietic progenitor cell cultures, and for increasing the metabolism, GM-CSF secretion and/or IL-6 secretion of human stromal cells
🔸Photobioreactors and closed ecological life support systems and artificial lungs containing the same

🏅member of the National Academy of Engineering and is a Fellow of the AIChE,  AIMBE, AAAS, and the AAM
🏅Novozymes Award within Biochemical and Chemical Engineering-2016
🏅He has co-authored more than 450 peer-reviewed research articles and has authored four textbooks such as Systems biology.

🌐
Website
Google Scholar

🎙 سخنرانان کلیدی همایش ICB11

🔸دومین همایش بین المللی و یازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران

👤 لیست سخنرانان:
🇺🇸برنارد پالسون
🇺🇸 آلبرت لاسلو باراباسی
🇩🇪 بورکارد مورگنشترن
🇩🇪ایوان کاستا
🇦🇺 فاطمه وفایی
🇫🇮محی‌الدین جعفری
🇮🇷کاوه کاوسی
🇮🇷 چنگیز اصلاحچی
🇮🇷 علی شریفی‌زارچی


📅 اخرین مهلت ثبت نام حضوری: ۳۰ بهمن ماه ۱۴۰۱
آخرین مهلت ثبت نام مجازی: ۶ اسفند ۱۴۰۱

📍 تهران-پژوهشگاه دانشهای بنیادی (IPM)

سایت همایش:
🌐 ICB11.IBIS.ORG.IR

@IranianBioinformaticsSociety
@CBRC_aut

🎙 سخنرانان کلیدی همایش ICB11

👤 Changiz Eslahchi

Professor of algorithm in bioinformatics, Department of Computer Science, Shahid Beheshti University

🔸 Head of Department of Cognitive Modeling, Institute for Brain and Cognitive Science, Shahid Beheshti University, from 2014

🔹Member of the School of Biosciences at the Institute for Research in Fundamental Sciences (IPM), Tehran.

🔹Member of the Center of Excellence Discrete Structure, Algebra and Logic at Shahid Beheshti University

🔹Member of the Bioinformatics Group at the Tehran University

🔹Chairman of Math. Dept. 2006-2008


🔸Member of Iranian Mathematical Society
🔸Member of Iranian Bioinformatics Society
🔸Member of IInternational Society for Computational Biology


📄 Research interests
Combinatorial algorithms in bioinformatics, Phylogenetic networks construction, System biology, Graph theory

🌐 Personal pages:
Personal website
ResearchGate
Google Scholar

🔗 ثبت نام همایش ICB11: سایت

✏️اولین سمپوزیوم دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران
http://icb11.ibis.org.ir/introducing-student-symposium/

🔸آنالیز داده های بیان ژن در سطح تک سلولی (چهارشنبه ۳ اسفند، ۱۵ الی ۱۸):
http://icb11.ibis.org.ir/events/single-cell-rna-seq-analysis-and-its-application-in-cancer/

🔸️ بایوپایتون (پنجشنبه ۴ اسفند- ۸ الی ۱۱)
http://icb11.ibis.org.ir/events/biopython/

🔸️ مصور سازی داده( data visualisation ) بر مبنای پایتون (پنجشنبه ۴ اسفند- ۱۱ الی ۱۴)
http://icb11.ibis.org.ir/events/data-visualization-with-python/

🔸️ مقدمه‌ای بر زیست شناسی سامانه‌ای (پنجشنبه ۴ اسفند- ۱۴ الی ۱۷)
http://icb11.ibis.org.ir/events/systems-biology/


🔸️ طراحی محاسباتی و جایگزینی دارو (پنجشنبه ۴ اسفند- ۱۷ الی ۲۰)
http://icb11.ibis.org.ir/events/drug-design-and-reporpusing-symposium/

🔸️ روش‌های جدید شبیه سازی دینامیک مولکولی (جمعه ۵ اسفند- ۸ الی ۱۱)
http://icb11.ibis.org.ir/events/novel-molecular-dynamics-simulation-approaches/

🔸️ یادگیری عمیق در بیوانفورماتیک (جمعه ۵ اسفند- ۱۱ الی ۱۴)
http://icb11.ibis.org.ir/events/deep-learning-in-bioinformatics/

🔸️ الگوریتم ژنتیک (جمعه ۵ اسفند- ۱۴ الی ۱۷)
http://icb11.ibis.org.ir/events/genetic-algorithm/

🔸️ ایمونو انفورماتیک (جمعه ۵ اسفند- ۱۷ الی ۲۰)
http://icb11.ibis.org.ir/events/immunoinformatics/

🔹تمامی جلسات سمپوزیوم ها به صورت مجازی و بر مبنای اسکای روم برگزار میگردند.

🔹جلسات پس از برگزاری به صورت ضبط شده در اختیار شرکت
کنندگان قرار میگیرد.

🔹برای ثبت نام در هر کارگاه تا ۳ ساعت قبل از آن مهلت ثبتنام وجود دارد.

📣 اطلاعیه

به اطلاع تمامی فرستندگان مقالات به دومین کنفرانس بین المللی و یازدهمین کنفرانس ملی بیوانفورماتیک ایران (ICB11) میرساند:

وضعیت داوری مقالات ارسال شده، به روزرسانی شده است.
جهت اطلاع از وضعیت قبولی مقاله، حساب کاربری خود در سایت همایش را چک بفرمایید.

عزیزانی که مقاله شان جهت ارائه پوستر انتخاب شده از فایل زیر جهت طراحی پوستر استفاده نمایند:
http://icb11.ibis.org.ir/wp-content/uploads/2023/02/ICB11-Poster-template.pptx

🔴 مهلت نهایی ارسال پوسترها: ۷ اسفند ۱۴۰۱
درصورتی که پوستری ارسال نگردد، گواهی پوستر برای نویسنده منظور نمیشود.

همچنین کسانی که مقاله شان برای ارائه شفاهی پذیرش شده است، برای طراحی صفحه اول از تمپلیت زیر استفاده کرده و باقی صفحات را به سلیقه خود طراحی نمایند:
http://icb11.ibis.org.ir/wp-content/uploads/2023/02/ICB11-Presentation-template.pptx

@IranianBioinformaticsSociety
@CBRC_aut

📝دعوت تمامی علاقه مندان به شرکت در دومین همایش بین المللی و یازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران

👤توسط: خانم دکتر نجمه صالحی، دبیر اجرایی دومین همایش بین‌المللی و یازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران و عضو هیئت مدیره انجمن بیوانفورماتیک ایران

⏰ آخرین مهلت ثبت نام آنلاین: ۶ اسفند ۱۴۰۱

🌐 برای اطلاعات بیشتر به سایت مراجعه فرمایید:
ICB11.IBIS.ORG.IR

🎙 سخنرانان کلیدی همایش ICB11

👤 Kaveh Kavousi

Associate Professor,Department of Bioinformatics, Institute of Biochemistry and Biophysics, University of Tehran

🔹Ph.D. 2012, Computer Engineering - Artificial Intelligence and Robotics, University of Tehran

🔹M.S, 2001, Computer Engineering - Artificial Intelligence and Robotics, University of Tehran

🔹B.S, 1997, Computer Engineering, Amirkabir University of Technology (Tehran Polytechnic)

🔸Member of the board of directors and vice president of the Iranian Bioinformatics Society,2019
🔸Member of the Board of Directors and Treasurer of the Iranian Bioinformatics Society,2016


📄 Research interests:
machine learning, bioinformatics and complex biological systems

🌐 Personal pages:
LinkedIn
Google Scholar
Researchgate

چگونه در سایت پوستر یا ارائه خود را آپلود کنیم؟

۱. وارد اکانت کاربری خود شوید.
۲. روی گزینه edit this submission کلیک کنید
۳. در فیلد مربوطه (اگر برای ارائه انتخاب شدید، در فیلد اول و اگر برای پوستر پذیرش شده اید روی فیلد دوم) فایل خود را اپلود نمایید.
۴. در نهایت روی Update کلیک فرمایید

🔴
برنامه سخنرانی های دومین همایش بین المللی و یازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران

۹ و ۱۰ اسفند

از ساعت ۸ صبح الی ۶ بعد از ظهر

امشب آخرین مهلت برای ثبت‌نام آنلاین می باشد.
کسانی که مایل به حضور آنلاین هستند، در اسرع وقت خواهشمندیم ثبت‌نام بفرمایند.

🎙 سخنرانان کلیدی همایش ICB11

👤 Ali Sharifi-Zarchi

Assistant Prof. of Bioinformatics, Computer Engineering Department, Sharif University of Technology

🔹 Ph.D. of Bioinformatics, Institute of Biophysics & Biochemistry, University of Tehran, 2007-2015

🔸 Chair of Host Scientific Committee, International Olympiad in Informatics (IOI), Tehran, 2017
🔸 Associate of Bioinformatics, Chitsaz Lab, Computer Science Department, Colorado State University 2014-2016
🔸 Member of iPS & Epigenetic Reprogramming lab, Department of Stem Cells, Royan Institute,2011-2014
🔸 Member of the Board of Directors and Treasurer of the Iranian Bioinformatics Society,2016
🔸 Bioinformatics Researcher, Royan Institute, 2014


📄 Research interests:
Genetics, Next Generation Sequencing, Bioinformatics, and Epigenetics
Personal pages:
LinkedIn
Google Scholar
ResearchGate

دومین دوره بین المللی و یازدهمین دوره ملی بیوانفورماتیک ایران
در حال برگزاری ست