💭 سلسله جلسات بایوگپ(BioGap)

در اولین جلسه بایوگپ امسال، میزبان دکتر فرشید نوربخش و دکتر محمد کرامتی پور هستیم.

در این جلسه با هدف بررسی «جایگاه تکنولوژی ‌های نوین در تحقیقات ژنومیکس» به گفتگو با این دو استاد بزرگوار می‌پردازیم.

❗️ این جلسه در بستر اسکای روم برگزار می گردد و ورود برای عموم آزاد و رایگان است.

⏰ یکشنبه، ۲۴ دی ماه ۱۴۰۲ ساعت ۱۹

🌐 لینک جلسه:
https://www.skyroom.online/ch/ibis/biogap



@IranianBioinformaticsSociety

🎙سخنرانان کلیدی همایش ICB12

👤Laleh haghverdi

🔸 Received her PhD in Mathematics from the Technical University of Munich

🔸 Awarded the Helmholtz Doctoral Prize and Erwin Schrödinger Prize for her outstanding research in Geometric Diffusions for Reconstruction of Cell Differentiation Dynamics.

🔸 Dr. Laleh Haghverdi and her team develop efficient computational methods for analysis of large single-cell omics data sets, resolution of complex lineage trees and temporal processes, and data integration across multiple modalities.


🌐 Personal pages:
   google scholar     
   linkedln         
🌐 icb12.ibis.org.ir

📣 در آستانه دومین دور از سلسله جلسات بایوگپ، به جلسات دور اول این رویداد در سال گذشته نگاهی می‌اندازیم.

می توانید برای مشاهده فیلم این جلسات به کانال آپارات انجمن بیوانفورماتیک ایران به نشانی زیر مراجعه فرمایید.

کانال آپارات انجمن:
https://www.aparat.com/Iranian_Bioinformatics_Society

تاریخ برگزاری جلسه اول بایوگپ در سال ۱۴۰۲:

🗓یکشنبه ۲۴ام دی ماه

⏰ ساعت ۱۹

🌐 لینک جلسه:
https://www.skyroom.online/ch/ibis/biogap

حضور برای همگان رایگان و بدون نیاز به ثبت نام است.

منتظر حضور گرم شما هستیم.

@IranianBioinformaticsSociety

📢شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران(RSG-Iran) "اولین دوره‌ی باهم‌خوانی خود را  با موضوع هوش‌ مصنوعی در زیست‌شناسی و با هدف افزایش آگاهی در زمینه‌ی زیست‌شناسی محاسباتی" برگزار می‌کند.

🔵در این دوره، طی ۱۱ جلسه کتاب Deep Learning for the Life Science را که دارای ۱۲ فصل می‌باشد، با یکدیگر مطالعه خواهیم کرد و تحت نظارت سرکار خانم دکتر زهرا رضوانی (محقق پژوهشگاه دانش‌های بنیادی (IPM) و استادیار گروه علوم کامپیوتر دانشگاه الزهرا) به تبادل نظر می‌پردازیم.

🔸️برای کسب اطلاعات بیش‌تر در ارتباط با سوابق آموزش و پژوهشی ایشان، می‌توانید از صفحه گوگل اسکولار و لینکدین ایشان دیدن فرمایید.

🔹️در هر جلسه یک نفر از شرکت‌کنندگان که سابقه‌ی فعالیت در این حوزه را دارند نیز مطالب مهم آن فصل را گردآوری و ارائه خواهند کرد.

👈لینک ثبت‌نام

👈لینک دانلود کتاب

Telegram | Linkedin | Instagram

🔸محورهای همایش ICB12

🧬 Biological Sequence Analysis

🔸Definition: At the intersection of biology and computation, this field decodes genetic information in DNA, RNA, and proteins using diverse algorithms and tools.

🔸Tools: Utilizing bioinformatics databases, tools like BLAST and FASTA enable sequence comparison.

🔸Implications: Extending into medicine, evolutionary biology, and biotechnology, computational approaches have fueled targeted therapies, enhanced species evolution understanding, and advanced personalized medicine.

🔸Key Issues:

🔹RNA structure analysis and prediction
🔹Sequence comparison
🔹Global and local sequence alignment
🔹Improved database search by order
🔹Multi-sequence alignment
🔹Genomic analysis
🔹Protein structure prediction 🔹Methods for identifying distant homologues using patterns and specifications

🌐 icb12.ibis.org.ir
@IranianBioinformaticsSociety

🔰 رویدادهای انجمن بیوانفورماتیک ایران در زمستان ۱۴۰۲

🔸سلسله گفتگوهای آنلاین بایوگپ:
هر یکشنبه از ۲۴ دی ماه
به صورت مجازی و رایگان، بدون نیاز به ثبت نام

🔸سمپوزیوم دانشجویی:
از ۲۱ بهمن ماه
به صورت مجازی و نیاز به ثبت نام

🔸کارگاه AI in Bioinformatics:
۸ اسفند ماه
مخصوص شرکت کنندگان حضوری در کنفرانس بین‌المللی بیوانفورماتیک ایران و به صورت رایگان

🔸کنفرانس بین‌المللی بیوانفورماتیک ایران (ICB12):
۹ و ۱۰ اسفند ماه
به صورت حضوری و مجازی، نیاز به ثبت نام

جزییات بیشتر هر یک از رویدادها به زودی در صفحات شبکه‌های اجتماعی انجمن بیوانفورماتیک ایران اطلاع‌رسانی خواهد شد.


⏱ آخرین مهلت ارسال مقالات همایش: ۱۵ بهمن ۱۴۰۲

@IranianBioinformaticsSociety

💭 سلسله جلسات بایوگپ(BioGap)

در دومین جلسه بایوگپ امسال، میزبان دکتر مهدی صادقی و دکتر کاوه کاوسی هستیم.

در این جلسه با هدف بررسی «رویکرد داده محور و فرضیه محور در تحقیقات و حل مسئله» به گفتگو با این دو استاد بزرگوار می‌پردازیم.

❗️ این جلسه در بستر اسکای روم برگزار می گردد و ورود برای عموم آزاد و رایگان است.

⏰ یکشنبه، ۱ بهمن ماه ۱۴۰۲ ساعت ۱۹

🌐 لینک جلسه:
https://www.skyroom.online/ch/ibis/biogap



@IranianBioinformaticsSociety

📌 شرح جلسه:

در گذشته نه چندان دور، روال انجام یک تحقیق بر این بود که محقق با توجه با دانش و مشاهدات خود فرضیه‌ای را در نظر بگیرد و با توجه به امکانات موجود آزمایش‌هایی جهت بررسی آن فرضیه طراحی و برای تایید یا رد آن مشاهده و داده جمع آوری کند و به تحلیل آن بپردازد.
امروزه حجم زیادی داده در حوزه های گوناگون در دسترس محققان قرار گرفته است. سهولت به کارگیری و پیاده سازی انواع روش های تحلیلی منجر شده که تمرکز خیل عظیمی از محققان از همان ابتدا بر داده باشد و انتخاب یا جمع آوری داده بر طرح سوال و فرضیه اولویت پیدا کند.

در این جلسه با حضور دو استاد گرانقدر جناب دکتر مهدی صادقی و جناب دکتر کاوه کاوسی به نقد و بررسی این امر و محاسن و معایب هر دو دیدگاه خواهیم پرداخت.

🗓 زمان: یکشنبه ۱ بهمن ۱۴۰۲

⏰ ساعت: ۱۹

🌐 لینک جلسه:
https://www.skyroom.online/ch/ibis/biogap

@IranianBioinformaticsSociety

📌 فراخوان بزرگ انجمن بیوانفورماتیک ایران

🔸انجمن بیوانفورماتیک ایران در راستای تشکیل شاخه دانشجویی برای توسعه و گسترش فعالیت‌های خود و ایجاد فرصت‌های آموزشی و پژوهشی برای جامعه علمی کشور، از میان دانشجویان مستعد و علاقه‌مند، دانشجو هایی را در کنار خود داشته باشد.

🔹از این رو، از دانشجویان رشته ها و گرایش های مرتبط با بیوانفورماتیک، خصوصا (علوم کامپیوتر، آمار، مهندسی کامپیوتر، زیست‌شناسی، بیوتکنولوژی، پزشکی و فارماکولوژی و ...) دعوت می شود در صورت تمایل به عضویت به عنوان
عضو کمیته دانشجویی در انجمن بیوانفورماتیک ایران،
نسبت به تکمیل این فرم اقدام نمایند.

با تشکر
شاخه دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران

شبکه های اجتماعی انجمن:

🔗تلگرام
🔗لینکداین
🔗اینستاگرام

@IranianBioinformaticsSociety

✳ انجمن بیوانفورماتیک ایران و آزمایشگاه سیستم های زیستی پیچیده و بیوانفورماتیک دانشگاه تهران با همکاری پژوهشکده هماتولوژی، انکولوژی، و سل تراپی دانشگاه علوم پزشکی تهران و مدیریت امور پژوهشی و مرکز مطالعات و توسعه آموزش پزشکی دانشگاه علوم پزشکی هوشمند برگزار می کند.

🌐 ثبت نام از طریق:
https://evnd.co/z6P7O


📱 جهت کسب اطلاعات بیشتر با شماره 09202407110 تماس بگیرید.

@IranianBioinformaticsSociety

🧬 سومین همایش بین‌المللی و دوازدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران برگزار می‌کند.

🔸 کارگاه تخصصی هوش مصنوعی در بیوانفورماتیک
🔸 به صورت حضوری توسط اساتید برجسته

🗓 زمان: سه شنبه، هشتم اسفند‌ماه

🏢 دانشگاه علم و فناوری - بهشهر

🔖 با اعطای گواهینامه معتبر

🌐 اطلاعات بیشتر در سایت همایش بیوانفورماتیک ایران:

https://icb12.ibis.org.ir/workshop/

@IranianBioinformaticsSociety

💭 سلسله جلسات بایوگپ(BioGap)

در سومین جلسه بایوگپ امسال، میزبان دکتر فاطمه زارع و دکتر غلامرضا رکنی هستیم.

در این جلسه با هدف نقد و بررسی «دو رویکرد یادگیری ماشین و مدلسازی سیستم های دینامیکی در حوزه های زیستی» به گفتگو با این دو استاد بزرگوار می‌پردازیم.

❗️ این جلسه در بستر اسکای روم برگزار می گردد و ورود برای عموم آزاد و رایگان است.

⏰ یکشنبه، ۸ بهمن ماه ۱۴۰۲ ساعت ۱۹

🌐 لینک جلسه:
https://www.skyroom.online/ch/ibis/biogap



@IranianBioinformaticsSociety

🎙سخنرانان کلیدی همایش ICB12

👤Dr. Syed Haider

🔸 Dr. Syed Haider has been leading the Breast Cancer Research Bioinformatics Group at The Institute of Cancer Research in London since November 2016.

🔸 His team utilizes bioinformatics and machine learning to pinpoint therapeutic vulnerabilities and biomarkers in breast cancer.

🔸 Previously, he played pivotal roles at the University of Oxford and the Ontario Institute for Cancer Research, making significant contributions to the field of oncology.

🔸 Dr. Haider's expertise lies in developing computational approaches for discovering target genes and biomarkers related to breast cancer risk.

🔸 His work reflects a commitment to advancing our understanding of breast cancer through cutting-edge research.

🌐 Personal pages: google scholar
🌐 icb12.ibis.org.ir

✏️  دومین سمپوزیوم دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران

این سمپوزیوم با هدف ایجاد آشنایی اولیه برای شرکت‌کنندگان، به صورت ورکشاپ‌های سه ساعته آنلاین از ۲۳ بهمن تا ۲۷ بهمن ۱۴۰۲ به صورت جلسات شبانه برگزار خواهد شد.



🔹با اعطای گواهینامه معتبر
🔸هزینه ثبت نام در هر کارگاه: ۲۰۰ هزار تومان
🔹 امکان ثبت نام در هر  کارگاه به صورت جداگانه

@IranianBioinformaticsSociety
@CBRC_aut

🔸دومین سمپوزیوم دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران

✏️ Molecular Docking and Virtual Screening in Drug Discovery: A Hands-On Approach


📝خلاصه ارائه:
این ارائه یک رویکرد سیستماتیک برای طراحی دارو به روش Rigid Docking با استفاده از دو نرم افزار Molegro و Avogadro معرفی می‌کند و در آن پس از بیان و مرور پیش‌زمینه های مورد نیاز به شکل عملی یک دارو برای ویروس SARS-COV2 معرفی خواهیم کرد که طبق مراحل زیر خواهد بود:

• آماده سازی
• اجرای Docking
• بررسی و آنالیز نتایج
• بازخورد گرفتن و اصلاح داروهای احتمالی

👤توسط: مسعود مهدوی‌فر، دانشجوی کارشناسی ارشد دانشگاه صنعتی امیرکبیر

📅 زمان: ۲۳ بهمن ۱۴۰۲، ساعت ۱۷ الی ۲۰
هزینه: ۲۰۰ هزار تومان

🔸با ارائه مدرک معتبر پس از پایان سمپوزیوم

🔹ثبت‌نام ازطریق لینک

@IranianBioinformaticsSociety
@CBRC_AUT

📣 تنها ۵ روز تا پایان مهلت ارسال چکیده مقالات باقی مانده است.

⏳ مهلت ارسال: ۱۵ بهمن ماه ۱۴۰۲

جهت اطلاعات بیشتر به سایت همایش مراجعه فرمایید:
🌐 icb12.ibis.org.ir

🔸دومین سمپوزیوم دانشجویی انجمن بیوانفورماتیک ایران

✏️ Molecular dynamics simulation using VMD and NAMD


📝خلاصه ارائه:

آشنایی اولیه با نرم افزار VMD و NAMD .

آشنایی با سایت rcsb.org  و دیتا بیس PDB .

آشنایی با انواع فایلهای ساختاری pdb و topology  و ...

نمایش انواع مولکولها در VMD .

ساخت فایل PSF برای پروتیین و لیگاند‌ توسط نرم افزار VMD و سایت  CHARMM-GUI.ORG.

آشنایی با دینامیک مولکولی و نحوه ی محاسبه ی واکنشهای بین مولکولی توسط نرم افزار NAMD .

آنالیز خروجی های NAMD و نیروهای بین مولکولی.

در این کارگاه سعی شده موارد فوق برای پروتیین های غشایی ویروس COVID-19 و لیگاندهای مختلف، بررسی شود.

👤توسط:نوید وزیری‌نسب، دانشجوی کارشناسی ارشد دانشگاه صنعتی امیرکبیر

📅 زمان: ۲۴ بهمن ۱۴۰۲، ساعت ۱۷ الی ۲۰
هزینه: ۲۰۰ هزار تومان

🔸با ارائه مدرک معتبر پس از پایان سمپوزیوم

🔹ثبت‌نام ازطریق لینک

@IranianBioinformaticsSociety
@CBRC_AUT

🎙سخنرانان کلیدی همایش ICB12

👤Dr. Jamshid Pirgazi

🔸Professor of Artificial Intelligence University of Science and Technology of Mazandaran

🔸Dr. Jamshid Pirgazi heads the Machine Learning Research Lab at the University of Science and Technology of Mazandaran.

🔸Dr. Jamshid Pirgezi has done extensive research in the field of DTI drug-target prediction analysis.

🔸Specializes in Bioinformatics, Deep Learning, Machine Learning, Transformers, and Pattern Recognition

🌐 Personal pages:
google scholar
linkedin
🌐 icb12.ibis.org.ir

💭 سلسله جلسات بایوگپ(BioGap)

در چهارمین و آخرین جلسه بایوگپ امسال، میزبان دکتر چنگیز اصلاحچی و دکتر سجاد قرقانی هستیم.

در این جلسه با هدف نقد و بررسی «طراحی دارو و پزشکی دقیق» به گفتگو با این دو استاد بزرگوار می‌پردازیم.

❗️ این جلسه در بستر اسکای روم برگزار می گردد و ورود برای عموم آزاد و رایگان است.

⏰ دوشنبه، ۱۶ بهمن ماه ۱۴۰۲ ساعت ۱۹

🌐 لینک جلسه:
https://www.skyroom.online/ch/ibis/biogap



@IranianBioinformaticsSociety