Чем бы вы ни занимались, с единомышленниками это делать гораздо легче и приятнее. Увлечённые наукой могут найти их в сообществе Биомедсходка

💡 Живые встречи в Москве и лекции на стыке биологии и медицины
🎙 Открытые обсуждения, где каждый может высказаться — от новичков до экспертов
🎉 Мемы, научные посты, интервью и всё, что помогает молодым ученым двигаться вперед

Здесь можно (и даже нужно):
— Найти единомышленников
— Поделиться своими научными открытиями и задать самые острые вопросы
— Прийти на встречи и обсудить всё — от грантов до любимых настолок!

Становитесь частью Биомедсходки!💥

Уже несколько лет у меня в списке для чтения лежал обзор влияния кофе на здоровье. Не мог добраться до него отчасти потому что и так много читаю по работе, а отчасти потому что боялся, что с таким потреблением кофе увижу в тексте „вам осталось жить 7 дней“. Когда услышал про ИИ-тул для превращения документов в подкасты, решил попробовать закинуть обзор туда. Результат невероятно понравился: подкаст, основанный на загруженном материале, с приятными ведущими, живым языком и даже играми слов. Совершенно не верится, что это сгенерировано. Прикрепил к посту – рекомендую. Для сравнения я также послушал подкаст на похожую тему от какого-то кожаного мешка и чуть не уснул, а также всё время казалось, что автор берёт факты из головы, а не из научных источников

Сперва подумалось, что ИИ придумал информацию, слишком уж это хорошо звучало. Но прочитав затем обзор (кстати, после подкаста это делать значительно проще), оказалось, что кофе действительно чаще связывают с положительными эффектами на здоровье. Авторы проанализировали 201 мета-анализ наблюдательных исследований (когда у людей просто собирали статистику по выпитому кофе и здоровью) и 17 мета-анализов с рандомизированными исследованиями (когда участников разделённых случайным образом просили пить определённое количество кофе и смотрели как это изменяет их здоровье). Суммарно это данные по более чем миллиону людей изо всех частей света. Потребление кофе оказалось связано с:
☕️ Меньшим риском смерти от всех причин
☕️ Сниженным риском сердечно-сосудистых заболеваний и смерти от них
☕️ Меньшим риском различных раков
☕️ Сниженным риском диабета II типа
☕️ Пониженным риском заболеваний печени
☕️ Сниженным риском болезней Паркинсона и Альцгеймера, а также депрессии

Большая доза кофе как правило усиливала эти эффекты, но не далее 3-4 чашек в день

Негативные эффекты в основном касаются беременных: у них есть риск рождения ребёнка с меньшим весом и повышенный риск прерывания беременности. Также у потребляющих кофе женщин в целом наблюдалось больше переломов. В остальном авторы осторожно говорят, что кофе выглядит полезным, но призывают к дальнейшим исследованиям с лучшей рандомизацией

Так что получается, моё guilty pleasure всё это время было здоровым образом жизни?

#медицина #статистика

„Гены, мемы – что-то про биологию поют“: подумал было я. Оказывается, ни про то, ни про другое речи не шло. Вот такие ложные друзья переводчика не знающего язык

#лингвистика

Королевы муравьёв удивляют даже больше, чем птицы. Рекордсменка вида чёрных садовых муравьёв Lasius Niger прожила в лаборатории почти 29 лет. За это время она могла бы закончить школу, университет, получить научную степень, стать гордой матерью миллионов детей и отправить их создавать новые колонии на полученный материнский капитал

В дикой среде матки этого вида живут меньше, но тоже впечатляюще долго: 12-20 лет. А для королев вида американских муравьёв-жнецов Pogonomyrmex owyheei максимальная продолжительность жизни в природе оценивалась в 30 лет

На фото – крылатая самка вида Lasius Niger. Позже, после брачного лёта, они отбрасывают крылья и становятся королевами. А в этой стадии их иногда называют „принцессами“

#биология

Рекламная политика

Вы могли заметить, что в канале регулярно появляется реклама. Думаю, вы примерно поняли её характер и частоту, но важно явно проговорить правила, чтобы быть прозрачным для подписчиков и рекламодателей

Подписчикам
Я не считаю, что реклама – это плохо. Если благодаря ней вы нашли полезный курс, интересный канал или даже стажировку, узнали об особенностях научного пути у девушек или получили крутую футболку, поддержав журнал, думаю, это выигрыш для всех. Но реклама может быть плохой. Судя по вашим реакциям, мне удаётся сделать её интересной и релевантной или по крайней мере не раздражающей. Спасибо вам за тёплые отклики!

Большая часть рекламы на данный момент не оплачивается. В какой-то момент это может измениться, но подход останется тем же. Я не буду рекламировать то, что идёт в разрез с моим мироощущением, ценностями или попросту мне не нравится. Поэтому воспринимайте рекламу как личную рекомендацию. Часто я получаю за неё взаимные репосты, реже – деньги, но никогда ни за то, ни за другое, ни за что-то третье не буду рекламировать чушь. Каждый канал, который я рекомендовал, я на самом деле читаю или читал бы. Несколько раз здесь были ссылки на краудфандинговые кампании и я поддержал их все своими деньгами. Каждая ссылка прошла мой внутренний фильтр кринжа. Если он не совпадает с вашим – извините

Кроме того, мне неловко, если реклама (даже хорошего) висит первым постом в канале больше суток, поэтому я всегда стараюсь опубликовать авторский пост на следующий день. Так что считайте рекламные посты ещё и обещанием контента 🙂

Рекламные посты будут выходить не чаще раза в неделю, около выходных дней. В исключительных случаях – например, когда попросили рассказать об очень скором мероприятии – постов в неделю может быть больше, чем один, но тогда обещаю больше контента

Рекламодателям
Если вы хотите разместить информацию о вас в канале, напишите в личку. Правила следующие:
• Это должно быть связано с наукой или образованием или интересно увлечённым ими людям. Здешняя аудитория, в основном, состоит из людей связанных с биологией или точными науками
• Реклама висит в топе минимум 24 часа и не удаляется в будущем. Исключение из последнего – если рекламируемое мероприятие уже прошло и пост больше не актуален
• Возможно платное размещение или взаимный пиар
• Тексты постов я пишу самостоятельно. Вы можете предоставить шаблон или желаемую для упоминания информацию, но будьте готовы, что текст будет отредактирован (опубликован, конечно, только после согласования с вами)
• Я оставляю за собой право отказать в публикации рекламы, тогда её невозможно разместить даже за оплату

Отдельно про взаимный пиар: не стесняйтесь предлагать обменяться постами, даже если ваш канал совсем небольшой. Если он мне понравится и покажется интересным подписчикам, я буду рад его порекомендовать 🙂 Этот канал вырос во многом благодаря безвоздмездным упоминаниям от других, значительно более крупных блогов. Пользуясь случаем, передаю огромные благодарности Типичному математику, Эльмире и Институту биоинформатики

Людей иногда раздражают современные феминитивы. Но при этом в русском существует и используется слово «рекордсменка» и никого это не смущает. Посмотрите на него, оно же абсурдное!

Кстати, «рекордсмен» – это псевдоанглицизм. В словарях это слово объясняется через английские корни, но в самом английском его не существует. Если вы вобьёте в поисковик «records man» – неважно с пробелом или без – вам скорее выпадут результаты про музыкальные записи (records) или названия российских компаний. Спортсменов (кстати, тоже не самое популярное в английском слово) так найти не удастся

#лингвистика

Порой хочется ездить по миру и читать красивые лекции о том, как прекрасна наука и какие крутые у неё достижения в настоящем и прошлом. Это тоже важная и сложная работа, но куда более простая, чем занятие наукой. Процесс получения открытий выглядит значительно менее понятно, стройно и красиво

Но гораздо интереснее

Ещё подборка страшных историй из мира науки к Хэллоуину

🪦 Одна аспирантка не ладила с руководителем. До драк, как в историях из комментариев к прошлому посту, дело не доходило, но работать вместе было уже невыносимо. Грела только одна мысль: скоро конец аспирантуры и можно перейти в более приятную атмосферу на постдока. Но вот загвоздка: для этого нужно попросить руководителя написать рекомендательное письмо. Собрав волю в кулак, девушка улыбнулась и попросила отправить письмо в лабораторию мечты в благодарность за годы её работы. Руководитель написал в письме три слова: «Не берите её»

⚰️ Другой студент, с ужасом вспоминающий прошлую лабораторию, рассказал, что даже этому руководителю есть куда стремиться. Злопамятный заведующий из его лаборатории очень не любил „студентов-предателей“, не готовых работать в одном месте до пенсии. Он выслеживал своих бывших сотрудников, находил контакты их новых руководителей и писал им письма с просьбой уволить человека или как минимум ему не доверять

📑 Неизведанные области знания не пугают, а порой и восхищают учёных. Но даже лучших из них доводит до ужаса другой зверь – бюрократия. PhD-студентке из России в одном из университетов Германии почему-то не хотели давать контракт на весь период работы. Вместо этого его приходилось обновлять каждые пол года. Из-за этого право на нахождение в стране тоже приходилось каждый раз обновлять, а это время, куча бумаг и оплата процедур – около 100 евро. Из-за такого отношения и других проблем студентка решила уйти в другое место. Это тоже требовало времени на поиск работы и, вероятно, переезда. В Германии этот период обычно оплачивается государством, для этого нужно только проработать хотя бы год. Студентка работала дольше, но бюрократия нанесла новый удар: в контракте было прописано время на две недели меньше полного года, и страховку по безработице платить отказались. Впрочем, после таскания пачек бумаг девушка стала натренирована, обратилась в суд и доказала своё право на страховку, а также получила компенсацию от университета в добавок

⌛️Эти истории – скорее исключение, большинство лабораторий всё же вполне нормальные. Но в некоторых странах „нормальная“ рабочая культура – совершенно нечеловеческая. Девушка, стажировавшаяся в Японии, рассказывала, что у её руководителя был 18-часовой рабочий день. Он вставал, ехал на работу, завтракал, обедал и ужинал прямо на рабочем месте у экрана компьютера, вечером принимал душ, ехал спать около 5 часов и по новой. Без выходных и праздников

🙏Тогда эта девушка тоже была сфокусирована на работе, хоть и не по 18 часов в день. Времени учить язык или исследовать страну почти не было. Каждое утро она приходила на работу и приветствовала коллег-японцев фразой „Оригато“. Лишь спустя несколько недель она осознала, что это „Спасибо“, а не приветствие и поняла, почему коллеги так удивлялись. А японский этикет не позволял им поправить ошибку

А какие страшные истории знаете вы? 🎃

#байки

Заметил, что в разных лабораториях по-разному относятся к результатам. В одних, если статистика выдаёт красивый результат, сразу радуются и бегут писать публикацию. Только надо выбрать график, получше подчёркивающий крошечные отличия, и молиться, что ревьюеры не придерутся к этому месту статьи

В других, даже если результат выглядит очень красиво, сомневаются, правда ли это, и стараются найти подтверждения и опровержения в похожих данных или литературе (а также неплохо бы проверить код на баги)

Не знаю как назвать такие типы. Плохой/хороший было бы неверно: в лабораториях с первым подходом тоже порой делают отличную науку, хоть и не со стороны статистики. Но работать я предпочту во вторых

На выходных отдыхал от науки в горах, но всё равно получился научпоп-контент. Почитать можно тут. Видео мои, но описания эффектов даёт профессионал

#физика@chelovek_nauk

Хотите, чтобы у ребёнка был меньше риск астмы? Возможно, ему нужно употреблять фермерскую пыль

На конференции исследователей лёгких узнал любопытный факт: дети, выросшие на молочных фермах, обладают меньшим риском астмы (уточнение: я видел только данные по США, Австрии и Германии, не уверен, что это работает в любой стране). Учёные старались понять, что именно за это отвечает: например, исследовали связь деревенского необработанного молока с частотой заболеваемости. В итоге круг подозреваемых сузился до пыли из коровьего хлева: её вдыхание снижает риск астмы и у мышей. Учёные стараются понять, какие именно вещества связаны с таким эффектом, чтобы на их основе разработать вакцины

Это любопытно по нескольким причинам. Многие лекарства вдохновлены природой, зачастую – растениями, которые люди традиционно использовали для лечения. Это не значит, что нужно лечиться травками, напротив. Если какое-то растение обладает целебным эффектом, фармкомпании уже давно выделили из него действующее вещество, а затем изучили его влияние на куче животных и тысячах людей. Так можно понять, в каких дозах и при каком режиме приёма лекарство является безопасным и наиболее эффективным. Лечась методами традиционной медицины, вы в лучшем случае получите то же самое вещество, но в абсолютно случайной дозировке (растения – не самая стандартизированная фабрика). В худшем же случае можно себе навредить, потому что бабка-знахарка, конечно, звучит уверенно, но вряд ли делает выводы на основе тысяч стандартизированных наблюдений по пациентам со многих стран, а растения содержат ещё кучу всего помимо действующего вещества. Не обязательно полезного

Интересно, что целебных трав в любой культуре довольно много. Но кому придёт в голову, что для здоровья хорошо бы дышать пылью из хлева? Наука позволяет найти такие и ещё более неожиданные ассоциации

#медицина@chelovek_nauk #биология@chelovek_nauk

В университетское время я вёл список программ по биоинформатике в России. На тот момент это было не сложно: таких программ мне было известно всего 5, из которых 3 требовали бы переезда в столичные города. Рад видеть, что с каждым годом возможностей для обучения становится всё больше от университетов со всей страны

В рамках программы „Цифровая кафедра“ Новосибирского государственного университета студенты любого вуза РФ 2-6 курсов, а также магистранты и ординаторы могут совершенно бесплатно, в формате онлайн получить дополнительную IT-профессию. Всего 7 программ: от ИИ и базового программирования на Питоне до биоинформатики. В среднем каждый курс длится 250 часов. Это программа переподготовки, сопровождаемая официальным дипломом от НГУ

Дедлайн уже скоро – 11 ноября. Подать заявку можно здесь, а почитать больше информации – тут

Идеальный пример приложения машинного обучения к биологии. Компания Recursion разрабатывает лекарства, тестируя огромное количество химических веществ на клеточных линиях и наблюдая как клетки меняют вид под воздействием разных молекул. Раньше учёные полагались на окрашивание клеток – безумно красивый биологический метод, позволяющий по-разному окрасить органеллы: ядро, элементы клеточного скелета и другие. Однако с развитием машинного обучения оказалось, что это не обязательно. Нейросетевая модель может распознать элементы клеток по обычному изображению со светового микроскопа! Результат неотличим от применения более дорогого и сложного окрашивания клеток

Помимо экономии времени и денег на красители, это ещё и позволяет смотреть на динамику. Раньше это было невозможно: красители повреждают элементы клетки и она ведёт себя по-другому, а протокол окрашивания требует убийства и фиксации клеток

Быть может, и другие методы можно упростить

#биология@chelovek_nauk #програмирование@chelovek_nauk

Недавно у нас были посты с упоминанием Ричарда Фейнмана (вот этот и ещё один). А давайте разыграем его книгу! Хотелось бы, конечно, „В Туву любой ценой“, но её оказалось не так просто найти. Оставим на попозже (напишите, если знаете, где её достать), а пока начнём с классики – „Вы, конечно, шутите, мистер Фейнман“

Это захватывающая автобиография невероятной жизни учёного: от работы над созданием ядерной бомбы до распутывания загадки взорвавшегося космического шаттла. Я люблю эту книгу не только за удивительный жизненный путь автора и юмор, сопровождавший каждый её этап, но и потому что она содержит советы, которые вполне применимы для современных учёных из любой области

Условия розыгрыша просты: нужно быть подписчиком канала и оставить комментарий. Но не простой! Нужно придумать перевёрнутое слово для русского языка подобно тому как это делают французы в своём сленге. 1 декабря автор случайного комментария станет счастливым обладателем книги, а самые интересные слова попадут в пост

#конкурсы@chelovek_nauk

Когда-нибудь привыкну к этим курящим мышам, но пока всё ещё смешно. Извиняюсь за качество, это скриншот слайда

#биология@chelovek_nauk

Подборка постов за октябрь!

Последнее приключение Ричарда Фейнмана и история, ради раскопки которой стоило вести этот канал:
🗺 В Туву любой ценой!

Чудесные макро- и микро-миры
🦅 Птицы-долгожители
🐜 Будьте вежливы! Уступайте места пожилым, беременным королевам муравьев с детьми!
🍜 Таких супов вы точно не ели!
🍸 Два фаго-коктейля, пожалуйста!

Что расскажет нам статистика
🪄 Странные, но такое красивые UMAPы
💻 Машинное обучение: когда статистики недостаточно

О вечном, о кофе
☕️ Подкаст "О влиянии кофе" или "Сколько вам осталось"
👨‍⚕️ Несколько причин полюбить кофе

Истории:
🎃 Хэллоуинская подборка страшилок из мира науки

Лингвистическое
🇫🇷 Крутой способ шифрования из французского сленга
📉 Великий и могучий русский язык
🤾‍♀️ Феминитивы и псевдоанглицизмы
🧬 Песня не про гены и мемы

Мемы:
Научпоп, образование и наука

Читатели этих постов без труда смогут поучаствовать в розыгрыше книги!

#подборки@chelovek_nauk

В лекции я приводил несколько примеров, когда статистика формально даёт „значимый“ результат, позволяя делать выводы, но практически в этом очень мало пользы. Вот реальный случай из статьи. Меня зацепил заголовок, да и введение было интересно читать: авторы рассуждают об индивидуальной восприимчивости лекарств и как связать её с генетикой через так называемые „фармакогены“. При помощи анализа таких генов может получиться предсказывать ответ на лекарство у конкретного человека и улучшить терапию. „Наш анализ выявил множество интересных открытий“, – пишут авторы

Но затем я дочитал до иллюстрации и ужаснулся. „Открытия“, сделанные авторами, формально верны. Например, статистика говорит, что на графиках снизу линия, описывающая вариативность экспрессии фармакогенов между разными клетками и у разных людей, не горизонтальна. Но насколько такая связь практически значима?

Честь авторам за то, что они не стали прятать данные и показали основания выводов. Но статью читать я дальше не стал

#статистика@chelovek_nauk