🤖 نقش هوش مصنوعی "Generative AI" در طراحی مولکول‌های زیستی

🌱 هوش مصنوعی تولیدی در زیست‌فناوری به‌طور گسترده توسط شرکت‌های پیش رو آمریکایی مانند "DeepMind" و "OpenAI" توسعه یافته است؛ این سیستم‌ از الگوریتم‌های یادگیری عمیق مانند مدل‌های ترنسفورمر و شبکه‌های مولد (GANs) استفاده می‌کند.

🤔 اما این هوش مصنوعی چه کارهایی از دستش برمی‌آید؟

🌟 این هوش مصنوعی، قابلیت‌های جالبی دارد مانند طراحی داروهای هوشمند و پروتئین‌های ضدسرطان با دقت بالا، ساخت آنزیم‌های تجزیه‌کننده پلاستیک و سوخت‌های زیستی، تولید ویروس‌های مصنوعی برای انتقال ایمن دارو.

✨ این هوش مصنوعی طراحی‌ها را در چند ساعت انجام می‌دهد، درحالی‌که طبیعت، درطی چند میلیون سال این کار را انجام می‌دهد. این هوش مصنوعی حتی هزینه‌های تحقیقاتی را چند برابر کاهش می‌دهد!

🪫 با تمام این مزایا، چالش‌هایی هم وجود دارد؛ مثل احتمال ساخت موجودات زنده‌ای که خارج از کنترل انسان باشند. از نگاه آینده‌پژوهی، این فناوری می‌تواند تحولی عظیم در پزشکی و زیست‌فناوری ایجاد کند، اما پیشرفت در این حوزه حتماً نیازمند قوانین سخت‌گیرانه و چارچوب‌های ایمنی دقیق هست.

💡 source

✍🏻 آریا دهنوی

「#بیوانفورماتیک #دانستنی #هوش_مصنوعی」


╠ Σ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ Σ @ir_bioinf_group

❄️ کشف توانایی‌های نهفته پروتئین‌های تغییر شکل‌‌‌دهنده در سرما

🔬 محققان دریافته‌اند که دمای سرد می‌تواند باعث فعال شدن توانایی‌های پنهان پروتئین‌های تغییر شکل‌ دهنده شود. این پروتئین‌ها که در پاسخ به شرایط محیطی، ساختار خود را تغییر می‌دهند، در دماهای پایین رفتارهای متفاوتی از خود نشان می‌دهند که پیش‌تر ناشناخته بودند.

🧊 این یافته می‌تواند درک ما از عملکرد پروتئین‌ها در شرایط سخت مانند یخ‌زدگی یا محیط‌های قطبی را بهبود دهد و کاربردهای مهمی در پزشکی، زیست‌فناوری و تحقیق روی حیات در شرایط غیرعادی داشته باشد.

✍🏻 فاطمه داورزنی

「#بیوانفورماتیک #پروتئین #خبر」


╠ Σ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ Σ @ir_bioinf_group

⭕️ وبینار رایگان معرفی رویداد Cancer Biotalent🎗️

🔺با توجه به خلاقانه و نو بودن رویداد بایوتلنت، سوالات بسیاری در خصوص روند برگزاری، فرآیند داوری، اهمیت شرکت در رویداد و مهم‌تر از همه اتفاقاتی که در این رویداد رقم خواهد خورد، برای بیشتر شما مخاطبان عزیز پیش آمده است.

🔻به همین منظور، این وبینار با حضور ارکان برگزار کننده رویداد ملی Cancer Biotalent، تدارک دیده شد تا سوالات شما پیرامون این رویداد ملی، پاسخ داده شود.

🌐 جهت ثبت‌نام وبینار، روی لینک زیر کلیک کنید.👇🏻

📲 ثبت‌نام وبینار

اینستاگرام | تلگرام | لینکدین | درباره ما

┏━━━━━━ 
     🆔 @UIBiologists🌱💡 
┗━━━━━━

💻 یک مدل پایه بینایی-زبان برای آنکولوژی دقیق

✅ تصمیم‌گیری بالینی توسط پزشکان به‌وسیله یادداشت‌های بالینی و اطلاعات پاتولوژیک صورت می‌گیرد. رویکردهای هوش مصنوعی که می‌توانند به‌طور مؤثر داده‌های چندوجهی را باهم ادغام کنند، باعث پیشرفت قابل توجهی در مراقبت‌های بالینی می‌شوند.

👩🏻‍🔬 به‌تازگی محققان یک ترانسفورماتور چندوجهی را با مدل‌سازی یکپارچه maSKed" (MUSK)" توسعه داده‌اند که یک مدل پایه بینایی-زبان است که برای استفاده از داده‌های تصویری و متن در مقیاس بزرگ توسعه داده شده است.

👩‍💻 هوش مصنوعی "MUSK" عملکرد قوی در پیش‌بینی نتیجه، ازجمله پیش‌بینی عود ملانوم، پیش‌بینی سرطان پانکراس و پیش‌بینی پاسخ ایمونوتراپی در سرطان‌های ریه، معده و مری را نشان می‌دهد.

❇️ همچنین این مدل هوش مصنوعی به‌طور مؤثری اطلاعات تکمیلی را از تصاویر آسیب‌شناسی و گزارش‌های بالینی ترکیب می‌کند و به‌طور بالقوه می‌تواند تشخیص و دقت در درمان سرطان را بهبود بخشد.

✍🏻 سهیلا سلحشورفرد

「#بیوانفورماتیک #یادگیری_ماشین  #هوش_مصنوعی #خبر」

╠ Σ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ Σ @ir_bioinf_group

🧬 دی‌ان‌ای دیزاین: ابزار وب برای طراحی و تحلیل DNA

🩺 دی‌ان‌ای دیزاین، یک ابزار تحت وب برای بررسی تعاملات پروتئین-DNA است که برخلاف روش‌های سنتی، علاوه‌بر تغییرات توالی، اثرات تغییرات ساختاری DNA را نیز بر اتصال فاکتورهای رونویسی (TF) تحلیل می‌کند. کاربران می‌توانند یک توالی طبیعی را وارد کرده، جهش‌های مدنظر را انتخاب کنند و تأثیر آن‌ها را بر ساختار DNA و تنظیم ژن بررسی کنند.

🧬 این ابزار از مدل یادگیری عمیق برای پیش‌بینی ویژگی‌های ساختاری DNA مانند عرض شیار کوچک (MGW) و پتانسیل الکترواستاتیکی (EP) استفاده می‌کند. همچنین، با پشتیبانی از رمزگذاری‌های مختلف توالی، تمامی جهش‌های ممکن را تولید کرده و تغییرات اتصال فاکتورهای رونویسی را نمایش می‌دهد.

🦠 برای تحلیل خوانش بازها (Base Readout)، دی‌ان‌ای دیزاین بازهای DNA را براساس گروه‌های عاملی موجود در شیارهای بزرگ و کوچک رمزگذاری کرده و تفاوت‌های موقعیتی بین توالی‌های جهش‌یافته و وحشی را مشخص می‌کند. این قابلیت‌ها، این ابزار را به گزینه‌ای کاربردی در مطالعات تنظیم ژن و زیست‌شناسی سنتزی تبدیل کرده‌اند.

✍🏻 سهیلا سلحشورفرد
🔍 مهدی احمدی‌فر

「#بیوانفورماتیک #DNA_design #خبر」

╠ Σ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ Σ @ir_bioinf_group

ثبت نام رایگان در پیام کوت شده....

💻 نقش یادگیری ماشین در تشخیص زودهنگام سرطان

🎥 ویدیوی «Explainable Machine Learning in Early Cancer Diagnosis» ارائه‌ای از Judith Cerit از دانشگاه فنی مونیخ است. این ویدیو به بررسی نقش یادگیری ماشین در تشخیص زودهنگام سرطان می‌پردازد. در این ارائه، به چگونگی استفاده از مدل‌های یادگیری ماشین برای تحلیل داده‌های پزشکی و شناسایی الگوهای مرتبط با نشانه‌های اولیه سرطان پرداخته می‌شود. همچنین، اهمیت قابل توضیح بودن این مدل‌ها برای درک بهتر تصمیم‌گیری‌های آن‌ها توسط پزشکان و افزایش اعتماد به این فناوری‌ها مورد تأکید قرار می‌گیرد.

✔️ Youtube

#بیوانفورماتیک #یادگیری_ماشین #سرطان #آینده_پزشکی #فیلم


╠ Σ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ Σ @ir_bioinf_group

🧩سلول‌های بنیادی؛ تکه‌های پازل حیات | تکه هفتم

~تقدیم شما؛ هفتمین قسمت از سری ویدئوهای آموزشی آکادمی پزشکی بازساختی ایران~

🧫🔬مهندسی بافت و پزشکی بازساختی؛ دو مسیر متفاوت اما هم‌راستا در بازسازی بافت‌ها هستند.
مهندسی بافت بیشتر به ساخت بافت‌ها و اندام‌ها در محیط آزمایشگاه می‌پردازد،
در حالی که پزشکی بازساختی، فعال‌سازی توانایی‌های درونی بدن برای ترمیم را هدف قرار می‌دهد.

《در این قسمت، به بررسی تفاوت‌ها و اصول بنیادین این دو رویکرد می‌پردازیم.》

مترجم: هانیه مرادیان
تدوین: امیر اسماعیلی

🌱منتظر قسمت‌های بعدی باشید!

◇اینستاگرام ◇تلگرام ◇لینکدین

|••آڪادمے پزشڪے بازساختے ایران••|
|••🧬@𝐼𝑟_𝑅𝑒𝑔𝑒𝑛𝑒𝑟𝑎𝑡𝑖𝑣𝑒_𝐴𝑐🩺••|

📑 ابزارهای پیشرفته مبتنی بر یادگیری عمیق برای تحقیقات متاژنومیک
◇ Cutting edge deep-learning based tools for metagenomic research◇

📄مشخصات مقاله
📘 مقدمه
🧪 روش‌‌ کار
📊 نتایج
🧐 اهمیت مطالعه این مقاله
🖇 لینک مطالعه مقاله

📍 برای دریافت مقاله به پشتیبان پیام دهید.

「#بیوانفورماتیک #یادگیری_عمیق ‌ #متاژنومیک #ریویو」

╠ Σ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ Σ @ir_bioinf_group

🤩زبان جادوئی R!

🎨با زبان R، داده‌ها را به هنر تبدیل کنید!
هر خط کد، داستانی از تحلیل و بینش را روایت می‌کند.

💯این زبان، کلید جادوگری است که می‌تواند اعداد را به داستان‌های جذاب تبدیل کند. بیایید با هم به سفر تحلیل و بصری‌سازی بپردازیم و رازهای نهفته در داده‌ها را کشف کنیم!
.
.
.
🌱@ir_biocan_magazine🌱

#جذب_همکار

📣 آکادمی بیوانفورماتیک ایران در فرآیند تولید محتوا و طراحی از بین افراد فعال و واجد شرایط نیرو جذب می‌کند.

✅ شرایط:

- داشتن وقت آزاد و کافی

- آشنایی با اصول نویسندگی علمی

- توانایی سرچ محتوای علمی مرتبط با بیوانفورماتیک

- داشتن ذهن باز و افکار نوین و خلاق جهت ایده‌پردازی

_ علاقه‌مند به یادگیری علم بیوانفورماتیک

⭐ درصورت تمایل به همکاری و داشتن شرایط فوق و بهره‌مندی از مزایا به آیدی تلگرامی زیر پیام دهید:

🆔@ir_bioinformatic_academy_admin

╠ Σ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ Σ @ir_bioinf_group

🧬 نخستین ژن‌درمانی شخصی‌سازی‌شده برای اختلال نادر در ژن CPS1

📰 در یک دستاورد علمی پیشگامانه که نتایج آن در نشریه معتبر New England Journal of Medicine منتشر شده است، پژوهشگران برای نخستین‌بار موفق به اجرای ویرایش ژنومی درون‌بدنی (in vivo genome editing) جهت درمان نوزادی مبتلا به اختلال ژنتیکی نادر در چرخه اوره شدند. این موفقیت، نقطه عطفی در توسعه روش‌های ژن‌درمانی شخصی‌سازی‌شده و پیشرفت پزشکی دقیق به شمار می‌آید.

🔬 اختلال مورد بررسی،کمبود آنزیم کاربامویل فسفات سنتتاز ۱ (CPS1 deficiency)، یکی از بیماری‌های نادر و بالقوه کشنده مرتبط با چرخه اوره است. این بیماری در اثر جهش در ژن CPS1 ایجاد می‌شود که موجب اختلال در تبدیل آمونیاک به اوره در کبد می‌گردد. در نتیجه، آمونیاک در خون تجمع یافته و ممکن است به آسیب شدید مغزی و کبدی یا حتی مرگ منجر شود.

👶 بیمار مورد مطالعه، نوزادی بود که به دلیل جهش ژنتیکی در این مسیر، توانایی طبیعی برای دفع آمونیاک را نداشت. تیم پژوهشی با بهره‌گیری از فناوری CRISPR-Cas9، نسخه‌ای اصلاح‌شده از ژن معیوب را مستقیماً به بافت کبد تزریق کردند. این مداخله موفق، منجر به بازیابی عملکرد ژن و بهبود قابل توجه وضعیت بالینی بیمار شد.

📌 این مطالعه نمونه‌ای برجسته از همگرایی فناوری‌های زیستی، ژن‌درمانی و علوم داده در راستای توسعه درمان‌های دقیق و فردمحور محسوب می‌شود. به‌کارگیری رویکرد N-of-1 (درمان بر اساس یک مورد خاص) همراه با ابزارهای بیوانفورماتیکی، افق‌های نوینی را برای درمان اختلالات ژنتیکی نادر گشوده و نویدبخش پیشرفت‌های قابل توجه در پزشکی شخصی‌سازی‌شده است.

🔗 منبع

#بیوانفورماتیک #CRISPR #پزشکی_دقیق #درمان_شخصی‌سازی‌شده #اومیکس

╠ Σ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ Σ @ir_bioinf_group

|••آڪادمے پزشڪے بازساختے ایران••|       
|••🧬@𝐼𝑟_𝑅𝑒𝑔𝑒𝑛𝑒𝑟𝑎𝑡𝑖𝑣𝑒_𝐴𝑐🩺••|

مهلت ثبت‌ ایده در رویداد بزرگ Cancer Bio Talent تا ۱۶ خردادماه تمدید شد.

🔴این مهلت به هیچ‌عنوان تمدید نخواهد شد.

محورهای کلی پذیرش ایده
1. پیشگیری و آگاه‌سازی
2. غربالگری و تشخيص
3. درمان‌های رایج و پیشرفته
4. تغذیه و درمان‌های مکمل
5. مراقبت‌های تسکینی و حمایتی
6. تحقیقات و توسعه فناوری‌های آینده

جهت کسب
۱. اطلاعات بیشتر در خصوص رویداد بایوتلنت
۲. جزئیات محورهای ثبت ایده
۳. ثبت‌ ایده
۴. ثبت‌نام حضور در رویداد

روی لینک زیر کلیک نمایید.

https://biotalentevent.ir

اینستاگرام | تلگرام | لینکدین | درباره ما

┏━━━━━━ 
     🆔 @UIBiologists🌱💡 
┗━━━━━━

💊تحول در داروسازی: پایان تست‌های حیوانی!

❌💉🐭تحقیقات اخیر نشان می‌دهد که حذف تست‌های حیوانی می‌تواند به پیشرفت‌های چشمگیری در فرآیند توسعه داروها منجر شود. این تغییر به ویژه در زمینه درمان‌های آنتی‌بادی مونوکلونال و سایر داروها با تأکید بر رفاه حیوانات و دقت علمی صورت می‌گیرد.

🔬در این راستا، سازمان غذا و داروی آمریکا (FDA) اقداماتی را برای جایگزینی روش‌های سنتی با تکنولوژی‌های نوین آغاز کرده است. پژوهشگران با استفاده از مدل‌های هوش مصنوعی، ارگانوئیدهای انسانی و سیستم‌های ارگان روی تراشه، توانسته‌اند به پیش‌بینی دقیق‌تری از اثرات داروها دست یابند.
این تحول نه تنها به ...

گردآورنده: عرفان رفیعی
نویسنده: سارا رمضانی

📌برای ادامه مطالعه این خبر جذاب و دریافت رفرنس، ما را در اینستاگرام دنبال کنید.

◇اینستاگرام ◇تلگرام ◇لینکدین

|••آڪادمے پزشڪے بازساختے ایران••|              
|••🧬@𝐼𝑟_𝑅𝑒𝑔𝑒𝑛𝑒𝑟𝑎𝑡𝑖𝑣𝑒_𝐴𝑐🩺••|

📌 ولکانو پلات (Volcano Plot)؛ ابزاری برای شناسایی تغییرات معنی‌دار در مطالعات اُمیکس

⚪️ نمودار ولکانو پلات یکی از ابزارهای تحلیلی مهم در بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی سامانه‌ای به‌شمار می‌رود که به‌ویژه در مطالعات مقایسه‌ای برای شناسایی عناصر زیستی با تغییرات آماری معنادار، از جمله در تحلیل‌های بیان ژن (مانند RNA-Seq و microarray) و پروتئومیکس، مورد استفاده قرار می‌گیرد.

🔵 همچنین این نمودار با ترسیم هم‌زمان دو شاخص کلیدی— میزان تغییر بیان (log₂ Fold Change) و اهمیت آماری (−log₁₀ p-value) — در یک نمودار دوبعدی، امکان شناسایی آسان مولکول‌هایی را فراهم می‌کند که هم از نظر میزان تغییر بیان قابل توجه‌اند و هم از نظر آماری دارای معناداری بالا هستند

✳️ مؤلفه‌های اصلی نمودار

🎯 کاربردهای تخصصی

🛠 ابزارهای متداول برای رسم Volcano Plot

🔍 در نهایت ولکانو پلات با نمایش جامع داده‌های تفاضلی، امکان تحلیل سریع و شناسایی تغییرات معنی‌دار را فراهم کرده و در غربالگری داده‌های زیستی حجیم نقش کلیدی دارد.

#VolcanoPlot#GeneExpression
#RNASeq#Proteomics

╠ Σ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ Σ @ir_bioinf_group

🔍 معرفی پایگاه داده TISIDB

🧬 پایگاه داده TISIDB یک منبع جامع و یکپارچه برای بررسی تعاملات میان تومورها و سیستم ایمنی است. این دیتابیس با ترکیب داده‌های استخراج‌شده از منابع مختلف مانند TCGA، GTEx، PubMed و سایر پایگاه‌های بیوانفورماتیکی، امکان تحلیل روابط میان ژن‌ها، سلول‌های ایمنی و ویژگی‌های توموری را فراهم می‌سازد.

🎓 این پایگاه داده به‌ویژه برای پژوهشگران فعال در حوزه‌های ایمونولوژی سرطان، بیوانفورماتیک سرطان، و طراحی ایمنوتراپی بسیار مفید است. با جستجوی یک ژن خاص، می‌توان اطلاعاتی مانند سطح بیان آن ژن در انواع سلول‌های ایمنی، ارتباط با زیرگروه‌های مختلف سرطان، شاخص‌های ایمنی (Immune Score)، نفوذ سلول‌های ایمنی و مارکرهای پیش‌آگهی را به‌دست آورد.

📊 از مهم‌ترین بخش‌های آن می‌توان به تحلیل ساب‌تایپ‌های سرطانی (Subtype)، بررسی همبستگی با نفوذ سلول‌های ایمنی و ارزیابی ارتباط با هدف‌های بالقوه ایمنی‌درمانی اشاره کرد.

🔗 آدرس پایگاه داده

#بیوانفورماتیک #ایمونولوژی_تومور
#تحلیل_ژن #TISIDB

╠ Σ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ Σ @ir_bioinf_group

🧬 چه کسانی می‌توانند در رویداد CANCER BIO TALENT شرکت کنند؟

با بیان جناب پروفسور امیرعلی حمیدیه، رئیس رویداد ملی CANCER BIO TALENT


💢 برای مشاهده ویدیو روی لینک زیر کلیک کنین.👇🏻

📣 مشاهده ویدیو

اینستاگرام | تلگرام | لینکدین | درباره ما

┏━━━━━━ 
     🆔 @UIBiologists🌱💡 
┗━━━━━━

🎯 چگونه می‌توان تعاملات مولکولی یک ژن را در یک بیماری خاص تحلیل کرد؟

🟥در زیست‌پزشکی مدرن، شناسایی تعاملات میان RNA، پروتئین و DNA برای درک بیماری‌ها و طراحی درمان‌های هدفمند اهمیت بالایی دارد. پایگاه داده RNAInter یکی از ابزارهای کلیدی در تحلیل این تعاملات است.

🧬 معرفی پایگاه RNAInter

🟦 پایگاه RNAInter یک پایگاه داده جامع و تخصصی است که به گردآوری و سازماندهی اطلاعات مربوط به تعاملات زیستی میان RNA–RNA، RNA–Protein و DNA–Protein می‌پردازد.

🔶 مهم‌ترین ویژگی‌های این پایگاه

🔷کاربرد RNAInter در تحلیل عملکرد مولکولی ژن‌ها در بیماری‌ها

🟧 استفاده از پایگاه داده RNAInter به پژوهشگران این امکان را می‌دهد تا تعاملات مولکولی یک ژن خاص را در شرایط فیزیولوژیک یا پاتولوژیک به‌دقت تحلیل کرده و نقش آن را در مسیرهای زیستی یا بیماری‌زا مشخص کنند.

#تحلیل_ژن #RNAInter
#درمان_هدفمند #تعاملات_مولکولی

╠ Σ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ Σ @ir_bioinf_group

👩‍💻با سلام و احترام خدمت همراهان گرامی آکادمی بیوانفورماتیک، در راستای ارتقای کاربردی‌بودن محتوا و پاسخ‌گویی هرچه بهتر به نیازهای آموزشی جامعه علمی، آکادمی بیوانفورماتیک ایران از دریافت پیشنهادها و درخواست‌های شما در زمینه موضوعات آموزشی و وبینارهای در دست برنامه‌ریزی، صمیمانه استقبال می‌نماید.

╠ Σ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ Σ @ir_bioinf_group

🧫آکادمی میکروب‌شناسی ایران با همراهی جمعی از متخصصان برجسته، برگزار می‌کند:

💡وبینار تخصصی فارماکومیکروبیومیکس
مرزهای نوین دانش، در تلاقی میکروبیوم، داروسازی و انکولوژی

📚 در این وبینار، نقش میکروبیوم در پاسخ دارویی، درمان سرطان و توسعه فناوری‌های نوین از جمله هوش مصنوعی مورد بررسی قرار خواهد گرفت.

📌 محورهای اصلی وبینار:
– میکروبیوم و سرطان: سیگنالوم و تارگتوم
– کنسر فارماکومیکروبیومیکس
– نقش میکروبیوم در سرطان پستان
– کاربرد هوش مصنوعی در تشخیص و درمان سرطان

👥 ویژه: دانشجویان، پژوهشگران و متخصصان حوزه‌های زیست‌پزشکی، داروسازی، ایمونولوژی، بیوانفورماتیک و انکولوژی

🗓 تاریخ برگزاری: شنبه 3 خرداد 1404
⏰ ساعت: ۱۸ تا ۲۰
📍 به‌صورت آنلاین
🎓 همراه با گواهی معتبر (50 هزار تومان)


📌جهت ثبت‌نام، از لینک زیر اقدام کنید.

💠 لینک ثبت‌نام

𓂃◌𓈒𓐍𓂃◌𓈒𓐍𓂃◌𓈒𓐍𓂃◌𓈒𓐍𓂃◌𓈒𓐍

💠 Community / Instagram / ZiLink

╭─────•⊰𓐍⊱•──────╮
 🦠@ir_micro_academy🧪
╰─────•⊰𓐍⊱•──────╯