⚡️شناسایی واریانت‌های ژنی بیماری‌زا⚡️

🧬 پایگاه داده‌ی «ClinVar» یک منبع آزاد و معتبر از مرکز NCBI است که اطلاعات بالینی مرتبط با واریانت‌های ژنی را جمع‌آوری، ویرایش و به‌روزرسانی می‌کند. این پایگاه به محققان ژنتیک، پزشکان و دانشجویان کمک می‌کند تا ارتباط بین تغییرات توالی DNA و بروز بیماری‌های ژنتیکی را بررسی کنند.

📌پایگاه «ClinVar» با گردآوری گزارش‌های معتبر از آزمایشگاه‌ها، کلینیک‌ها و پژوهش‌های علمی، بستری قوی برای تفسیر واریانت‌هایی مثل «missense» ،«nonsense» ،«indel» و «CNV» فراهم کرده‌است.

🔷 قابلیت‌های ClinVar:
1⃣ جستجوی آسان ژن، واریانت یا بیماری خاص.
2⃣ مشاهده‌ی سطح شواهد (VUS ،Benign و Pathogenic و…).
3⃣ لینک‌دهی به پایگاه‌های مکمل مانند «dbSNP» ،«OMIM» و «GeneCards».

❓شما تجربه‌ی استفاده از ClinVar برای تفسیر واریانت‌های ژنی رو داشتید؟ برامون بگید مفیدترین فیچر این پایگاه از نظر شما کدومه؟

✍🏻 نساء کارجو صدقیانی

🔗 لینک راهنما و جستجوی ClinVar:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

🎯 نئوآنتی‌ژن‌ها؛ آینده درمان سرطان

🧬 نئوآنتی‌ژن‌ها پروتئین‌های خاصی هستند که فقط روی سلول‌های سرطانی دیده می‌شوند. دانشمندان با الهام از واکسن‌های mRNA، در حال ساخت واکسن‌های ضدسرطان هستند که این نئوآنتی‌ژن‌ها را به سیستم ایمنی معرفی کنند.

⚡️ نتیجه؟ سیستم ایمنی می‌تواند سلول‌های سرطانی را در هر نقطه از بدن شناسایی و نابود کند.

🌟 این روش درمانی نوین، دقیق و کاملاً شخصی‌سازی‌شده است و آینده درمان سرطان را رقم خواهد زد.

📌 برای آشنایی با تازه‌ترین ایده‌ها و فناوری‌های ضدسرطان، حتماً دنبال کنید.

💿 همراه با زیرنویس تهیه‌شده در آکادمی بیوانفورماتیک و ژنتیک ایران


─━⊱🧬 آکادمی ژنتیک ایران
─━⊱🧬 @ir_Genetics_academy

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠  @ir_bioinf_group

🕙 فقط ۶ روز مانده تا رویداد متفاوت و جذاب CANCER BIOTALENT!


🔥در بایوتلنت قرار است اتفاق‌های جذاب و هیجان‌انگیزی را شاهد باشید:

رقابت جذاب ۱۰ تیم فینالیست برتر که در رقابتی سنگین بین ۴۸۳ تیم، به فینال راه یافتند.

🎤 ۶ بایوتلنت‌تاک ویژه با حضور اساتید برجسته و پیشکسوت حوزه سرطان و فناوران برجسته که شامل:

۲ بایوتلنت‌تاک: سرطان از نگاه آمار 📊
۳ بایوتلنت‌تاک: مسیر طی‌شده بزرگان در مسیر علم و فناوری 🚀
۱ بایوتلنت‌تاک: مسیر ساخت و تجاری‌سازی و رونمایی از داروی جدید در کشور💊

🏆 مسابقه جذاب بین مخاطبان رویداد

⚡️ ظرفیت باقی‌مانده بسیار محدود: فقط ۵۰ نفر!
🙏  منتظر حضور سبز شما هستیم.

🔗 لینک ثبت‌نام

✨ طیف گراف (Spectral Graph Theory) شاخه‌ای از ریاضیات است که گراف‌ها و شبکه‌ها را با ابزارهای جبر خطی مثل ماتریس‌ها، مقادیر ویژه و بردارهای ویژه تحلیل می‌کند.

📊 با این روش می‌توان ساختارهای پیچیده و ارتباط‌های پنهان در گراف‌ها را بهتر شناخت و حتی ویژگی‌هایی مثل میزان اتصال یا خوشه‌بندی گروه‌ها را به دست آورد.

📈 یکی از کاربردهای شناخته‌شده طیف گراف در یادگیری ماشین، خوشه‌بندی طیفی (Spectral Clustering) است که داده‌ها را بر اساس ساختار شبکه‌ای آن‌ها گروه‌بندی می‌کند.

🔹 از شبکه‌های اجتماعی و تحلیل داده‌ها گرفته تا علوم زیستی و هوش مصنوعی، این روش کمک می‌کند الگوها و روابط پنهان را به زبان ساده‌تر و قابل فهم‌تر ببینیم.

🔗 Source

💿 همراه با زیرنویس تهیه‌شده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠  @ir_bioinf_group

⚡️اجرای رایگان و سریع کدهای بیوانفورماتیک⚡️

🧬 ‌پلتفرم «Google Colab» یک پلتفرم ابری رایگان و قدرتمند است که به پژوهشگران، دانشجویان و علاقه‌مندان بیوانفورماتیک این امکان را می‌دهد تا بدون نیاز به سخت‌افزار قدرتمند، کدهای Python و R و ابزارهای omics را اجرا کنند.

📌با Colab می‌تونید از GPU/TPU رایگان گوگل برای تحلیل داده‌های پرحجم مثل «RNA-seq»، شبیه‌سازی‌های مولکولی یا مدل‌های یادگیری‌ماشین زیستی استفاده کنید.

🔷 ‌قابلیت‌های Colab برای Bioinformatics:
1⃣ پشتیبانی از نصب کتابخانه‌های تخصصی مانند Biopython ،Scanpy ،Seurat و gseapy.
2⃣ اتصال مستقیم به Google Drive برای ذخیره و بارگذاری داده‌های بزرگ.
3⃣ اجرای کدهای R و Python در یک محیط یکپارچه.
4⃣ کار با پایگاه‌های داده آنلاین (GEO ،NCBI و Ensembl)

❓شما بیشتر چه ابزارها و پکیج‌هایی رو در Colab برای تحلیل‌های omics استفاده می‌کنید؟ تجربه‌تون رو با ما به اشتراک بذارید.

✍🏻 زینب کارگر

🔗 لینک راهنمای جامع و نوت‌بوک نمونه:
https://colab.research.google.com

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

۳۰ثانیه با فایزر!⏱️ همراهمون باشید برای یه تور سریع و جذاب از پشت صحنه آزمایشگاه پروتئین تو یکی از بزرگترین شرکت‌های داروسازی جهان💊

#bioinformatic_vlog

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

🦠 تحلیل پان‌ژنوم باکتری‌ها: مراحل عملی و ابزارها (پارت1)

🧬 در این آموزش، روش انجام تحلیل پان‌ژنوم بر روی ژنوم باکتری‌ها تشریح شده است. ابتدا با مفهوم پان‌ژنوم و اهمیت تحلیل آن آشنا می‌شویم و ابزارهای موجود برای انجام این تحلیل معرفی می‌گردند.

🧫 در بخش عملی، نحوه استفاده از نرم‌افزار RURI بررسی شده و پیش‌نیازهای سخت‌افزاری و نرم‌افزاری، از جمله محیط لینوکس و نصب Anaconda، توضیح داده می‌شوند. ژنوم‌ها از پایگاه داده NCBI دانلود شده و با نرم‌افزار Prokka حاشیه‌نویسی می‌شوند تا فایل‌های GFF لازم برای تحلیل پان‌ژنوم ایجاد شوند.

✨ این فرایند امکان شناسایی تنوع ژنومی، ساختار جمعیتی و ژن‌های اختصاصی گونه یا سویه‌ها را فراهم می‌سازد و نتایج حاصل مورد تحلیل و تفسیر قرار می‌گیرند.

🔗 Source

💿 همراه با زیرنویس تهیه‌شده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠  @ir_bioinf_group

⚡️یکی از پیشرفته‌ترین پایگاه‌های تحلیل توالی‌‌ DNA و RNA⚡️

🧬 پایگاه DECIPHER یک بسته و پایگاه داده‌ی قدرتمند و رایگان در حوزه بیوانفورماتیک است که با هدف تشخیص، هم‌ترازی و تحلیل توالی‌های نوکلئوتیدی طراحی شده و به پژوهشگران این امکان را می‌دهد تا به‌راحتی مشکلاتی مانند نویز توالی، خطاهای تعیین توالی و نواحی کم‌کیفیت را شناسایی و اصلاح کنند.

🔷 این پایگاه و ابزارهای همراه آن شامل قابلیت‌هایی برای ساخت و تحلیل درخت‌های فیلوژنتیک، شناسایی ژن‌ها، بستن شکاف‌های هم‌ترازی (Alignment Gaps)، تشخیص ادغام یا حذف‌های بزرگ (Indels) و مقایسه‌های چندتوالی هستند. داده‌ها می‌توانند از ژنوم کامل، amplicon، یا داده‌های متابارکدینگ باشند و حتی به‌طور مستقیم از GenBank یا سایر پایگاه‌ها بارگذاری شوند.

❓شما تا حالا از DECIPHER یا ابزارهای مشابه مثل QIIME یا mothur استفاده کرده‌اید؟ تجربه‌تون رو توی کامنت‌ها بهمون بگید.

✍🏻 زهرا حنیفه‌زاده

🔗 لینک پایگاه:
http://DECIPHER.cee.wisc.edu

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

🌐تکنولوژی‌های جدید هوش مصنوعی در تشخیص‌سرطان

👩🏻‍🔬محققان در مرور جامعی در مجله Molecular Cancer (2025) نقش فناوری‌های هوش مصنوعی در تشخیص و درمان سرطان را بررسی کردند. بر اساس این مقاله، هوش مصنوعی با استفاده از الگوریتم‌های یادگیری عمیق، دقت تشخیص سرطان را در تصویربرداری‌های پزشکی، پاتولوژی دیجیتال و بیومارکرهای خونی به‌طور چشمگیری افزایش داده است.

💎از جمله دستاوردهای کلیدی، توسعه مدل‌هایی مانند Prov-GigaPath و CHIEF برای تحلیل تصاویر پاتولوژی با دقت بالا و ابزارهای غربالگری زودهنگام مانند آزمایش (GRAIL) برای شناسایی بیش از ۵۰ نوع سرطان از طریق خون است. همچنین هوش مصنوعی در برنامه‌ریزی درمان شخصی‌شده، کشف دارو و حتی جراحی رباتیک نقش حیاتی ایفا می‌کند.

❗️با این حال، چالش‌هایی از جمله استانداردسازی داده‌ها، سوءگیری در مدل‌ها و نیاز به تأیید بالینی گسترده هنوز وجود دارد. به‌طور کلی، هوش مصنوعی در حال متحول کردن حوزه سرطان‌شناسی با ارائه راهکارهای دقیق، سریع و شخصی‌شده است.

✍🏻سهیلا سلحشورفرد

💡source

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

💊انقلاب در تولید دارو: ورود به عصر‌بیوپروسس 5.0!

❓آیا تا به حال به این فکر کرده‌اید که چگونه خودروهای خودران به بخشی از زندگی روزمره ما تبدیل شده‌اند؟ حالا تصور کنید که همین تحولات در صنعت تولید دارو نیز در حال رخ دادن است!

✅به تازگی موجی تازه در صنعت داروسازی شکل گرفته که از آن با نام «بیوپروسس 5.0» یاد می‌شود. در این شیوه، فناوری‌های نوین دیجیتال، ربات‌ها و روش‌های سازگار با محیط زیست کنار هم قرار گرفته‌اند تا روند تولید دارو، واکسن و آنزیم‌ها را سریع‌تر، هوشمندتر و مطمئن‌تر کنند.

💻در بیوپروسس 5.0، هوش مصنوعی نقش اصلی را بر عهده دارد و می‌تواند پارامترهای تولید را در زمان واقعی بهینه‌سازی کند. یکی از ابزارهای کلیدی در این مسیر، «دوقلوهای دیجیتال» هستند؛ یعنی یک مدل مجازی از فرایند تولید که مثل نسخه دیجیتالی خط تولید عمل می‌کند. این فناوری مسیری به سوی تولید داروهایی ایمن‌تر، سریع‌تر و سازگارتر است.

✍🏻سیدامیرطاها علیپور
🔎آیناز نصیری
🖌ویراستار:مریم حکمتی

💡source

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

✨ آشنایی با داوران طلایی فینال CANCER BIOTALENT ✨

⏳تنها ۴ روز تا پایان مهلت ثبت‌نام باقی مانده؛

📅 ۱۰ مهر | 🕗 ساعت ۸ صبح
📍 سالن همایش‌های بین‌المللی ابوریحان – دانشگاه شهید بهشتی

🔗لینک ویدئو

🔗 لینک ثبت‌نام

اینستاگرام | تلگرام | لینکدین | درباره ما


┏━━━━━━ 
     🆔 @UIBiologists🌱💡 
┗━━━━━━

🦠 تحلیل پان‌ژنوم باکتری‌ها: مراحل عملی و ابزارها (پارت ۲)

🧬 در این آموزش، روش انجام تحلیل پان‌ژنوم بر روی ژنوم باکتری‌ها تشریح شده است. ابتدا با مفهوم پان‌ژنوم و اهمیت تحلیل آن آشنا می‌شویم و ابزارهای موجود برای انجام این تحلیل معرفی می‌گردند.

🧫 در بخش عملی، نحوه استفاده از نرم‌افزار RURI بررسی شده و پیش‌نیازهای سخت‌افزاری و نرم‌افزاری، از جمله محیط لینوکس و نصب Anaconda، توضیح داده می‌شوند. ژنوم‌ها از پایگاه داده NCBI دانلود شده و با نرم‌افزار Prokka حاشیه‌نویسی می‌شوند تا فایل‌های GFF لازم برای تحلیل پان‌ژنوم ایجاد شوند.

✨ این فرایند امکان شناسایی تنوع ژنومی، ساختار جمعیتی و ژن‌های اختصاصی گونه یا سویه‌ها را فراهم می‌سازد و نتایج حاصل مورد تحلیل و تفسیر قرار می‌گیرند.

🔗 Source

💿 همراه با زیرنویس تهیه‌شده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠  @ir_bioinf_group

امروزباهم یه نگاهی به آزمایشگاه تحقیقاتی سرطان بندازیم😍 جاییکه امید، در کوچکترین سلول‌ها هم زنده است 🌟

#bioinformatic_vlog


📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

📌برنامه زمانی رویداد ملی Cancer BioTalent

📅 ۱۰ مهر | 🕗 ساعت ۸ صبح
📍 سالن همایش‌های بین‌المللی ابوریحان – دانشگاه شهید بهشتی

🔗 لینک ثبت‌نام

اینستاگرام | تلگرام | لینکدین | درباره ما


┏━━━━━━ 
     🆔 @UIBiologists🌱💡 
┗━━━━━━

🚨 کشف نقطه شروع سرطان معده

🔬 پژوهشگران با کمک هوش مصنوعی و فناوری‌های ژنتیکی موفق شده‌اند مرحله‌ای پنهان به نام PMC_P را در مسیر سرطان معده کشف کنند که قبل از شکل‌گیری کامل سرطان فعال شده و در آن سلول‌های معده با سلول‌های اطراف وارد تعاملات خطرناک می‌شوند.

💊 سلول‌های PMC_2 با دو مسیر کلیدی فعالیت می‌کنند. یکی با سلول‌های فیبروبلاست از طریق پروتئین NAMPT و دیگری با ماکروفاژها از طریق مولکول AREG. این ارتباط‌ها باعث می‌شوند سیستم ایمنی ضعیف شود و شرایط برای شروع سرطان مهیا گردد.

📊 وقتی این مسیرها فعال باشند، سلول‌ها سریع‌تر تکثیر می‌شوند و تومور پیشرفت می‌کند، اما داروهایی مانند FK866 با مهار این مسیرها روند بیماری را کند کرده و سیستم ایمنی بدن دوباره فعال می‌شود.

💡 این کشف به ما کمک می‌کند سرطان معده را زودتر تشخیص داده و حتی قبل از شروع جدی آن اقدام کنیم. همچنین راه را برای طراحی آزمایش‌های خونی ساده و داروهای جدید باز می‌کند.

✍🏻 محمدمهدی آقائی
🔍 حسن اقبال جهرمی
🖌ویراستار:مریم حکمتی
💡source

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

🤖 آموزش پروژه یادگیری ماشین با داده‌های بیان ژن سرطان (پارت ۱)

🧬 در این ویدیو، فرآیند اجرای یک پروژه Machine Learning بر روی داده‌های بیان ژن مرتبط با سرطان به‌طور کامل تشریح می‌شود. ابتدا با مفاهیم پایه داده‌ها و اهمیت آماده‌سازی آن‌ها آشنا می‌شویم و سپس مراحل کلیدی مانند تقسیم داده‌ها به مجموعه‌های Training و Test و نرمال‌سازی (Normalization) بررسی می‌گردد.

💻 در بخش عملی، کتابخانه‌های Python مورد استفاده معرفی می‌شوند و نحوه بارگذاری و آماده‌سازی داده‌ها برای مدل‌سازی به‌صورت گام‌به‌گام آموزش داده می‌شود.

✨ اجرای این مراحل موجب افزایش دقت مدل‌های پیش‌بینی، هماهنگی مقیاس ویژگی‌ها و ارائه نتایج قابل اعتماد خواهد شد.

🔗 Source

💿 همراه با زیرنویس تهیه‌شده در آکادمی بیوانفورماتیک ایران

📍Instagram | Linkedin | Support

╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠  @ir_bioinf_group

📢 اطلاعیه مهم رویداد Cancer BioTalent

حضور در این رویداد تنها با ارائه کارت حضور امکان‌پذیر است.

برای دریافت کارت خود وارد پنل کاربری شوید:
ورود به سایت ⬅️ پنل کاربری ⬅️ نمرات من ⬅️ گواهینامه

در زمان ورود، با نشان‌دادن کارت حضور، کد داور اول را دریافت خواهید کرد و این بار شما در جایگاه داور اول رویداد ملی Cancer BioTalent خواهید بود.

📍 سالن همایش‌های بین‌المللی ابوریحان – دانشگاه شهید بهشتی

🔴راس ساعت ۸ برنامه آغاز خواهد شد. جهت جلوگیری از ازدحام جمعیت راس ساعت ٧:۴۵ صبح در مکان برگزاری حضور داشته باشید.

اینستاگرام | تلگرام | لینکدین | درباره ما


┏━━━━━━ 
     🆔 @UIBiologists🌱💡 
┗━━━━━━

💉ازدل‌ داده‌های زیستی تا درمان‌های نوظهور سرطان

👩🏻‍🔬محققان با استفاده از فناوری‌های پیشرفته‌ای مانند هوش مصنوعی، مولتی‌اُمیکس و بیوپسی مایع، در حال تحول در کشف داروهای سرطان هستند. این روش‌ها امکان درک بهتر زیست‌شناسی تومور و ارائه درمان‌های شخصی‌تر را فراهم می‌کنند.

🔆بیومارکرهای جدید، از جمله سلول‌های تومور در گردش (CTCs) و DNA آزاد تومور (ctDNA)، امکان نظارت بر پاسخ به درمان و شناسایی مقاومت دارویی را ممکن ساخته‌اند. هوش مصنوعی نیز با تحلیل داده‌های پیچیده، به پیش‌بینی پیشرفت بیماری و طراحی هدفمندتر داروها کمک می‌کند.

💻این فناوری‌ها مسیر را برای درمان‌های تطبیقی و شخصی‌شده سرطان هموار کرده و امیدواری برای بهبود نتایج درمانی بیماران را افزایش داده‌اند.

✍🏻سهیلا سلحشورفرد
🔍عاطفه توانمند

💡source

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group

🧬از DNA تا عملکرد؛ این سایت پل ارتباطی پروتئین‌هاتونه😉

#bioinformatic_tip

📍Instagram | Linkedin | Support


╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group