آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
تحریم ایران توسط ایسوس 🔹ایسوس ایران را تحریم کرد و دسترسی کاربران به سایت ASUS مسدود شد
دوستان برای رفع این مشکل سایت هایی که کاربران ایرانی را تحریم می کنند می توانید از شکن استفاده کنید و با تغییر DNS و IP خود بدون نیاز به فیلترشکن و تنها با چند کلیک ساده و اعمال تنظیمات بر روی سیستم عامل خود از خدمات این وبسایت ها نیز مجددا استفاده کنید. برای آشنایی با چگونی استفاده از شکن برای دور زدن سایت ها و پلتفرم هایی که کاربران ایرانی را تحریم می کنند از راهنمایی ارائه شده در لینک زیر استفاده کنید
https://shecan.ir/
https://shecan.ir/
👍7❤3
آیا شما با دانشجویان خود در طول روز یک فنجان چایی می نوشید؟
یکی از برندگان جایزه نوبل که واقعاً از چای بعدازظهر خود لذت می‌برد، فیزیک‌دان جی.جی. تامسون بود. تامسون در سال ۱۹۰۶ جایزه نوبل فیزیک را برای مطالعات خود روی پرتوهای کاتدی که به کشف الکترون منجر شد، دریافت کرد.
@irbioinformatics
وقتی او رهبر دانشجویان تحقیقاتی در آزمایشگاه کاوندیش در دانشگاه کمبریج شد، تامسون یک زمان کوتاه برای نوشیدن چایی روزانه تعیین کرد که در آن همه دانشجویان تحقیقاتی برای استراحت و نوشیدن چای دعوت می‌شدند. این استراحت همراه با چای به یک آیین مهم در طول روز در آزمایشگاه تبدیل شد. این فرصتی به دانشجویان تحقیقاتی می‌داد تا آزادانه در مورد موضوعاتی مانند علم و سیاست بحث کنند. بسیاری از دانشجویان بعداً از این استراحت‌ها سپاسگزار بودند، جایی که تامسون هم در تحقیقات آن‌ها مشارکت می‌کرد و هم به رفاه آن‌ها توجه داشت.
یکی از برندگان جایزه نوبل که واقعاً از چای بعدازظهر خود لذت می‌برد، فیزیک‌دان جی.جی. تامسون بود. تامسون در سال ۱۹۰۶ جایزه نوبل فیزیک را برای مطالعات خود روی پرتوهای کاتدی که به کشف الکترون منجر شد، دریافت کرد.
@irbioinformatics
وقتی او رهبر دانشجویان تحقیقاتی در آزمایشگاه کاوندیش در دانشگاه کمبریج شد، تامسون یک زمان کوتاه برای نوشیدن چایی روزانه تعیین کرد که در آن همه دانشجویان تحقیقاتی برای استراحت و نوشیدن چای دعوت می‌شدند. این استراحت همراه با چای به یک آیین مهم در طول روز در آزمایشگاه تبدیل شد. این فرصتی به دانشجویان تحقیقاتی می‌داد تا آزادانه در مورد موضوعاتی مانند علم و سیاست بحث کنند. بسیاری از دانشجویان بعداً از این استراحت‌ها سپاسگزار بودند، جایی که تامسون هم در تحقیقات آن‌ها مشارکت می‌کرد و هم به رفاه آن‌ها توجه داشت.
👍12🍾1
#معرفی_کتاب
برای مدت زمان طولانی، دانشمندان به استفاده از استعاره‌های ساده‌انگارانه‌ای راضی شده اند که سیستم‌های زنده را صرفاً مانند ماشین‌ها ی عمل‌کننده توصیف کنند، این را Philip Ball، نویسنده کتاب How Life Works می‌گوید.
با این حال، مهم است که درباره پیچیدگی زیست‌شناسی — از جمله آنچه نمی‌دانیم — شفاف باشیم، زیرا درک عمومی ما از آن بر سیاست‌ها، مراقبت‌های بهداشتی و اعتماد به علم تأثیر می‌گذارد.
بال می‌نویسد: «تا زمانی که اصرار داریم سلول‌ها رایانه‌ها و ژن‌ها کدهای آن‌ها هستند، زندگی ممکن است به‌مانند چیزی باشد که با جادوی نامرئی پوشیده شده است.» اما واقعیت به مراتب جالب‌تر و شگفت‌انگیزتر است
پیشنهاد میکنیم این کتاب فوق العاده جالب و خواندنی را مطالعه کنید چراکه متنش در مقابل تصورات ساده انگارانه از دنیای مولکولی ایستادگی می کنه.
...بیشتر بخوانید...
...دانلود نسخه epub...
...دانلود نسخه pdf...
برای مدت زمان طولانی، دانشمندان به استفاده از استعاره‌های ساده‌انگارانه‌ای راضی شده اند که سیستم‌های زنده را صرفاً مانند ماشین‌ها ی عمل‌کننده توصیف کنند، این را Philip Ball، نویسنده کتاب How Life Works می‌گوید.
با این حال، مهم است که درباره پیچیدگی زیست‌شناسی — از جمله آنچه نمی‌دانیم — شفاف باشیم، زیرا درک عمومی ما از آن بر سیاست‌ها، مراقبت‌های بهداشتی و اعتماد به علم تأثیر می‌گذارد.
بال می‌نویسد: «تا زمانی که اصرار داریم سلول‌ها رایانه‌ها و ژن‌ها کدهای آن‌ها هستند، زندگی ممکن است به‌مانند چیزی باشد که با جادوی نامرئی پوشیده شده است.» اما واقعیت به مراتب جالب‌تر و شگفت‌انگیزتر است
پیشنهاد میکنیم این کتاب فوق العاده جالب و خواندنی را مطالعه کنید چراکه متنش در مقابل تصورات ساده انگارانه از دنیای مولکولی ایستادگی می کنه.
...بیشتر بخوانید...
...دانلود نسخه epub...
...دانلود نسخه pdf...
❤5👍2👏1
درمانی برای HIV؟ عوامل TCR به دنبال از بین بردن مخازن ویروسی هستند.
تدوین: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
اولین درمان مبتنی بر گیرنده سلول T (TCR) که برای از بین بردن سلول‌های حاوی HIV-1 نهفته طراحی شده است، آزمایش‌های بالینی اولیه را با موفقیت پشت سر گذاشته است.
این روش درمان ایمنوتراپی دوظرفیتی ساخته‌شده توسط شرکت Immunocore می‌تواند سلول‌های CD4+ را که به طور مداوم با HIV آلوده هستند (معروف به "مخازن ویروسی") از بین ببرد.
هدف این درمان است که تکثیر HIV در درون بدن سرکوب شده و ویروس تحت کنترل قرار گیرد تا محققان به یک "درمان عملکردی" بدون نیاز به درمان ضد رتروویروسی (ART) دست یابند.
این دستاورد می‌تواند یک جایگزین تحول‌آفرین برای میلیون‌ها نفر از افراد مبتلا به HIV باشد که در سراسر جهان با عوارض این بیماری دست و پنجه نرم می کنند.
...بیشتر بخوانید...
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1750
تدوین: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
اولین درمان مبتنی بر گیرنده سلول T (TCR) که برای از بین بردن سلول‌های حاوی HIV-1 نهفته طراحی شده است، آزمایش‌های بالینی اولیه را با موفقیت پشت سر گذاشته است.
این روش درمان ایمنوتراپی دوظرفیتی ساخته‌شده توسط شرکت Immunocore می‌تواند سلول‌های CD4+ را که به طور مداوم با HIV آلوده هستند (معروف به "مخازن ویروسی") از بین ببرد.
هدف این درمان است که تکثیر HIV در درون بدن سرکوب شده و ویروس تحت کنترل قرار گیرد تا محققان به یک "درمان عملکردی" بدون نیاز به درمان ضد رتروویروسی (ART) دست یابند.
این دستاورد می‌تواند یک جایگزین تحول‌آفرین برای میلیون‌ها نفر از افراد مبتلا به HIV باشد که در سراسر جهان با عوارض این بیماری دست و پنجه نرم می کنند.
...بیشتر بخوانید...
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1750
❤3👍2
شیر مادر آزمایشگاهی
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
در این پست با استارت‌آپ‌های بیوتکنولوژی آشنا بشین که با استفاده از بیوراکتورها شیر تولید می‌کنند تا فرمول شیر خشک نوزادان را بهبود بخشند.
شیر تولید شده در آزمایشگاه در حال آماده‌سازی برای ایجاد تحول در بازار شیر خشک نوزادان است. استارت‌آپ Helaina مستقر در نیویورک در سپتامبر ۲۰۲۴ با سرمایه گذاری ۴۵ میلیون دلاری تلاش کرد تا پروتئینی مشابه با پروتئین موجود در شیر انسانی تولید کند.
همچنین شرکت B Checkerspot مستقر در کالیفرنیا در سال ۲۰۲۳، با سرمایه گذاری ۵۵ میلیون دلاری تلاش کرده است تا چربی شیر انسان را از طریق تخمیر جلبک‌های میکروبی تولید کند. چندین استارت‌آپ دیگر نیز از ابزارهای زیست‌فناوری برای بهینه‌سازی شیر برای تغذیه نوزادان استفاده می‌کنند تا محصولی نزدیک‌تر به استاندارد طلایی تغذیه نوزادان، یعنی شیر مادر، ارائه دهند.
به نظر می رسد این صنعت نوپا در حوزه بیوتک می تواند منجر به تولید فرمولاسیون های جدیدی از شیر مادر به صورت آزمایشگاهی شود که نیازهای تغذیه ای کودکان را تامین نمایید.
...بیشتر بخوانید...
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
در این پست با استارت‌آپ‌های بیوتکنولوژی آشنا بشین که با استفاده از بیوراکتورها شیر تولید می‌کنند تا فرمول شیر خشک نوزادان را بهبود بخشند.
شیر تولید شده در آزمایشگاه در حال آماده‌سازی برای ایجاد تحول در بازار شیر خشک نوزادان است. استارت‌آپ Helaina مستقر در نیویورک در سپتامبر ۲۰۲۴ با سرمایه گذاری ۴۵ میلیون دلاری تلاش کرد تا پروتئینی مشابه با پروتئین موجود در شیر انسانی تولید کند.
همچنین شرکت B Checkerspot مستقر در کالیفرنیا در سال ۲۰۲۳، با سرمایه گذاری ۵۵ میلیون دلاری تلاش کرده است تا چربی شیر انسان را از طریق تخمیر جلبک‌های میکروبی تولید کند. چندین استارت‌آپ دیگر نیز از ابزارهای زیست‌فناوری برای بهینه‌سازی شیر برای تغذیه نوزادان استفاده می‌کنند تا محصولی نزدیک‌تر به استاندارد طلایی تغذیه نوزادان، یعنی شیر مادر، ارائه دهند.
به نظر می رسد این صنعت نوپا در حوزه بیوتک می تواند منجر به تولید فرمولاسیون های جدیدی از شیر مادر به صورت آزمایشگاهی شود که نیازهای تغذیه ای کودکان را تامین نمایید.
...بیشتر بخوانید...
❤6👍2
پژوهش یار1.pdf
153.4 KB
قابل توجه دانشجویان دکتری
شیوه نامه پژوهش یار جهت تحت پوشش قرار گرفتن دانشجویان دکتری تمام وقت/کانال اطلاع رسانی دانشجویی و فرهنگی دانشگاه تهران
شیوه نامه پژوهش یار جهت تحت پوشش قرار گرفتن دانشجویان دکتری تمام وقت/کانال اطلاع رسانی دانشجویی و فرهنگی دانشگاه تهران
🥰2👏2👍1
معرفی هوش مصنوعی NotebookLM
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
ابزار NotebookLM یک ابزار قدرتمند مبتنی بر هوش مصنوعی است که به کاربران کمک می‌کند اطلاعات پیچیده را با امکان آپلود انواع منابع (مانند مقالات، کتب، صفحات وب و فایل‌های صوتی) در یک نوت‌بوک فعال بر روی Google cloud آنالیز و تجزیه و تحلیل کنند.
هوش مصنوعی این اطلاعات را ترکیب و تحلیل می‌کند و ویژگی‌هایی مانند خلاصه‌سازی، ساختاردهی و حتی مرورهای صوتی ارائه می‌دهد. نسخه پیشرفته‌تر این پلتفرم، یعنی NotebookLM Plus، امکانات و ابزارهای استفاده بیشتری را در اختیار کاربران قرار می‌دهد. این پلتفرم امکان همکاری بین کاربران را فراهم می‌کند و شامل ابزارهای تحلیلی برای نوت‌بوک‌های اشتراک‌گذاری شده نیز می‌شود.
این پلتفرم رایگان است و قابلیت استفاده اکادمیک را دارا می باشد و استفاده از آن در تهیه مقالات و سایر اسناد علمی بین المللی مشکلی ندارد.
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1758
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
ابزار NotebookLM یک ابزار قدرتمند مبتنی بر هوش مصنوعی است که به کاربران کمک می‌کند اطلاعات پیچیده را با امکان آپلود انواع منابع (مانند مقالات، کتب، صفحات وب و فایل‌های صوتی) در یک نوت‌بوک فعال بر روی Google cloud آنالیز و تجزیه و تحلیل کنند.
هوش مصنوعی این اطلاعات را ترکیب و تحلیل می‌کند و ویژگی‌هایی مانند خلاصه‌سازی، ساختاردهی و حتی مرورهای صوتی ارائه می‌دهد. نسخه پیشرفته‌تر این پلتفرم، یعنی NotebookLM Plus، امکانات و ابزارهای استفاده بیشتری را در اختیار کاربران قرار می‌دهد. این پلتفرم امکان همکاری بین کاربران را فراهم می‌کند و شامل ابزارهای تحلیلی برای نوت‌بوک‌های اشتراک‌گذاری شده نیز می‌شود.
این پلتفرم رایگان است و قابلیت استفاده اکادمیک را دارا می باشد و استفاده از آن در تهیه مقالات و سایر اسناد علمی بین المللی مشکلی ندارد.
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1758
👍9❤🔥1🥰1🤔1
عنوان مقاله:
Recent application of CRISPR-Cas12 and OMEGA system for genome editing
سال چاپ: 2024
خلاصه و تدوین: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
در سال ۲۰۱۲ مشخص گردید که سیستم CRISPR با قابلیت برنامه‌ریزی مجدد می‌تواند ویرایش دقیق ژن‌ها را در DNA هدف ایجاد کند. از آن زمان، مطالعات زیادی پتانسیل این سیستم را برای ویرایش موجودات زیستی مختلف بررسی کرده‌اند.
علاوه بر CRISPR-Cas9، ارتولوگ‌های دیگری مانند CRISPR-Cas12 و سیستم ویرایش ژنی جدید یوکاریوتی OMEGA (شامل TnpB و Fanzor) شناسایی شده‌اند که ویژگی‌های منحصر به فردی دارند و برای ویرایش ژن‌ها در محیط in vivo مناسب‌تر هستند.
اندازه کوچک این آنزیم‌ها امکان استفاده از سیستم های وابسته به آدنوویروس ها برای انتقال این مجموعه ویرایشی را فراهم می‌کند، که آن‌ها را به رقیبی جدی برای Cas9 در ژن درمانی تبدیل کرده است. این مقاله مروری بر ساختار، بیوشیمی، اثرات خارج از هدف و کاربردهای این اندونوکلئازهای برنامه‌پذیر هدایت‌شونده توسط RNA در ویرایش های ژن درمانی متمرکز است.
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1764
Recent application of CRISPR-Cas12 and OMEGA system for genome editing
سال چاپ: 2024
خلاصه و تدوین: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
در سال ۲۰۱۲ مشخص گردید که سیستم CRISPR با قابلیت برنامه‌ریزی مجدد می‌تواند ویرایش دقیق ژن‌ها را در DNA هدف ایجاد کند. از آن زمان، مطالعات زیادی پتانسیل این سیستم را برای ویرایش موجودات زیستی مختلف بررسی کرده‌اند.
علاوه بر CRISPR-Cas9، ارتولوگ‌های دیگری مانند CRISPR-Cas12 و سیستم ویرایش ژنی جدید یوکاریوتی OMEGA (شامل TnpB و Fanzor) شناسایی شده‌اند که ویژگی‌های منحصر به فردی دارند و برای ویرایش ژن‌ها در محیط in vivo مناسب‌تر هستند.
اندازه کوچک این آنزیم‌ها امکان استفاده از سیستم های وابسته به آدنوویروس ها برای انتقال این مجموعه ویرایشی را فراهم می‌کند، که آن‌ها را به رقیبی جدی برای Cas9 در ژن درمانی تبدیل کرده است. این مقاله مروری بر ساختار، بیوشیمی، اثرات خارج از هدف و کاربردهای این اندونوکلئازهای برنامه‌پذیر هدایت‌شونده توسط RNA در ویرایش های ژن درمانی متمرکز است.
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1764
👍6