Недавние исследования показали высокий потенциал трансплантации нейральных стволовых клеток для восстановления миелиновых оболочек при рассеянном склерозе. Однако их использование сопряжено с рядом трудностей. Британские ученые и коллабораторы предложили использовать индуцированные нейральные стволовые клетки (иНСК), полученные из собственных фибробластов реципиента. Авторы показали на мышах, что иНСК выживают в спинном мозге, обладают иммуномодулирующими свойствами, дифференцируются в зрелые олигодендроциты и синтезируют миелин. Использование собственных клеток позволяет в том числе отказаться от иммуносупрессии. Подробнее

#новости

Исследование древних геномов с обширной территории Северной Евразии добавило важные фрагменты к генетической истории ее населения. Ученые под руководством Дэвида Райха — одного из ведущих палеогенетиков мира — обнаружили генетические компоненты, маркирующие распространение языков енисейской и уральской языковых семей. Они также нашли вероятное объяснение Сейминско-турбинскому феномену — быстрому распространению по огромной территории передовых технологий работы с медью и медных изделий, которое произошло около 4 тысяч лет назад.
Подробнее

#новости

Для терапии лекарственно-устойчивого туберкулеза применяют рекомендованный ВОЗ режим BPaLM, в который включено четыре препарата. Один из них — линезолид — добавили в схему в 2022 году, что сильно сократило время лечения. Однако этот препарат токсичен и плохо переносится пациентами. В The Lancet Infectious Diseases опубликованы результаты КИ дельпазолида — препарата того же класса — включенного в режим BPaLM вместо линезолида. Терапия оставалась эффективной, но вызывала намного меньше нежелательных явлений у пациентов.
Подробнее

#новости

Ранее считалось, что послеоперационный делирий — незначительное осложнение, которое проходит без вмешательства. Однако в последнее время появляется все больше свидетельств тому, что делирий может иметь серьезные последствия. Американское гериатрическое общество даже описывает послеоперационный делирий как острую мозговую недостаточность, аналогичную острой сердечной недостаточности. Исследователи из США проанализировали исходы 5,5 млн операций под общим наркозом, исключая операции на сердце, и показали, что делирий встречался в 3,6% случаев. У людей, испытавших постоперационный делирий, риски смерти или серьезных осложнений были в 3,5 раза выше, а смерти в течение 30 дней — в 2,8 раза выше, чем у людей без делирия. Авторы также предложили меры по снижению риска развития делирия, например, соблюдение гигиены сна. Подробнее

#новости

Около четверти форм пигментного ретинита (наследственной дегенерации сетчатки) вызваны мутациями в гене родопсина, которые приводят к отмиранию палочек. Ученые из США показали на мышиных моделях, что при гибели палочек биполярные клетки, передающие сигнал от этих палочек, начинают работать с «не своими» фоторецепторами — они формируют синапсы с колбочками. Такая адаптивная гибкость сетчатки может объяснить медленную прогрессию ряда форм пигментного ретинита, а дальнейшее изучение механизмов важно для разработки методов «перепрограммирования» клеток сетчатки, чтобы лечить ее наследственные дегенерации.
Подробнее

#новости

Некоторые нейродегенеративные заболевания связаны с экспансией тринуклиотидных повторов (болезнь Гентингтона, синдром ломкой Х-хромосомы). Молекулы РНК с большим числом повторов при определенных условиях формируют устойчивые агрегаты внутри биомолекулярных конденсатов. Ученые из США показали, что этот процесс запускается за счет специфических взаимодействий между гомотипическими РНК и приводит к фазовому переходу от жидкого к твердому состоянию. РНК-связывающие белки и антисмысловые олигонуклеотиды могут препятствовать необратимой агрегации РНК. Подробнее

#новости

В рамках курса «Машинное обучение и анализ данных для учёных» особое внимание уделено самым продвинутым моделям современности: BERT, AlphaFold, ProteinMPNN.

Почему это важно? Потому что в октябре прошлого года две из трёх Нобелевских премий в области естественных наук были вручены за достижения, напрямую связанные с искусственным интеллектом. Демис Хассабис и Джон Джампер получили премию по химии «за предсказание белковых структур», а Дэвид Бейкер — «за компьютерный дизайн белков». Именно те самые задачи, которые решают AlphaFold и ProteinMPNN. Да, это больше не фантастика — это часть современной молекулярной биологии.

На курсе вы узнаете, как работают эти модели, чем они отличаются от классических методов и как использовать их в своей работе. Мы объясняем с нуля, но по существу: без перегрузки математикой, но с уважением к научной глубине темы.

А ещё про AlphaFold у BioMedSchool есть отдельный вебинар — так что можно будет погрузиться в тему глубже, разобрать архитектуру и реальные кейсы её применения.

ЭПИДДАЙДЖЕСТ — Сибирская язва и вирусный менингит в Казахстане, дизентерия в Дагестане, сальмонеллез в Томской и Омской областях, лихорадка денге в Нигерии и Бангладеш, скарлатина на Тайване, SFTS у людей и кошек в Японии, отравление свинцом в детском саду и плотоядный нехолерный вибрион Vibrio vulnificus в Китае, свиной стрептококк во Вьетнаме.

#эпиддайджест

После попадания в Северную Америку в начале XX века чума поразила большое число местных видов. Особенно уязвимы оказались высокосоциальные луговые собачки — чума могла полностью уничтожать их популяции. Ученые из США обнаружили генетические адаптации у выживших луговых собачек, перенесших инфекцию. Среди идентифицированных адаптивных локусов оказался в том числе ген индуцируемого костимулятора T-лимфоцитов (ICOS), ассоциированный с устойчивостью к чуме у человека.
Подробнее

#новости

Поражения легких при инфекциях могут быть связаны не с самим патогеном, а с чрезмерной реакцией иммунной системы. Ученые из Канады с коллабораторами показали, что β-глюкан — компонент клеточной стенки грибов, способный влиять на иммунную систему, — перепрограммирует альвеолярные макрофаги. У мышей, подвергшихся действию β-глюкана, альвеолярные макрофаги сильнее активировались при стимуляции липополисахаридом, чем у контрольных мышей. Их избыточная активация и синтез провоспалительных цитокинов усиливали поражение легких.
Подробнее

#новости

При ожирении происходит патологическое ремоделирование жировой ткани — гипертрофия адипоцитов, инфильтрация иммунных клеток, секреция провоспалительных цитокинов, нарушение ангиогенеза и фиброз. Британские исследователи посмотрели на уровне единичных ядер, что происходит в жировой ткани при ожирении и последующей потере веса. Оказалось, что при потере веса число инфильтрирующих макрофагов снижается, но оставшиеся клетки по-прежнему активны и готовы к повторному набору веса и ухудшению метаболической функции. Потеря веса снижает число сенесцентных клеток в жировой ткани, что потенциально влияет на метаболическое здоровье и продолжительность жизни. Подробнее

#новости

Продолжаются исследования вируса высокопатогенного птичьего гриппа A(H5N1) клады 2.3.4.4b (HPAI H5N1), распространившихся в США среди молочного скота. Международная группа ученых провела опыты на лабораторных линиях мышей, которые различаются по экспрессии противовирусного фактора Mx1. Как при наличии, так и при отсутствии этого фактора животные были восприимчивы к вирусу, что указывает на потенциальную роль диких мышей в его распространении. Инфицированные животные выделяли вирус в окружающую среду с мочой, и вирус сохранял инфекционность не менее 24 часов при комнатной температуре — это может быть одним из путей межвидовой передачи.
Подробнее

#новости

Против вирусов папилломы человека (ВПЧ), поражающих кожу, а не слизистые оболочки, пока нет вакцин или лекарственных средств. Ученые из Эстонии провели скрининг малых молекул и выявили вещество — NSC51349, — которое в перспективе может стать лекарством или основателем класса лекарств от кожных папилломавирусов. Оно подавляло репликацию генома ВПЧ-5 в человеческих клеточных линиях, в том числе первичных кератиноцитах, не влияя на жизнеспособность и дифференцировку клеток. Дальнейшие опыты показали, что NSC51349 специфично ингибировало активность вирусного белка E2, связываясь с его консервативными доменами. Благодаря такому механизму действия соединение активно и против других кожных папилломавирусов.
Подробнее

#новости

Триазолы — основная группа препаратов, применяемых при аспергиллезе. Анализ более 12 тысяч образцов аспергилла, полученных от пациентов, выявил резистентность в 1979 (15,6%) случаях. У 17,2% грибков наблюдались вариации в генотипе и/или фенотипе — малораспространенные мутации или отличающийся профиль резистентности. При этом число образцов с такими вариациями возрастало со временем. Авторы считают, что из-за этого идентификация резистентных грибков с помощью ПЦР-анализа маркеров, которая применяется в настоящее время, может вскоре стать неэффективной.
Подробнее

#новости

У людей с мутацией в одной из копий гена CSF1R нарушается работа микроглии и развивается лейкоэнцефалопатия взрослых с аксональными сфероидами и пигментированной глией (ALSP). Для ALSP характерны миелиновые патологии, аксональный отек, кальцификация головного мозга, двигательные и когнитивные нарушения. Лечения у этого заболевания нет. Исследователи из Китая предложили заменить поврежденную микроглию на здоровую путем пересадки костного мозга. Они продемонстрировали на мышиной модели и на восьми добровольцах с ALSP, что замена микроглии нормализовала их состояние. В течение 24 месяцев у людей, получивших лечение, сохранялись двигательные функции и стабилизировались когнитивные способности, в отличие от контролей, состояние которых ухудшилось. Подробнее

#новости