با سلام و تقدیم احترام به همراهان عزیز

🔻بدینوسیله به اطلاع می رساند باتوجه به اطلاعیه ی دیرهنگام دانشگاه صنعتی شریف مبنی بر قطعی برق و تهویه ی دانشکده در روزهای تعطیلی دانشگاه(24الی31 مردادماه)، ضمن عرض پوزش به اطلاع می رساند کارگاه بیوانفورماتیک در روزهای ۲۳ الی ۲۵ مرداد ماه لغو می گردد.

🔶 کارگاه مذکور به روزهای 30 مرداد الی 1 شهریورماه در مکان دیگری منتقل می گردد.

▫ تمامی عزیزانی که پیش از این ثبت نام نموده اند می توانند با ارسال ایمیل و یا ارتباط با آیدی ادمین نسبت به حفظ و یا لغو ثبت نام خود اقدام نمایند.

🔺 همچنین مهلت ثبت نام در این کارگاه تمدید گردیده و علاقمندان می توانند تا تاریخ 27 مردادماه 98 نسبت به ثبت نام در این کارگاه اقدام نمایند.

🔶با عرض سلام و تبریک عید غدیر بر شما عزیزان همراه BCB

ضمن تقدیم برنامه ی اجرایی کارگاه بیوانفورماتیک به اطلاع می رساند ایمیل تاییدیه ی نهایی ثبت نام در این کارگاه برای تمامی شرکت کنندگان این کارگاه ارسال گردیده است.

🔻 خواهشمند است آن دسته از عزیزانی که ایمیل تاییدیه ثبت نام خود را دریافت نکرده اند به تیم اجرایی گروه اطلاع دهند.

همچنین محل برگزاری کارگاه بیوانفورماتیک پژوهشگاه رویان می باشد. محل دقیق و لوکیشن محل برگزاری متعاقبا اعلام می گردد.

با تشکر

@bcbgroup

◾️محل برگزاری کارگاه بیوانفورماتیک

🔸 جلسه ی سوم مقاله خوانی گروه پژوهشی BCB در تاریخ ۲۲ مردادماه۹۸ با حضور جمعی از علاقمندان در مرکز رشد استعداد های درخشان دانشگاه علوم پزشکی تهران و با ارائه ی خانم سایه کاظم فارغ التحصیل کارشناسی ارشد آمار و کاربردها از دانشگاه تهران برگزار گردید.

▫️خانم سایه کاظم ابتدا مروری بر تاریخچه‌ی مدل مارکف پنهان و عملکرد پروتئین‌ها داشتند؛ سپس مدلی برای پیش‌بینی ساختار دوم پروتئین و مبتنی بر مارکف پنهان ارائه دادند.

🔹در نهایت ضمن سپاس از حضور تمامی عزیزان، لینک ویدئوی ضبط گردیده از این جلسه تقدیم می گردد.

📽 https://drive.google.com/file/d/13tTsmmbsI1RzwukekNg8qTDc5jw9krOX/view?usp=drivesdk

@bcbgroup
#USERN
#science_without_border
#Journalclub3

سخنرانی علمی آقای مجتبی تفاق از دانشگاه Stanford
پنجشنبه 1398/06/28
سخنرانی اول ساعت 10:30 - 9:30
سخنرانی دوم ساعت 12-11
پژوهشگاه دانش های بنیادی - ساختمان فرمانیه - طبقه همکف کلاس A

🔸 کارگاه یک روزه ی تحلیل داده های زیستی به کمک SnakeMake

🔹مدرس کارگاه:
سرکار خانم مریم غرقانی، دانشجوی مقطع دکتری موسسه انفورماتیک MaxPlank

▫️جهت شرکت در این کارگاه آشنایی با مفاهیم مقدماتی برنامه نویسی پایتون، دستورات مقدماتی shell و ابزار هایی مانند samtools و bwa ضروری است.

🔺ظرفیت شرکت در کارگاه تنها 20 نفر بوده و توصیه می گردد افراد علاقمند قبل از تکمیل ظرفیت نسبت به ثبت نام نهایی خود اقدام نمایند.

🔻ثبت نام و اطلاعات بیشتر:
👉https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSf1Y44liUF-cLKaVULAN6Nu7bXqdrzdkKFQsKpGbgg8bXyIuw/viewform?usp=sf_link

@bcbgroup

روند رايج در تحليل داده هاي زيستی، طراحي workflow هايي است كه در آنها این داده ها طي سلسله مراتبي با ابزارهاي محاسباتي مختلف بيوانفورماتيك پردازش مي شوند تا نتيجه نهايي يك كار پژوهشي حاصل شود.

خودکارسازی آزمايش هاي تحليل داده در قالب محيطي براي نوشتن workflow اهميت به سزايي در ايجاد يك كار پژوهشي قابل بازتوليد (reproducible) دارد. علاوه بر اين از ديگر مزاياي چنين محيطي ميتوان به خوانا بودن workflow هاي پيچيده و بزرگ و آسان سازي اجرا و تكرار آزمايش هاي تحليل داده اشاره كرد.

سیستم SnakeMake محيطي بر مبناي پايتون براي نوشتن workflow هاي تحليل داده است كه در راستاي تحقق اهداف ذكر شده طراحي گردیده است.

🔸بیشتر بخوانید:
📎 https://bitbucket.org/snakemake/snakemake/src/master/

📎 https://github.com/snakemake-workflows/docs

امشب، آخرین فرصت برای ثبت نام در کارگاه آموزش SnakeMake !

همراهان عزیز گروه پژوهشی BCB!
با احترام به استحضار می رسانیم مدیریت گروه پژوهشی BCB قصد دارد نسبت به تغیر نام این گروه پژوهشی اقدام نماید. از مهم ترین دلایل این اقدام می توان به تکرارفراوان نام فعلی در بین اسامی گروه ها و انجمن های فعال در این حوزه، در سطح ملی و جهانی نام برد. لذا با کسب مشورت از اساتید دلسوز این گروه پژوهشی بر آن شدیم تا این تصمیم را با تمامی پژوهشگران همراه این گروه در میان گذاشته و در راستای انتخاب نامی مناسب برای این گروه دست یاری به سمت شما عزیزان دراز کنیم.

🔹بدینوسیله از تمامی دوستانی که قادر به ارائه ی پیشنهاداتی ارزنده به عنوان نام جایگزین برای این گروه پژوهشی می باشند صمیمانه دعوت می نماییم تا با تکمیل فرم زیر، نسبت به ارائه ی پیشنهادات خود اقدام نمایند.

🔻اطلاعات بیشتر در خصوص معیارهای موردنظر در انتخاب نام جایگزین برای این گروه و همچنین فرم ثبت پیشنهادات از طریق لینک زیر در دسترس است:

👉 https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSfsgBrGg-lddQRUN11Rupb62RgV65zbZa5dQrBPu6E_zM5FoQ/viewform?usp=sf_link

🔺مهلت ارسال پیشنهادات: پایان روز شنبه 6 مهرماه

@bcbgroup

🔹چهارمین جلسه ی مقاله خوانی گروه پژوهشی BCB
با موضوع: ارائه ی مقاله ی پذیرفته شده در مجله ی Nature Biotechnology با عنوان
Single-cell strand sequencing and its applications in various biological problems
برگزار می گردد.

🔸 ارائه دهنده: سرکار خانم مریم غرقانی، دانشجوی دکتری موسسه ی انفورماتیک MaxPlanck آلمان

⏰ زمان: دوشنبه، 8 مهرماه
ساعت ۱۷ تا۱۸

🏫مکان: دانشگاه صنعتی شریف، دانشکده مهندسی کامپیوتر، طبقه چهارم، سالن خوارزمی

🔻ظرفیت محدود
📝 ثبت نام الزامی ست

ثبت نام رایگان:
https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSfgRC3KMQQyJREZbcUFMibP49kDxR9nYzNolMJPy7C40-S97w/viewform?usp=sf_link

🔺 لازم به ذکر است این جلسه، ارائه‌ی یک مقاله از ایشان و همکارانشان است که در مجله‌ی معتبر Nature Biotechnology پذیرش گرفته اما هنوز نوبت انتشار آن نرسیده است. دیدن یک مقاله در این سطح قبل از انتشار آن فرصت بسیار ارزشمندی است.

@bcbgroup