Джин от SkyGen - зачет. На месте Скайджина я бы задумался над таким брендированием limited edition в будущем)
A Certain Scientific Impostor
#как_надо_работать #китайский_биотех В том, что касается синтеза генов, расклад такой, тезисно: 1. Используют в сборке сырые олиги без очистки. Только обессоливание на полимерных фритах, прямо на плашках Biocomma; 2. Собирают двумя ПЦРками из пулов олигов…
#китайский_биотех
Требуется пояснить, почему такая низкая себестоимость синтеза генов - 7 рублей за букву в гене (тогда как 10-15р в условиях РФ это уже очень хорошая себестоимость в пересчете на олиги - а ведь при сборке генов еще добавляются издержки в виде ферментов, времени работы и секвенирования).
В GeneralBiol подошли к инфраструктурному вопросу фундаментально. Они сами делают себе всё сырье:
1. у них свои мощности по получению сухого ацетонитрила для синтеза ДНК;
2. они сами делают всю реагентику - в частности активаторы;
3. они сами делают также и мономеры - фосфорамидиты.
Также немаловажно то, что у них весь пластик локально производится Biocomma (естественно, внутри Китая по специальным ценам), а также, как мы уже знаем, синтезаторы для них вообще делаются, практически, "через улицу".
Плюс к этому, производство базовой реагентики бы себя не оправдывало при работе на маленький рынок (к слову, рынок РФ как раз весьма небольшой, в сравнении с КНР, хоть и растущий), поэтому они заранее нацелились на рынок мировой.
С этим связан и последний компонент успеха - каким образом они сразу так перепрыгнули на мировой масштаб рынка? Чтобы ответить на него рекомендую погуглить "
Поистине огромные инфраструктурные инвестиции - совершенно сознательная политика, которая приносит результат в виде экспресс-выхода производственных компаний на мировой рынок, позволяя быстро преодолеть ловушку масштабирования.
Ведь это хорошо известная проблема, не раз поднимавшаяся например в сообществе ХИМЭКСПЕРТ (даже лично Георгием Хачияном, и не только, на многочисленных круглых столах) - конкурентоспособно только крупномасштабное химическое производство, которое позволяет сократить удельные издержки, но для него как раз нужны фундаментальные инвестиции, которые частный бизнес далеко не всегда может себе позволить (ака построить завод крупно/среднетоннажной реагентики).
То есть, банально, например, в РФ нет своей фосфорорганики. Недавно были проблемы с такой базовой реагентикой как хлориды фосфора! Сейчас небольшая команда химиков в РФ наладила производство хлоридов фосфора (кстати, обращайтесь @EndlessNight065), за что им большой респект, но просто сам факт - какое-то время назад достать PCl3 было проблемой. Ну, и понятное дело, что в РФ нет своих амидитов.
Требуется пояснить, почему такая низкая себестоимость синтеза генов - 7 рублей за букву в гене (тогда как 10-15р в условиях РФ это уже очень хорошая себестоимость в пересчете на олиги - а ведь при сборке генов еще добавляются издержки в виде ферментов, времени работы и секвенирования).
В GeneralBiol подошли к инфраструктурному вопросу фундаментально. Они сами делают себе всё сырье:
1. у них свои мощности по получению сухого ацетонитрила для синтеза ДНК;
2. они сами делают всю реагентику - в частности активаторы;
3. они сами делают также и мономеры - фосфорамидиты.
Также немаловажно то, что у них весь пластик локально производится Biocomma (естественно, внутри Китая по специальным ценам), а также, как мы уже знаем, синтезаторы для них вообще делаются, практически, "через улицу".
Плюс к этому, производство базовой реагентики бы себя не оправдывало при работе на маленький рынок (к слову, рынок РФ как раз весьма небольшой, в сравнении с КНР, хоть и растущий), поэтому они заранее нацелились на рынок мировой.
С этим связан и последний компонент успеха - каким образом они сразу так перепрыгнули на мировой масштаб рынка? Чтобы ответить на него рекомендую погуглить "
избыточные производственные мощности КНР". Поистине огромные инфраструктурные инвестиции - совершенно сознательная политика, которая приносит результат в виде экспресс-выхода производственных компаний на мировой рынок, позволяя быстро преодолеть ловушку масштабирования.
Ведь это хорошо известная проблема, не раз поднимавшаяся например в сообществе ХИМЭКСПЕРТ (даже лично Георгием Хачияном, и не только, на многочисленных круглых столах) - конкурентоспособно только крупномасштабное химическое производство, которое позволяет сократить удельные издержки, но для него как раз нужны фундаментальные инвестиции, которые частный бизнес далеко не всегда может себе позволить (ака построить завод крупно/среднетоннажной реагентики).
То есть, банально, например, в РФ нет своей фосфорорганики. Недавно были проблемы с такой базовой реагентикой как хлориды фосфора! Сейчас небольшая команда химиков в РФ наладила производство хлоридов фосфора (кстати, обращайтесь @EndlessNight065), за что им большой респект, но просто сам факт - какое-то время назад достать PCl3 было проблемой. Ну, и понятное дело, что в РФ нет своих амидитов.
#ужасы_нашего_городка
УФ-ячейка в сканлаб-хроматографе оказалась раздавлена, при этом он последние дни жизни выдавал вполне вменяемые хроматограммы. Как это возможно вообще? Надежность как у жигуля. Ремонтопригодность, впрочем, тоже.
УФ-ячейка в сканлаб-хроматографе оказалась раздавлена, при этом он последние дни жизни выдавал вполне вменяемые хроматограммы. Как это возможно вообще? Надежность как у жигуля. Ремонтопригодность, впрочем, тоже.
A Certain Scientific Impostor
Video
Большая делегация была в СБМ на этой неделе на подписании соглашения о сотрудничестве МФТИ и Роспотреба. Дмитрий Ливанов заглянул в том числе в нашу лабораторию, а мы рассказали немного про наши процессы по синтезу олигов и пептидов.
A Certain Scientific Impostor
А, так вот откуда прорыв варпа произошел. Я все гадаю откуда люди новые набегают, а это оказывается мой старый пост про гугл-дорки завирусился.
P.S.: Дисклеймер - я не претендую на экспертность в OSINT, просто химикам и биологам оказалось довольно полезно знать азы при поиске литературы за пейволлом.
Техножрица, виват! Я тоже тебя читаю)
P.S.: Дисклеймер - я не претендую на экспертность в OSINT, просто химикам и биологам оказалось довольно полезно знать азы при поиске литературы за пейволлом.
Техножрица, виват! Я тоже тебя читаю)
Forwarded from Kirill A
Реально это бородатый трюк
Но на всякий, если кто не знаком - поисковой синтаксис
Но на всякий, если кто не знаком - поисковой синтаксис
Смотрю топ прорывов-2024 по версии Science - ба, все те же на манеже!
Ленакапавир снова украл заголовки в связи с триумфальными результатами третьей фазы слепых и рандомизированных клинических испытаний на выборке 5300 человек в качестве препарата доконтактной профилактики - pre-exposure prophylaxis (PrEP).
В группе получавшей две инъекции ленакапавира в год - ноль заражений. Результаты второго испытания опубликованы в октябре и только подтвердили эффективность.
Первый раз мы про эту молекулу услышали в 2020 году, когда Ленакапавир, тогда проходивший под скромным шифром GS-6207, был выбран молекулой года по версии DrugHunter, на тот момент молекула была на 2 стадии клиники. Я сам узнал о нем впервые в хайлайте ресурса Тимура Маджидова - Хемоинформатика и Молекулярное Моделирование (очень жаль кстати, что частота публикаций сократилась).
Чем молекула интересна?
- это молекула - first-in-class ингибитор капсида белка. Препаратов ингибиторов протеин-протеиновых взаимодействий ранее не существовало. Обычные лекарства от ВИЧ - это ингибиторы протеазы или РНК-полимеразы.
- молекула эффективна против устойчивых штаммов вируса. Тем пациентам, которым не помогает уже никакое лекарство, снижает вирусную нагрузку в 88% случаев.
- препарат показывает пикомолярную активность (105 пМ)
- он обладает уникально низким клиренсом, из-за чего задерживается в организме на ПОЛГОДА после разовой дозы! Вы не ослышались - его клиренс 6 месяцев! Надо отметить, что для такой активности рекомендуемая доза достаточно большая - 450мг. Но зато скорость выведения за полгода не может убрать вещество до неактивной концентрации.
Механизм в двух словах: ингибирование правильной работы капсида происходит через активацию образования неправильной пространственной структуры мономеров.
Но в нюансах много интересного. Механизм достаточно долго изучали, и много интересного про устройство самого капсида HIV накопали в процессе. Сначала предполагали, что Ленакапавир не дает слипаться мономерам капсида, затем - что наоборот, стабилизирует капсид так, что он вовремя не распадается и не выпускает генетический материал. На текущий момент выяснено, что мягкий но прочный капсид HIV в цикле размножения вируса должен дотащить содержимое до ядра клетки, и только там он должен высвободить свою РНК. Ленакапавир делает капсид жестким, но при этом хрупким, и капсид разваливается до достижения ядра, а его содержимое переваривается в цитоплазме хоста.
История создания: Пфайзер сначала опубликовал статью, в которой они рассказали про слабо связывающуюся молекулу, да еще и цитотоксичную. Но зато дали рентгеновскую структуру. Дальше ребята из Gilead, на основе ключевого скаффолда придумали новых молекул, проскринили и нашли как активаторы, так и ингибиторы самоорганизации белков капсида. Логику ингибиторов не поняли, они все сильно отличались, но с активаторами работать и делать дизайн было проще и они решили - а почему бы не искать настолько активный активатор, чтоб нормальный капсид образоваться не мог?
В результате, разработанный активатор формирует предпочтительно гексамеры из белков мономеров капсида, при этом образование пентамеров ингибируется. Отдельно гексамеры не могут собраться в нормальный, прочный и мягкий капсид, потому что для правильного обязательно нужны также пентамеры.
В ходе оптимизации попытались снизить выведение. Растворимость Ленакапавира очень низкая, что позволило использовать его как депо-лекформу с частотой в две инъекции в год.
PS: Оригинальная публикация Gilead: тык
Ленакапавир снова украл заголовки в связи с триумфальными результатами третьей фазы слепых и рандомизированных клинических испытаний на выборке 5300 человек в качестве препарата доконтактной профилактики - pre-exposure prophylaxis (PrEP).
В группе получавшей две инъекции ленакапавира в год - ноль заражений. Результаты второго испытания опубликованы в октябре и только подтвердили эффективность.
Первый раз мы про эту молекулу услышали в 2020 году, когда Ленакапавир, тогда проходивший под скромным шифром GS-6207, был выбран молекулой года по версии DrugHunter, на тот момент молекула была на 2 стадии клиники. Я сам узнал о нем впервые в хайлайте ресурса Тимура Маджидова - Хемоинформатика и Молекулярное Моделирование (очень жаль кстати, что частота публикаций сократилась).
Чем молекула интересна?
- это молекула - first-in-class ингибитор капсида белка. Препаратов ингибиторов протеин-протеиновых взаимодействий ранее не существовало. Обычные лекарства от ВИЧ - это ингибиторы протеазы или РНК-полимеразы.
- молекула эффективна против устойчивых штаммов вируса. Тем пациентам, которым не помогает уже никакое лекарство, снижает вирусную нагрузку в 88% случаев.
- препарат показывает пикомолярную активность (105 пМ)
- он обладает уникально низким клиренсом, из-за чего задерживается в организме на ПОЛГОДА после разовой дозы! Вы не ослышались - его клиренс 6 месяцев! Надо отметить, что для такой активности рекомендуемая доза достаточно большая - 450мг. Но зато скорость выведения за полгода не может убрать вещество до неактивной концентрации.
Механизм в двух словах: ингибирование правильной работы капсида происходит через активацию образования неправильной пространственной структуры мономеров.
Но в нюансах много интересного. Механизм достаточно долго изучали, и много интересного про устройство самого капсида HIV накопали в процессе. Сначала предполагали, что Ленакапавир не дает слипаться мономерам капсида, затем - что наоборот, стабилизирует капсид так, что он вовремя не распадается и не выпускает генетический материал. На текущий момент выяснено, что мягкий но прочный капсид HIV в цикле размножения вируса должен дотащить содержимое до ядра клетки, и только там он должен высвободить свою РНК. Ленакапавир делает капсид жестким, но при этом хрупким, и капсид разваливается до достижения ядра, а его содержимое переваривается в цитоплазме хоста.
История создания: Пфайзер сначала опубликовал статью, в которой они рассказали про слабо связывающуюся молекулу, да еще и цитотоксичную. Но зато дали рентгеновскую структуру. Дальше ребята из Gilead, на основе ключевого скаффолда придумали новых молекул, проскринили и нашли как активаторы, так и ингибиторы самоорганизации белков капсида. Логику ингибиторов не поняли, они все сильно отличались, но с активаторами работать и делать дизайн было проще и они решили - а почему бы не искать настолько активный активатор, чтоб нормальный капсид образоваться не мог?
В результате, разработанный активатор формирует предпочтительно гексамеры из белков мономеров капсида, при этом образование пентамеров ингибируется. Отдельно гексамеры не могут собраться в нормальный, прочный и мягкий капсид, потому что для правильного обязательно нужны также пентамеры.
В ходе оптимизации попытались снизить выведение. Растворимость Ленакапавира очень низкая, что позволило использовать его как депо-лекформу с частотой в две инъекции в год.
PS: Оригинальная публикация Gilead: тык
#вакансия #хантим
Две отличные вакансии "на вырост".
Ищем химиков-синтетиков.
Желаемый уровень - выпускник (лучше всего - РХТУ, МИТХТ, химфаки но рассмотрят всё) + 1-3 года опыта в синтетической лаборатории после, можно больше. Зарплата по итогам собеседования.
1. Пептидный синтез в АО "Фарм-Синтез". RnD подразделение в Москве. Ведение своей тематики по пептидным векторам доставки. Отличная вакансия начального уровня в отличной проверенной Фарме. Скучно не будет.
контакт, и еще почта: [email protected]
2. Олигосинтез на ФБМФ, Институт Биофизики Будущего в Долгопрудном. Отдельная своя комната, надо будет обустраиваться. Все необходимое для старта по приборной части - олигосинтезаторы и ВЭЖХ. Можно не имея опыта в олигосинтезе, но общий опыт синтетика нужен. Химическое руководство и консультации - в НИИ СБМ, де-юре руководство - в Долгопе.
контакт, еще контакт
Две отличные вакансии "на вырост".
Ищем химиков-синтетиков.
Желаемый уровень - выпускник (лучше всего - РХТУ, МИТХТ, химфаки но рассмотрят всё) + 1-3 года опыта в синтетической лаборатории после, можно больше. Зарплата по итогам собеседования.
1. Пептидный синтез в АО "Фарм-Синтез". RnD подразделение в Москве. Ведение своей тематики по пептидным векторам доставки. Отличная вакансия начального уровня в отличной проверенной Фарме. Скучно не будет.
контакт, и еще почта: [email protected]
2. Олигосинтез на ФБМФ, Институт Биофизики Будущего в Долгопрудном. Отдельная своя комната, надо будет обустраиваться. Все необходимое для старта по приборной части - олигосинтезаторы и ВЭЖХ. Можно не имея опыта в олигосинтезе, но общий опыт синтетика нужен. Химическое руководство и консультации - в НИИ СБМ, де-юре руководство - в Долгопе.
контакт, еще контакт
Коллеги поддержали обсуждение российского производства: #блестящие_железки в Люмипробе.
Forwarded from Галя вам расскажет
... про российские производства для биотеха
Почти в любой молбиол лабе до 2020-х всё, от магнитной мешалки и весов до холодильника с реагентами, пластика и сложного оборудования, было европейских, в основном немецких, и американских брендов. И только неорганические соли стояли в банках с этикеткой "сделано в СССР" еще с 1970-х годов (ну а что им будет-то, как говорится).
Не то, чтобы в России ничего не пытались производить в эти годы, скорее не было особо спроса: запускать производство или делать штучное оборудование дорого и демпинга по цене не выйдет, а качество первых партий часто страдает, поэтому ферменты и олиги для ПЦР российские прижились (там рынок давала медицинская диагностика), а остальное существовало немножко параллельно, почти как "нишевая парфюмерия" для ценителей 😂. Не забываем и о рисках перевода протоколов на новые расходники для конечного пользователя: можно сэкономить на новинке 5 тыс рублей, а потом в помойку выкинуть других реактивов на 500.
Когда доллар был по 40 (олды тут 😎) сидеть на привычном западном было выгодно, по 80 уже не очень, но проще чем переходить на все новое, а с санкциями стало еще дороже и дольше (это при том, что "норма" ожидания поставки всегда была месяца 2-3).
Китайцы тоже не дурачки: очень дешевыми они были, когда качество страдало и выбирали между ними и западом, а сейчас они и уровень продукции подняли, и рынок трезво оценили. Уместна аналогия с китайским автопромом в РФ.
В итоге именно последние годы российское производство значительно приободрилось: потребители вынужденно стали патриотами, да и государство бывает как-то поддержит.
Я на нашу площадку привлекаю в том числе российских производителей, для них у меня всегда отдельное место не только в списке рабочих дел, но и в сердце ❤️😏. А еще больше я люблю посещать производства!
Вот на прошлой неделе побывала в Lumiprobe, ребята находятся в Москве и специализируются на флуоресцентных красителях, но и не только. Такая у них современное и хорошо оснащенное производство, прямо 😍 и полноценный RnD, и поставки сделанного у нас иностранным партнерам.
А еще я теперь знаю отечественных производителей лабораторного и медицинского пластика, наборов для выделения нуклеинок и различной диагностики, производителей антител (кстати, некоторые их давно делали, просто раньше вся партия уходила той же Сигме) создателей российских хроматографов, общелабораторного оборудования и микрофлюидных тест-систем. Ну круто же! Добавлю в комменты ещё примеров с фото)
#биотех
Ну неужели у нас в стране не могут сделать даже... ?
Почти в любой молбиол лабе до 2020-х всё, от магнитной мешалки и весов до холодильника с реагентами, пластика и сложного оборудования, было европейских, в основном немецких, и американских брендов. И только неорганические соли стояли в банках с этикеткой "сделано в СССР" еще с 1970-х годов (ну а что им будет-то, как говорится).
Не то, чтобы в России ничего не пытались производить в эти годы, скорее не было особо спроса: запускать производство или делать штучное оборудование дорого и демпинга по цене не выйдет, а качество первых партий часто страдает, поэтому ферменты и олиги для ПЦР российские прижились (там рынок давала медицинская диагностика), а остальное существовало немножко параллельно, почти как "нишевая парфюмерия" для ценителей 😂. Не забываем и о рисках перевода протоколов на новые расходники для конечного пользователя: можно сэкономить на новинке 5 тыс рублей, а потом в помойку выкинуть других реактивов на 500.
Когда доллар был по 40 (олды тут 😎) сидеть на привычном западном было выгодно, по 80 уже не очень, но проще чем переходить на все новое, а с санкциями стало еще дороже и дольше (это при том, что "норма" ожидания поставки всегда была месяца 2-3).
Китайцы тоже не дурачки: очень дешевыми они были, когда качество страдало и выбирали между ними и западом, а сейчас они и уровень продукции подняли, и рынок трезво оценили. Уместна аналогия с китайским автопромом в РФ.
В итоге именно последние годы российское производство значительно приободрилось: потребители вынужденно стали патриотами, да и государство бывает как-то поддержит.
Я на нашу площадку привлекаю в том числе российских производителей, для них у меня всегда отдельное место не только в списке рабочих дел, но и в сердце ❤️😏. А еще больше я люблю посещать производства!
Вот на прошлой неделе побывала в Lumiprobe, ребята находятся в Москве и специализируются на флуоресцентных красителях, но и не только. Такая у них современное и хорошо оснащенное производство, прямо 😍 и полноценный RnD, и поставки сделанного у нас иностранным партнерам.
А еще я теперь знаю отечественных производителей лабораторного и медицинского пластика, наборов для выделения нуклеинок и различной диагностики, производителей антител (кстати, некоторые их давно делали, просто раньше вся партия уходила той же Сигме) создателей российских хроматографов, общелабораторного оборудования и микрофлюидных тест-систем. Ну круто же! Добавлю в комменты ещё примеров с фото)
#биотех