CBRC_AUT Telegram 312
CBRC
🔹 دومین دوره از سمینارهای هفتگی آزمایشگاه زیست محاسباتی CBRC طراحی پروتئین 📊 جلسه اول : نقش ژن‌های ضروری در پایداری شبکه‌های برهمکنش پروتئین-پروتئین 👨🏻‍💻 ارائه دهنده: دکتر جواد رضایی چهارشنبه، ۲۶ آبان ماه ۱۴۰۰، ساعت ۱۸ 👥 شرکت در این جلسات برای عموم…
📝 #خلاصه_ارائه

📊 #نقش_ژن_های_ضروری_در_پایداری_شبکه_های_برهمکنش_پروتئین_پروتئین

در شبکه هاي زیستی نظیر شبکه‌هاي برهمکنش پروتئین-پروتئین، یافتن ژن‌ها و محصولات ژنی ضروري یک مسئله بسیار مهم به شمار میرود. شبکه‌هاي زیستی، نمونه‌هایی از یک سیستم پیچیده هستند که در آنها عملکرد سیستم، از نحوه تعامل بین مولفه‌هاي تشکیل دهنده‌اش تاثیر می‌پذیرد.
یکی از چالشهاي اساسی در رابطه با شبکه‌هاي پیچیده زیستی، یافتن مولفه‌هاي موثر و مهم آن‌ها است. براي سنجش اهمیت یک مولفه، معیارهاي بسیار زیادي نظیر معیارهاي مرکزیت، می‌توان در نظر گرفت. با این وجود، هیچ یک از این معیارها به عنوان یک معیار استاندارد و قطعی در سنجش میزان اهمیت یک مولفه در شبکه به حساب نمیآیند.
از این رو در مطالعات اخیر براي تشخیص میزان اهمیت یک مولفه، از میزان تخریبی که حذف آن مولفه میتواند در سیستم به وجود بیاورد، به عنوان یک معیار اصلی استفاده می‌شود.
در این سمینار، مسئله “پیدا کردن گرههاي حیاتی شبکه” مورد مطالعه قرار گرفته و دو الگوریتم جدید براي شناسایی گره‌هاي حیاتی که در پایداري شبکه موثر هستند، ارائه میگردد. نتایج به دست آمده، نمایانگر عملکرد بسیار بهتر الگوریتم‌هاي معرفی شده در حل مسئله بالا هستند. در حالی که الگوریتم پایه، مسئله را بر روي شبکه‌هایی با اندازه حداکثر 50 گره حل می‌نماید، الگوریتم پیشنهادي، مسئله را بر روي گراف‌هایی با 500 گره نیز به خوبی حل می‌نماید. همچنین، با ارائه یک الگوریتم ژنتیک براي حل مسئله نامبرده در شبکه‌هاي برهمکنش پروتئین-پروتئین، تعریفی جدید از گره‌هاي مرکزي یک شبکه ارائه کرده و قانون مرکزیت-کشندگی از نگاهی متفاوت مورد بررسی قرار می‌گیرد.

🧑🏻‍💻#ارائه_دهنده : #دکتر_جواد_رضایی
چهارشنبه، ۲۶آبان ۱۴۰۰، ساعت ۱۸

@CBRC_aut



tgoop.com/CBRC_aut/312
Create:
Last Update:

📝 #خلاصه_ارائه

📊 #نقش_ژن_های_ضروری_در_پایداری_شبکه_های_برهمکنش_پروتئین_پروتئین

در شبکه هاي زیستی نظیر شبکه‌هاي برهمکنش پروتئین-پروتئین، یافتن ژن‌ها و محصولات ژنی ضروري یک مسئله بسیار مهم به شمار میرود. شبکه‌هاي زیستی، نمونه‌هایی از یک سیستم پیچیده هستند که در آنها عملکرد سیستم، از نحوه تعامل بین مولفه‌هاي تشکیل دهنده‌اش تاثیر می‌پذیرد.
یکی از چالشهاي اساسی در رابطه با شبکه‌هاي پیچیده زیستی، یافتن مولفه‌هاي موثر و مهم آن‌ها است. براي سنجش اهمیت یک مولفه، معیارهاي بسیار زیادي نظیر معیارهاي مرکزیت، می‌توان در نظر گرفت. با این وجود، هیچ یک از این معیارها به عنوان یک معیار استاندارد و قطعی در سنجش میزان اهمیت یک مولفه در شبکه به حساب نمیآیند.
از این رو در مطالعات اخیر براي تشخیص میزان اهمیت یک مولفه، از میزان تخریبی که حذف آن مولفه میتواند در سیستم به وجود بیاورد، به عنوان یک معیار اصلی استفاده می‌شود.
در این سمینار، مسئله “پیدا کردن گرههاي حیاتی شبکه” مورد مطالعه قرار گرفته و دو الگوریتم جدید براي شناسایی گره‌هاي حیاتی که در پایداري شبکه موثر هستند، ارائه میگردد. نتایج به دست آمده، نمایانگر عملکرد بسیار بهتر الگوریتم‌هاي معرفی شده در حل مسئله بالا هستند. در حالی که الگوریتم پایه، مسئله را بر روي شبکه‌هایی با اندازه حداکثر 50 گره حل می‌نماید، الگوریتم پیشنهادي، مسئله را بر روي گراف‌هایی با 500 گره نیز به خوبی حل می‌نماید. همچنین، با ارائه یک الگوریتم ژنتیک براي حل مسئله نامبرده در شبکه‌هاي برهمکنش پروتئین-پروتئین، تعریفی جدید از گره‌هاي مرکزي یک شبکه ارائه کرده و قانون مرکزیت-کشندگی از نگاهی متفاوت مورد بررسی قرار می‌گیرد.

🧑🏻‍💻#ارائه_دهنده : #دکتر_جواد_رضایی
چهارشنبه، ۲۶آبان ۱۴۰۰، ساعت ۱۸

@CBRC_aut

BY CBRC




Share with your friend now:
tgoop.com/CBRC_aut/312

View MORE
Open in Telegram


Telegram News

Date: |

How to Create a Private or Public Channel on Telegram? Add up to 50 administrators Unlimited number of subscribers per channel With Bitcoin down 30% in the past week, some crypto traders have taken to Telegram to “voice” their feelings. ‘Ban’ on Telegram
from us


Telegram CBRC
FROM American