Мы знаем, когда все началось (1/3)
Группе рентгеноструктурного анализа в ИОХ РАН исполнилось пять лет, и на этой неделе мы расскажем вам о её становлении, уникальном приборном парке и людях, которые каждый день решают загадки кристаллических структур, отвечая на самые неожиданные вопросы сотрудников института. Можно сказать, что если химики — это волшебники, то рентгеноструктурщики — те, кто точно знает, как выглядит кролик в шляпе.
Развитие РСА в ИОХ РАН им. Н.Д. Зелинского
В июле 2019 году ИОХ РАН был запущен первый монокристальный дифрактометр -- "Quest D8" фирмы "Bruker". Ретгенодифракционные данные первых кристаллов были собраны и обработаны в июле 2019г н.с. Ерохиным Кириллом Сергеевичем, после расшифровки которых, и уточнения найденных структур, были получены первые приемлемые для публикации кристаллографические модели. 15 августа 2019 г основным кристаллографом становится Миняев Михаил Евгеньевич. С 3 сентября 2019г в Институте тестовом режиме заработал сервис по установлению кристаллических структур. В сентябре-октябре разрабатывался приемлемый протокол для съемки, обработки, проверки и архивирования структур, поэтому рождением группы РСА в ИОХ РАН можно считать конец сентября 2019 г.
Число новых структур малых молекул, установленных в ИОХ РАН постоянно растет: 128 (сентябрь –декабрь 2019г.), 233 (2020г.), 293 (2021г.), 398 (2022г.), 489 (2023г.), 470 (январь – 21.09.2024).
Электронный адрес группы РСА - [email protected]
Приборный парк
Приборный парк рентгеноструктурных исследований ИОХ РАН насчитывает два дифрактометра: "Quest D8" фирмы "Bruker" и "XtaLAB Synergy-S" фирмы "Rigaku".
Прибор "Quest D8" (год выпуска 2019, дизайн - 2013 г) является трёхкружным монокристаллным дифрактометром (оси ω, φ и θ; фиксированный угол χ). Он снабжен классической керамической рентгеновской трубкой "KFF" фирмы "Siemens" (излучение Mo Kα, λ=0.71073 Å), которой требуется водяное охлаждение, высокочувствительным детектором "Photon III" (возможность единичного счета рентгеновских фотонов) и низкотемпературной приставкой "CS800" фирмы "Oxford Cryosystems" (температурный диапазон 80-400K). Прибор позволяет проводить беззатворное сканирование по осям ω или φ (минимальное время экспозиции 1 сек/фрейм), работает с использованием классического программного обеспечения (ПО), включая программный пакет "Apex III". Данный прибор идеально подходит для исследования кристаллов элементоорганических соединений и крупных кристаллов органических соединений, для проведения прецизионных экспериментов. Рутинные эксперименты проводятся при 100K.
Четырёхкружный дифрактометр (оси ω, φ, κ, θ) прибор "XtaLAB Synergy-S" фирмы "Rigaku" (год выпуска 2021) снабжен малошумящим детектором последнего поколения HyPix-6000HE (широкий динамический диапазон, минимальное время экспозиции 0.05 сек/фрейм), двумя микрофокусными трубками "PhotonJet-S" (Mo Kα λ=0.71073 Å и Cu Kα λ=1.54184 Å), низкотемпературной приставкой "Oxford Cryosystems CS800" с автодоливом (температурный диапазон 80-400K). Имеется возможность смены классической гониометрической головки на интеллектуальную с системой оптического распознавания образца и автоматическим центрированием с использованием встроенной нейросети. Основное ПО состоит из двух программ: CrysAlisPro и Olex2. Прибор предназначен для установления строения маленьких кристаллов (линейные размеры до 0.005мм) органических молекул, кристаллов различных элементоорганических соединений и белков. В меньшей степени прибор предназначен для проведения прецизионных исследований распределения электронной плотности в кристалле. Поддержка осуществляется практически круглосуточно, а замеченные ошибки программного обеспечения исправляются в течение 10-14 дней. В частности, наша группа отловила несколько ошибок в ПО и получила благодарное письмо из центрально офиса разработки ПО. Кроме того, по нашему настоятельному предложению в новые версии ПО CrysAlisPro в 2023 году были добавлены расчет стратегии по точечной группе кристалла и использование собственной стратегии для предварительного эксперимента.
📃Текст - Миняев Михаил Евгеньевич
Группе рентгеноструктурного анализа в ИОХ РАН исполнилось пять лет, и на этой неделе мы расскажем вам о её становлении, уникальном приборном парке и людях, которые каждый день решают загадки кристаллических структур, отвечая на самые неожиданные вопросы сотрудников института. Можно сказать, что если химики — это волшебники, то рентгеноструктурщики — те, кто точно знает, как выглядит кролик в шляпе.
Развитие РСА в ИОХ РАН им. Н.Д. Зелинского
В июле 2019 году ИОХ РАН был запущен первый монокристальный дифрактометр -- "Quest D8" фирмы "Bruker". Ретгенодифракционные данные первых кристаллов были собраны и обработаны в июле 2019г н.с. Ерохиным Кириллом Сергеевичем, после расшифровки которых, и уточнения найденных структур, были получены первые приемлемые для публикации кристаллографические модели. 15 августа 2019 г основным кристаллографом становится Миняев Михаил Евгеньевич. С 3 сентября 2019г в Институте тестовом режиме заработал сервис по установлению кристаллических структур. В сентябре-октябре разрабатывался приемлемый протокол для съемки, обработки, проверки и архивирования структур, поэтому рождением группы РСА в ИОХ РАН можно считать конец сентября 2019 г.
Число новых структур малых молекул, установленных в ИОХ РАН постоянно растет: 128 (сентябрь –декабрь 2019г.), 233 (2020г.), 293 (2021г.), 398 (2022г.), 489 (2023г.), 470 (январь – 21.09.2024).
Электронный адрес группы РСА - [email protected]
Приборный парк
Приборный парк рентгеноструктурных исследований ИОХ РАН насчитывает два дифрактометра: "Quest D8" фирмы "Bruker" и "XtaLAB Synergy-S" фирмы "Rigaku".
Прибор "Quest D8" (год выпуска 2019, дизайн - 2013 г) является трёхкружным монокристаллным дифрактометром (оси ω, φ и θ; фиксированный угол χ). Он снабжен классической керамической рентгеновской трубкой "KFF" фирмы "Siemens" (излучение Mo Kα, λ=0.71073 Å), которой требуется водяное охлаждение, высокочувствительным детектором "Photon III" (возможность единичного счета рентгеновских фотонов) и низкотемпературной приставкой "CS800" фирмы "Oxford Cryosystems" (температурный диапазон 80-400K). Прибор позволяет проводить беззатворное сканирование по осям ω или φ (минимальное время экспозиции 1 сек/фрейм), работает с использованием классического программного обеспечения (ПО), включая программный пакет "Apex III". Данный прибор идеально подходит для исследования кристаллов элементоорганических соединений и крупных кристаллов органических соединений, для проведения прецизионных экспериментов. Рутинные эксперименты проводятся при 100K.
Четырёхкружный дифрактометр (оси ω, φ, κ, θ) прибор "XtaLAB Synergy-S" фирмы "Rigaku" (год выпуска 2021) снабжен малошумящим детектором последнего поколения HyPix-6000HE (широкий динамический диапазон, минимальное время экспозиции 0.05 сек/фрейм), двумя микрофокусными трубками "PhotonJet-S" (Mo Kα λ=0.71073 Å и Cu Kα λ=1.54184 Å), низкотемпературной приставкой "Oxford Cryosystems CS800" с автодоливом (температурный диапазон 80-400K). Имеется возможность смены классической гониометрической головки на интеллектуальную с системой оптического распознавания образца и автоматическим центрированием с использованием встроенной нейросети. Основное ПО состоит из двух программ: CrysAlisPro и Olex2. Прибор предназначен для установления строения маленьких кристаллов (линейные размеры до 0.005мм) органических молекул, кристаллов различных элементоорганических соединений и белков. В меньшей степени прибор предназначен для проведения прецизионных исследований распределения электронной плотности в кристалле. Поддержка осуществляется практически круглосуточно, а замеченные ошибки программного обеспечения исправляются в течение 10-14 дней. В частности, наша группа отловила несколько ошибок в ПО и получила благодарное письмо из центрально офиса разработки ПО. Кроме того, по нашему настоятельному предложению в новые версии ПО CrysAlisPro в 2023 году были добавлены расчет стратегии по точечной группе кристалла и использование собственной стратегии для предварительного эксперимента.
📃Текст - Миняев Михаил Евгеньевич
tgoop.com/ananikovlab/927
Create:
Last Update:
Last Update:
Мы знаем, когда все началось (1/3)
Группе рентгеноструктурного анализа в ИОХ РАН исполнилось пять лет, и на этой неделе мы расскажем вам о её становлении, уникальном приборном парке и людях, которые каждый день решают загадки кристаллических структур, отвечая на самые неожиданные вопросы сотрудников института. Можно сказать, что если химики — это волшебники, то рентгеноструктурщики — те, кто точно знает, как выглядит кролик в шляпе.
Развитие РСА в ИОХ РАН им. Н.Д. Зелинского
В июле 2019 году ИОХ РАН был запущен первый монокристальный дифрактометр -- "Quest D8" фирмы "Bruker". Ретгенодифракционные данные первых кристаллов были собраны и обработаны в июле 2019г н.с. Ерохиным Кириллом Сергеевичем, после расшифровки которых, и уточнения найденных структур, были получены первые приемлемые для публикации кристаллографические модели. 15 августа 2019 г основным кристаллографом становится Миняев Михаил Евгеньевич. С 3 сентября 2019г в Институте тестовом режиме заработал сервис по установлению кристаллических структур. В сентябре-октябре разрабатывался приемлемый протокол для съемки, обработки, проверки и архивирования структур, поэтому рождением группы РСА в ИОХ РАН можно считать конец сентября 2019 г.
Число новых структур малых молекул, установленных в ИОХ РАН постоянно растет: 128 (сентябрь –декабрь 2019г.), 233 (2020г.), 293 (2021г.), 398 (2022г.), 489 (2023г.), 470 (январь – 21.09.2024).
Электронный адрес группы РСА - [email protected]
Приборный парк
Приборный парк рентгеноструктурных исследований ИОХ РАН насчитывает два дифрактометра: "Quest D8" фирмы "Bruker" и "XtaLAB Synergy-S" фирмы "Rigaku".
Прибор "Quest D8" (год выпуска 2019, дизайн - 2013 г) является трёхкружным монокристаллным дифрактометром (оси ω, φ и θ; фиксированный угол χ). Он снабжен классической керамической рентгеновской трубкой "KFF" фирмы "Siemens" (излучение Mo Kα, λ=0.71073 Å), которой требуется водяное охлаждение, высокочувствительным детектором "Photon III" (возможность единичного счета рентгеновских фотонов) и низкотемпературной приставкой "CS800" фирмы "Oxford Cryosystems" (температурный диапазон 80-400K). Прибор позволяет проводить беззатворное сканирование по осям ω или φ (минимальное время экспозиции 1 сек/фрейм), работает с использованием классического программного обеспечения (ПО), включая программный пакет "Apex III". Данный прибор идеально подходит для исследования кристаллов элементоорганических соединений и крупных кристаллов органических соединений, для проведения прецизионных экспериментов. Рутинные эксперименты проводятся при 100K.
Четырёхкружный дифрактометр (оси ω, φ, κ, θ) прибор "XtaLAB Synergy-S" фирмы "Rigaku" (год выпуска 2021) снабжен малошумящим детектором последнего поколения HyPix-6000HE (широкий динамический диапазон, минимальное время экспозиции 0.05 сек/фрейм), двумя микрофокусными трубками "PhotonJet-S" (Mo Kα λ=0.71073 Å и Cu Kα λ=1.54184 Å), низкотемпературной приставкой "Oxford Cryosystems CS800" с автодоливом (температурный диапазон 80-400K). Имеется возможность смены классической гониометрической головки на интеллектуальную с системой оптического распознавания образца и автоматическим центрированием с использованием встроенной нейросети. Основное ПО состоит из двух программ: CrysAlisPro и Olex2. Прибор предназначен для установления строения маленьких кристаллов (линейные размеры до 0.005мм) органических молекул, кристаллов различных элементоорганических соединений и белков. В меньшей степени прибор предназначен для проведения прецизионных исследований распределения электронной плотности в кристалле. Поддержка осуществляется практически круглосуточно, а замеченные ошибки программного обеспечения исправляются в течение 10-14 дней. В частности, наша группа отловила несколько ошибок в ПО и получила благодарное письмо из центрально офиса разработки ПО. Кроме того, по нашему настоятельному предложению в новые версии ПО CrysAlisPro в 2023 году были добавлены расчет стратегии по точечной группе кристалла и использование собственной стратегии для предварительного эксперимента.
📃Текст - Миняев Михаил Евгеньевич
Группе рентгеноструктурного анализа в ИОХ РАН исполнилось пять лет, и на этой неделе мы расскажем вам о её становлении, уникальном приборном парке и людях, которые каждый день решают загадки кристаллических структур, отвечая на самые неожиданные вопросы сотрудников института. Можно сказать, что если химики — это волшебники, то рентгеноструктурщики — те, кто точно знает, как выглядит кролик в шляпе.
Развитие РСА в ИОХ РАН им. Н.Д. Зелинского
В июле 2019 году ИОХ РАН был запущен первый монокристальный дифрактометр -- "Quest D8" фирмы "Bruker". Ретгенодифракционные данные первых кристаллов были собраны и обработаны в июле 2019г н.с. Ерохиным Кириллом Сергеевичем, после расшифровки которых, и уточнения найденных структур, были получены первые приемлемые для публикации кристаллографические модели. 15 августа 2019 г основным кристаллографом становится Миняев Михаил Евгеньевич. С 3 сентября 2019г в Институте тестовом режиме заработал сервис по установлению кристаллических структур. В сентябре-октябре разрабатывался приемлемый протокол для съемки, обработки, проверки и архивирования структур, поэтому рождением группы РСА в ИОХ РАН можно считать конец сентября 2019 г.
Число новых структур малых молекул, установленных в ИОХ РАН постоянно растет: 128 (сентябрь –декабрь 2019г.), 233 (2020г.), 293 (2021г.), 398 (2022г.), 489 (2023г.), 470 (январь – 21.09.2024).
Электронный адрес группы РСА - [email protected]
Приборный парк
Приборный парк рентгеноструктурных исследований ИОХ РАН насчитывает два дифрактометра: "Quest D8" фирмы "Bruker" и "XtaLAB Synergy-S" фирмы "Rigaku".
Прибор "Quest D8" (год выпуска 2019, дизайн - 2013 г) является трёхкружным монокристаллным дифрактометром (оси ω, φ и θ; фиксированный угол χ). Он снабжен классической керамической рентгеновской трубкой "KFF" фирмы "Siemens" (излучение Mo Kα, λ=0.71073 Å), которой требуется водяное охлаждение, высокочувствительным детектором "Photon III" (возможность единичного счета рентгеновских фотонов) и низкотемпературной приставкой "CS800" фирмы "Oxford Cryosystems" (температурный диапазон 80-400K). Прибор позволяет проводить беззатворное сканирование по осям ω или φ (минимальное время экспозиции 1 сек/фрейм), работает с использованием классического программного обеспечения (ПО), включая программный пакет "Apex III". Данный прибор идеально подходит для исследования кристаллов элементоорганических соединений и крупных кристаллов органических соединений, для проведения прецизионных экспериментов. Рутинные эксперименты проводятся при 100K.
Четырёхкружный дифрактометр (оси ω, φ, κ, θ) прибор "XtaLAB Synergy-S" фирмы "Rigaku" (год выпуска 2021) снабжен малошумящим детектором последнего поколения HyPix-6000HE (широкий динамический диапазон, минимальное время экспозиции 0.05 сек/фрейм), двумя микрофокусными трубками "PhotonJet-S" (Mo Kα λ=0.71073 Å и Cu Kα λ=1.54184 Å), низкотемпературной приставкой "Oxford Cryosystems CS800" с автодоливом (температурный диапазон 80-400K). Имеется возможность смены классической гониометрической головки на интеллектуальную с системой оптического распознавания образца и автоматическим центрированием с использованием встроенной нейросети. Основное ПО состоит из двух программ: CrysAlisPro и Olex2. Прибор предназначен для установления строения маленьких кристаллов (линейные размеры до 0.005мм) органических молекул, кристаллов различных элементоорганических соединений и белков. В меньшей степени прибор предназначен для проведения прецизионных исследований распределения электронной плотности в кристалле. Поддержка осуществляется практически круглосуточно, а замеченные ошибки программного обеспечения исправляются в течение 10-14 дней. В частности, наша группа отловила несколько ошибок в ПО и получила благодарное письмо из центрально офиса разработки ПО. Кроме того, по нашему настоятельному предложению в новые версии ПО CrysAlisPro в 2023 году были добавлены расчет стратегии по точечной группе кристалла и использование собственной стратегии для предварительного эксперимента.
📃Текст - Миняев Михаил Евгеньевич
BY AnanikovLab
Share with your friend now:
tgoop.com/ananikovlab/927