The Botanist

Сканирование гербария

История из гербария ботанического института В. Л. Комарова, РАН — LE.

В России в тройку самых крупных гербариев входят:
1. LE — гербарий БИН РАН, ≈ 6 млн. образцов;
2. MW — гербарий МГУ, ≈ 1 млн. образцов;
3. LECB — гербарий кафедры ботаники СПбГУ, ≈ 800 тыс. образцов.
(данные основаны на лекции А.П. Серегина «Что мы знаем о флоре России»).

Гербарий МГУ отсканирован полностью, тогда как в гербарии LE отсканировано около 165 тыс образцов (данные на 03.04.23), то есть около 2,5%.

Ваша покорная слуга (то есть я) также успела приложить руку к этому процессу. На данный момент я занимаюсь изучением гибридизации у осок (осока, к слову, один из крупнейших родов цветковых, насчитывающий 2000 видов), и мне бы хотелось, чтобы нашей коллекцией пользовались по всему миру.

Для того, чтобы образец попал в базу, ему сначала необходимо присвоить баркод (штрихкод), прямо как в магазине на продуктах.

Затем с помощью специальной установки (сканером назвать это сложно) он фотографируется и отправляется в интернет-базу, а система самостоятельно распознает и присваивает баркод записи в системе. Все фотографии делают в очень хорошем разрешении, чтобы можно было рассмотреть детали.

Самое трудоемкое в данной работе — это внесение данных с этикетки в систему. Для этого различные гербарии создают сервисы для волонтеров, которые помогают в этом процессе. Мы уже ранее рассказывали вам про помогатор гербария МГУ.

Для чего в принципе важно сканировать гербарий?
Это огромная коллекция биологического материала, и возможно, сейчас мы даже не знаем всех его применений, потому как еще 50 лет назад никто и представить не мог, что мы сможем выделять ДНК и проводить молекулярные реконструкции.

Гербарий в первую очередь содержит данные о распространении видов (в том числе и во временной прогрессии), а также их морфологии.

Доступность гербария для любого исследователя планеты сильно упрощает жизнь, ведь так гербарий всегда под рукой. Словно база статей или книг по всему миру. К слову, о книгах и не только, наша подборка полезных ресурсов.

#гербарий

www.tgoop.com/in_plantae_veritas/557

623 viewsValentina Domashkina, edited  Apr 7, 2023 at 19:02

Сканирование гербария

История из гербария ботанического института В. Л. Комарова, РАН — LE.

В России в тройку самых крупных гербариев входят:
1. LE — гербарий БИН РАН, ≈ 6 млн. образцов;
2. MW — гербарий МГУ, ≈ 1 млн. образцов;
3. LECB — гербарий кафедры ботаники СПбГУ, ≈ 800 тыс. образцов.
(данные основаны на лекции А.П. Серегина «Что мы знаем о флоре России»).

Гербарий МГУ отсканирован полностью, тогда как в гербарии LE отсканировано около 165 тыс образцов (данные на 03.04.23), то есть около 2,5%.

Ваша покорная слуга (то есть я) также успела приложить руку к этому процессу. На данный момент я занимаюсь изучением гибридизации у осок (осока, к слову, один из крупнейших родов цветковых, насчитывающий 2000 видов), и мне бы хотелось, чтобы нашей коллекцией пользовались по всему миру.

Для того, чтобы образец попал в базу, ему сначала необходимо присвоить баркод (штрихкод), прямо как в магазине на продуктах.

Затем с помощью специальной установки (сканером назвать это сложно) он фотографируется и отправляется в интернет-базу, а система самостоятельно распознает и присваивает баркод записи в системе. Все фотографии делают в очень хорошем разрешении, чтобы можно было рассмотреть детали.

Самое трудоемкое в данной работе — это внесение данных с этикетки в систему. Для этого различные гербарии создают сервисы для волонтеров, которые помогают в этом процессе. Мы уже ранее рассказывали вам про помогатор гербария МГУ.

Для чего в принципе важно сканировать гербарий?
Это огромная коллекция биологического материала, и возможно, сейчас мы даже не знаем всех его применений, потому как еще 50 лет назад никто и представить не мог, что мы сможем выделять ДНК и проводить молекулярные реконструкции.

Гербарий в первую очередь содержит данные о распространении видов (в том числе и во временной прогрессии), а также их морфологии.

Доступность гербария для любого исследователя планеты сильно упрощает жизнь, ведь так гербарий всегда под рукой. Словно база статей или книг по всему миру. К слову, о книгах и не только, наша подборка полезных ресурсов.

#гербарий

BY The Botanist