نمودار راماچاندران چیست؟ و چه کاربردی در پروژه های مدلسازی پروتئین و ارزیابی ساختاری پروتئین و بررسی برهمکنش های پروتئین-پروتئین دارد؟ برای پاسخ به این سوالات و کسب اطلاعت بیشتر در خصوص نمودار راماچاندران ادامه مطلب را مشاهده کنید.
.....ادامه مطلب......
تهیه و تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1729
.....ادامه مطلب......
تهیه و تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1729
👍5🔥1👏1
اولین مقاله کوتاه جهان برای اولین بار در سال 1966 منتشر شد که فقط یک رفرنس داشت و یک معادله ریاضی را توصیف می کرد. مقاله لندر و پارکین درباره یک حدس توسط اویلر (مرتبط با آخرین قضیه فرما)، احتمالاً رویای هر کسی است که تا به حال مقاله‌ای نوشته است این چنین پابلیشی است. این مقاله به یک سوال جالب و مهم پاسخ می‌دهد، بدون هیچ شک و تردیدی صحیح است، فهم آن آسان است و تنها دو جمله طول دارد. این مقاله نمونه‌ای عالی از یک کار علمی مختصر و قدرتمند است که به زیبایی اهمیت و تأثیر یک اثبات ساده و در عین حال عمیق را نشان می‌دهد. این مقاله مصداق بارز کم گوی و گزیده گوی خودمون :)
مشاهده متن مقاله
@irbioinformatics
#دانستنی‌ها
مشاهده متن مقاله
@irbioinformatics
#دانستنی‌ها
👍6😁1
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
اولین مقاله کوتاه جهان برای اولین بار در سال 1966 منتشر شد که فقط یک رفرنس داشت و یک معادله ریاضی را توصیف می کرد. مقاله لندر و پارکین درباره یک حدس توسط اویلر (مرتبط با آخرین قضیه فرما)، احتمالاً رویای هر کسی است که تا به حال مقاله‌ای نوشته است این چنین پابلیشی…
در سال 2005 تلاش دیگری برای چاپ کوتاه ترین مقاله جهان توسط دو ریاضی دان به نام های Conway و Soifer انجام شد و ماحصل کار تحقیقاتی خود را در دو کلمه و دو شکل به چاپ رساندند و به این ترتیب رکورد کوتاه ترین مقاله جهان را به نام خود ثبت کردند.
...مشاهده متن مقاله...
@irbioinformatics
#دانستنی‌ها
...مشاهده متن مقاله...
@irbioinformatics
#دانستنی‌ها
👍6😁2
آیا می‌توانید مقاله‌ای معنادار با کمتر از دو کلمه بنویسید؟ 😂احتمالاً نه. با این حال، الان می خوام به یک گزارش موردی جالب اشاره کنم که نمونه‌ای شدید از بن‌بست نویسندگی😂😂 است و سهمی مهم اما صفر کلمه‌ای به منابع علمی اضافه می‌کند. بله دوستان در سال 1974 این اتفاق افتاده و ی بزرگواری به اسم آقای دنیس اپر برداشته همچین مقاله ای با عنوان درمان ناموفق خوددرمانی یک مورد "بن‌بست نویسندگی" چاپ کرده و داوری هم شده و کامنت هم گرفته از داور مقالش.
مشاهده متن مقاله
@irbioinformatics
#دانستنی‌ها
مشاهده متن مقاله
@irbioinformatics
#دانستنی‌ها
👍7😁2
آخرین بن بست نویسندگان مقالات علمی در سال 2016 اتفاق افتاده وقتی که جناب گولدبرگ و همکاران مقاله ای با عنوان A comprehensive overview of chemical-free consumer products میفرستن ژورنال نیچر شیمی و فقط ی چیکده و دو سه تا رفرنس داشته😂😂 . اگرچه نیچر بن بست نویسنده ها رو قبول نکرده ولی در قالب یک پست روی وبلاگ نیچر ادیتورها کلی راجبش نوشتن و ظاهرا براشون جالب بوده :) جناب گولدبرگ نمونه بارز " من می توانم" هستش چرا که برداشته مقالش به المانی برگردونده و توی ی ژورنال آلمانی که زیر مجموعه انتشارات wiley هستش چاپش کرده. شاید فک کنین این مقالات برای مزاح اینطوری چاپ شدن، ولی در واقعا این سبک چاپ و ارسال مقاله به مجلات به منظور نقد یا زیر سوال بردن یک موضوع تخصصی است که در یک فیلد مشخصی از علم محققان روی آن کار می کنند...
لینک مقاله در انتشارات Wiley
لینک توضیحات ژورنال نیچر شیمی
@irbioinformatics
#دانستنی‌ها
لینک مقاله در انتشارات Wiley
لینک توضیحات ژورنال نیچر شیمی
@irbioinformatics
#دانستنی‌ها
👍5😁3
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
Photo
سیستم ویرایش ژنومی یوکاریوتی مبتنی بر Fanzor در مقابل CRISPR-Cas
در پست های قبلی در خصوص سیستم ویرایش ژنومی یوکاریوتی مبتنی بر Fanzor# اطلاعاتی پیرامون چگونگی عملکرد این سیستم ویرایش ژنومی و اساس کار آن در اختیار مخاطبان عزیز قرار دادیم. در ادامه چالش ها و مزیت های سیستم ویرایش ژنومی مبتنی بر آنزیم های HERMES# و FANZOR در مقایسه با سیستم CRISPR از چند مقاله علمی و پایگاه خبری بین المللی مورد تجزیه و تحلیل و ارزیابی قرار گرفته است تا مقایسات ابتدایی در این زمینه انجام شود. برای مطالعه این یاداشت بر روی لینک زیر کلیک کنید. برای مشاهده تصاویر با وضوح واقعی این پست را بر روی کامپیوتر خود باز کنید.
...ادامه مطلب...
@irbioinformatics
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1735
در پست های قبلی در خصوص سیستم ویرایش ژنومی یوکاریوتی مبتنی بر Fanzor# اطلاعاتی پیرامون چگونگی عملکرد این سیستم ویرایش ژنومی و اساس کار آن در اختیار مخاطبان عزیز قرار دادیم. در ادامه چالش ها و مزیت های سیستم ویرایش ژنومی مبتنی بر آنزیم های HERMES# و FANZOR در مقایسه با سیستم CRISPR از چند مقاله علمی و پایگاه خبری بین المللی مورد تجزیه و تحلیل و ارزیابی قرار گرفته است تا مقایسات ابتدایی در این زمینه انجام شود. برای مطالعه این یاداشت بر روی لینک زیر کلیک کنید. برای مشاهده تصاویر با وضوح واقعی این پست را بر روی کامپیوتر خود باز کنید.
...ادامه مطلب...
@irbioinformatics
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1735
👍5❤2👏1😁1
اهمیت تولید ارقام فلفل بی دانه به عنوان یک سرمایه گذاری مطمن و سودآور
تهیه و تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
تولید ارقام فلفل بی‌دانه به عنوان یک سرمایه‌گذاری مطمئن و سودآور شناخته می‌شود، زیرا این محصولات به دلیل ویژگی‌هایی مانند کیفیت بالا، طعم بهتر، ماندگاری طولانی‌تر و جذابیت بصری (رنگ‌های متنوع)، تقاضای بالایی در بازارهای داخلی و بین‌المللی دارند. با استفاده از فناوری‌های نوآورانه مانند کشت بافت، ژنومیکس و ترانسکریپتومیکس، می‌توان ارقامی مقاوم به بیماری‌ها و تنش‌های محیطی تولید کرد که هزینه‌های تولید را کاهش و سودآوری را افزایش می‌دهند. این ویژگی‌ها باعث می‌شود فلفل بی‌دانه به عنوان یک محصول با ارزش افزوده بالا، گزینه‌ای ایده‌آل برای سرمایه‌گذاری در بخش کشاورزی باشد.
...ادامه مطلب...
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1738
تهیه و تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
تولید ارقام فلفل بی‌دانه به عنوان یک سرمایه‌گذاری مطمئن و سودآور شناخته می‌شود، زیرا این محصولات به دلیل ویژگی‌هایی مانند کیفیت بالا، طعم بهتر، ماندگاری طولانی‌تر و جذابیت بصری (رنگ‌های متنوع)، تقاضای بالایی در بازارهای داخلی و بین‌المللی دارند. با استفاده از فناوری‌های نوآورانه مانند کشت بافت، ژنومیکس و ترانسکریپتومیکس، می‌توان ارقامی مقاوم به بیماری‌ها و تنش‌های محیطی تولید کرد که هزینه‌های تولید را کاهش و سودآوری را افزایش می‌دهند. این ویژگی‌ها باعث می‌شود فلفل بی‌دانه به عنوان یک محصول با ارزش افزوده بالا، گزینه‌ای ایده‌آل برای سرمایه‌گذاری در بخش کشاورزی باشد.
...ادامه مطلب...
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1738
👍5👏2🐳1
Hengame Sepidedam Khorose Sahari
MohammadReza Shajarian | موزیکدل
از آﻣﺪن و رﻓﺘﻦ ﻣﺎ ﺳﻮدی ﻛﻮ
وز ﺗﺎرِ اﻣﺪ ﻋﻤﺮِ ﻣﺎ ﭘﻮدی ﻛﻮ
چندین سر و پای نازنینان جهان
می سوزد و ﺧﺎک می شود دودی ﻛﻮ
هنگام سپیده‌دم خروس سحری
دانی که چرا همی کند نوحه‌گری؟
یعنی که نمودند در آیینهٔ صبح
کز عمر شبی گذشت و تو بی‌خبری
وز ﺗﺎرِ اﻣﺪ ﻋﻤﺮِ ﻣﺎ ﭘﻮدی ﻛﻮ
چندین سر و پای نازنینان جهان
می سوزد و ﺧﺎک می شود دودی ﻛﻮ
هنگام سپیده‌دم خروس سحری
دانی که چرا همی کند نوحه‌گری؟
یعنی که نمودند در آیینهٔ صبح
کز عمر شبی گذشت و تو بی‌خبری
👍5🔥1
مکانیسم Leaky scanning (اسکن ناقص)
مکانیسم اسکن ناقص در ویروس ها پدیده‌ای است که در آن کدون شروع ضعیف روی mRNA گاهی اوقات توسط ریبوزوم در طول آغاز ترجمه نادیده گرفته می‌شود. زیرواحد ریبوزومی 40S به اسکن ادامه داده و به کدون شروع دیگری می‌رسد. کدون شروع ضعیف می‌تواند یک ACG یا یک ATG در زمینه‌ای با اجماع ضعیف Kozak باشد.
@irbioinformatics
به این ترتیب، یک mRNA می‌تواند چندین پروتئین مختلف را کد کند اگر کدون‌های AUG در یک قاب خوانش نباشند، یا پروتئین‌هایی با انتهای N متفاوت تولید کند اگر کدون‌های AUG در یک قاب خوانش قرار داشته باشند.
مکانیسم اسکن ناقص در ویروس ها پدیده‌ای است که در آن کدون شروع ضعیف روی mRNA گاهی اوقات توسط ریبوزوم در طول آغاز ترجمه نادیده گرفته می‌شود. زیرواحد ریبوزومی 40S به اسکن ادامه داده و به کدون شروع دیگری می‌رسد. کدون شروع ضعیف می‌تواند یک ACG یا یک ATG در زمینه‌ای با اجماع ضعیف Kozak باشد.
@irbioinformatics
به این ترتیب، یک mRNA می‌تواند چندین پروتئین مختلف را کد کند اگر کدون‌های AUG در یک قاب خوانش نباشند، یا پروتئین‌هایی با انتهای N متفاوت تولید کند اگر کدون‌های AUG در یک قاب خوانش قرار داشته باشند.
1- Raybova et al. 2006
2- دانلود مستقیم مقاله از این لینک
👍6👀1
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
تحریم ایران توسط ایسوس 🔹ایسوس ایران را تحریم کرد و دسترسی کاربران به سایت ASUS مسدود شد
دوستان برای رفع این مشکل سایت هایی که کاربران ایرانی را تحریم می کنند می توانید از شکن استفاده کنید و با تغییر DNS و IP خود بدون نیاز به فیلترشکن و تنها با چند کلیک ساده و اعمال تنظیمات بر روی سیستم عامل خود از خدمات این وبسایت ها نیز مجددا استفاده کنید. برای آشنایی با چگونی استفاده از شکن برای دور زدن سایت ها و پلتفرم هایی که کاربران ایرانی را تحریم می کنند از راهنمایی ارائه شده در لینک زیر استفاده کنید
https://shecan.ir/
https://shecan.ir/
👍7❤3
آیا شما با دانشجویان خود در طول روز یک فنجان چایی می نوشید؟
یکی از برندگان جایزه نوبل که واقعاً از چای بعدازظهر خود لذت می‌برد، فیزیک‌دان جی.جی. تامسون بود. تامسون در سال ۱۹۰۶ جایزه نوبل فیزیک را برای مطالعات خود روی پرتوهای کاتدی که به کشف الکترون منجر شد، دریافت کرد.
@irbioinformatics
وقتی او رهبر دانشجویان تحقیقاتی در آزمایشگاه کاوندیش در دانشگاه کمبریج شد، تامسون یک زمان کوتاه برای نوشیدن چایی روزانه تعیین کرد که در آن همه دانشجویان تحقیقاتی برای استراحت و نوشیدن چای دعوت می‌شدند. این استراحت همراه با چای به یک آیین مهم در طول روز در آزمایشگاه تبدیل شد. این فرصتی به دانشجویان تحقیقاتی می‌داد تا آزادانه در مورد موضوعاتی مانند علم و سیاست بحث کنند. بسیاری از دانشجویان بعداً از این استراحت‌ها سپاسگزار بودند، جایی که تامسون هم در تحقیقات آن‌ها مشارکت می‌کرد و هم به رفاه آن‌ها توجه داشت.
یکی از برندگان جایزه نوبل که واقعاً از چای بعدازظهر خود لذت می‌برد، فیزیک‌دان جی.جی. تامسون بود. تامسون در سال ۱۹۰۶ جایزه نوبل فیزیک را برای مطالعات خود روی پرتوهای کاتدی که به کشف الکترون منجر شد، دریافت کرد.
@irbioinformatics
وقتی او رهبر دانشجویان تحقیقاتی در آزمایشگاه کاوندیش در دانشگاه کمبریج شد، تامسون یک زمان کوتاه برای نوشیدن چایی روزانه تعیین کرد که در آن همه دانشجویان تحقیقاتی برای استراحت و نوشیدن چای دعوت می‌شدند. این استراحت همراه با چای به یک آیین مهم در طول روز در آزمایشگاه تبدیل شد. این فرصتی به دانشجویان تحقیقاتی می‌داد تا آزادانه در مورد موضوعاتی مانند علم و سیاست بحث کنند. بسیاری از دانشجویان بعداً از این استراحت‌ها سپاسگزار بودند، جایی که تامسون هم در تحقیقات آن‌ها مشارکت می‌کرد و هم به رفاه آن‌ها توجه داشت.
👍12🍾1
#معرفی_کتاب
برای مدت زمان طولانی، دانشمندان به استفاده از استعاره‌های ساده‌انگارانه‌ای راضی شده اند که سیستم‌های زنده را صرفاً مانند ماشین‌ها ی عمل‌کننده توصیف کنند، این را Philip Ball، نویسنده کتاب How Life Works می‌گوید.
با این حال، مهم است که درباره پیچیدگی زیست‌شناسی — از جمله آنچه نمی‌دانیم — شفاف باشیم، زیرا درک عمومی ما از آن بر سیاست‌ها، مراقبت‌های بهداشتی و اعتماد به علم تأثیر می‌گذارد.
بال می‌نویسد: «تا زمانی که اصرار داریم سلول‌ها رایانه‌ها و ژن‌ها کدهای آن‌ها هستند، زندگی ممکن است به‌مانند چیزی باشد که با جادوی نامرئی پوشیده شده است.» اما واقعیت به مراتب جالب‌تر و شگفت‌انگیزتر است
پیشنهاد میکنیم این کتاب فوق العاده جالب و خواندنی را مطالعه کنید چراکه متنش در مقابل تصورات ساده انگارانه از دنیای مولکولی ایستادگی می کنه.
...بیشتر بخوانید...
...دانلود نسخه epub...
...دانلود نسخه pdf...
برای مدت زمان طولانی، دانشمندان به استفاده از استعاره‌های ساده‌انگارانه‌ای راضی شده اند که سیستم‌های زنده را صرفاً مانند ماشین‌ها ی عمل‌کننده توصیف کنند، این را Philip Ball، نویسنده کتاب How Life Works می‌گوید.
با این حال، مهم است که درباره پیچیدگی زیست‌شناسی — از جمله آنچه نمی‌دانیم — شفاف باشیم، زیرا درک عمومی ما از آن بر سیاست‌ها، مراقبت‌های بهداشتی و اعتماد به علم تأثیر می‌گذارد.
بال می‌نویسد: «تا زمانی که اصرار داریم سلول‌ها رایانه‌ها و ژن‌ها کدهای آن‌ها هستند، زندگی ممکن است به‌مانند چیزی باشد که با جادوی نامرئی پوشیده شده است.» اما واقعیت به مراتب جالب‌تر و شگفت‌انگیزتر است
پیشنهاد میکنیم این کتاب فوق العاده جالب و خواندنی را مطالعه کنید چراکه متنش در مقابل تصورات ساده انگارانه از دنیای مولکولی ایستادگی می کنه.
...بیشتر بخوانید...
...دانلود نسخه epub...
...دانلود نسخه pdf...
❤5👍2👏1