آیا ابزارهای شناسایی هوش مصنوعی می‌توانند صداقت آکادمیک را به خطر بیندازند؟این مقاله که در تاریخ 12 دسامبر 2024 چاپ شده است نشان می‌دهد که چگونه نتایج مثبت کاذب، به‌طور ناعادلانه افراد غیرانگلیسی‌زبان و سبک‌های نگارشی منحصربه‌فرد را هدف قرار می‌دهند و باعث ایجاد اضطراب و بی‌اعتمادی می‌شوند.
ترجمه و تدوین: ح.رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
21 دسامبر 2024

🟩ادامه مطلب....

🟩دانلود مقاله....

چکیده مقاله:
این مقاله با بررسی تجربیات پژوهشگرانی از مؤسسات مختلف در سراسر جهان به بررسی این موضوع می‌پردازد که چگونه ابزارهای شناسایی هوش مصنوعی، که با هدف حفظ صداقت آکادمیک طراحی شده‌اند، ممکن است با اتهام ناعادلانه به پژوهشگران در مورد سرقت علمی، نتیجه معکوس بدهند. یافته‌های این مقاله نشان می‌دهد که نتایج مثبت کاذب این ابزارها به طور نامتناسبی افراد غیرانگلیسی‌زبان و پژوهشگرانی با سبک‌های نگارشی متمایز را هدف قرار می‌دهند. این موضوع باعث اتهامات بی‌اساسی می‌شود که می‌تواند آسیب جدی به مسیر حرفه‌ای آنها وارد کند.
@irbioinformatics
همچنین در این مقاله چندین مشکل اساسی در ابزارهای شناسایی هوش مصنوعی شناسایی شده است، از جمله تعصب‌های الگوریتمی، آسیب‌پذیری در برابر دست‌کاری، و عدم درک زمینه ای. این نواقص نه تنها اثربخشی این ابزارها را کاهش می‌دهد بلکه فضایی از اضطراب و بی‌اعتمادی را در میان جوامع دانشگاهی ایجاد می‌کند. در حالی که پژوهشگران متعهد به حفظ صداقت در نوشتار خود هستند، ابزارهای شناسایی هوش مصنوعی ممکن است با نتایج ناقص خود، اعتبار آنها را خدشه‌دار کرده و آنها را به اشتباه به تقلب یا فریب متهم کنند.
@irbioinformatics
این مقاله پیشنهاد می‌کند که مؤسسات باید دستورالعمل‌ها و محدودیت‌های واضحی برای استفاده از هوش مصنوعی و ابزارهای شناسایی آن در کارهای علمی تعیین کنند. همچنین، پژوهشگران باید شفاف باشند و اعلام کنند که چگونه هوش مصنوعی به فرایند نوشتار آنها کمک کرده است. اگرچه ابزارهای شناسایی هوش مصنوعی دارای ارزش هستند، اما به دلیل خطر نتایج مثبت کاذب و محدودیت‌های دیگر، باید با نگاه منتقدانه به آنها نگریست. در واقع، ابزارهای شناسایی هوش مصنوعی باید مکمل تصمیم‌گیری انسانی باشند، نه جایگزین آن. چنین رویکردی می‌تواند محیط آکادمیکی عادلانه‌تر ایجاد کند که نوآوری را با صداقتی که پژوهشگران برای آن تلاش می‌کنند، متعادل سازد.

مکانیسم‌های ترمیم PSII (فتوسیستم 2) در شرایط نور شدید در جلبک کلامیدوموناس
ترجمه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
منبع:
Structural basis for an early stage of the photosystem II repair cycle in Chlamydomonas reinhardtii

ادامه مطلب...

در طی فتوسنتز اکسیژن‌زا، فتوسیستم II (PSII) ماشین‌آلات اصلی سوپرمولکولی است که مسئول تولید نیروی کاهنده با استفاده از انرژی نور و اکسیداسیون مولکول‌های آب به اکسیژن و پروتون‌ها می‌باشد. هنگامی که برانگیختگی اضافی تجمع می‌یابد و منجر به تشکیل گونه‌های واکنش‌پذیر اکسیژن (ROS) می‌شود، اجزای حمل و نقل الکترون در PSII ممکن است به دلیل غیرفعال شدن مستقیم خوشه منگنز توسط تابش اشعه ماوراء بنفش یا نور مرئی و آسیب‌های اکسیداتیو ناشی از ROS مختل شوند. آسیب به اجزای هسته‌ای PSII و مجموعه‌های محیطی برداشت نور II (LHCII) به علت استرس اکسیداسیون نوری در سطح مولکولی در مجموعه‌ای از مطالعات در حال حاضر شناسایی شده است.
@irbioinformatics
برای بازسازی عملکرد PSII پس از آسیب، فتوتروف‌های اکسیژن‌زا یک فرآیند پیچیده به نام چرخه ترمیم PSII را توسعه داده‌اند. این چرخه در ارگانیسم‌های مختلف فتوسنتزی اکسیژن‌زا از سیانوباکتری‌ها تا گیاهان عالی نسبتاً محافظت شده است. در جلبک‌های سبز و گیاهان عالی، چرخه ترمیم PSII ممکن است شامل مراحل زیر باشد: الف) جداسازی LHCII از ابرمجموعه PSII-LHCII، ب) تجزیه آپوپروتئین آسیب‌دیده D1، پ) بازسازی زیرواحد D1، و ت) بازسازی مجدد PSII-SC. در حال حاضر، بیش از 60 عامل کمکی در چرخه ترمیم PSII و ساخت مجدد آن گزارش شده است، که نشان می‌دهد این فرآیند ممکن است یک سیستم پیچیده و پویا با چندین حالت میانه را دربرگیرد.
@irbioinformatics
در شرایط نور شدید، آنتن‌های محیطی PSII (شامل تریمرهای LHCII، CP29، CP26 و CP24) ممکن است از هسته PSII جدا شوند. این فرآیند جداسازی، ورود انرژی تحریک شده به مرکز واکنش PSII آسیب‌دیده را کاهش می‌دهد و همچنین اجازه می‌دهد که پس از آن هسته PSII جدا شده و پروتئین D1 تجزیه شود. مطالعات قبلی نشان داده‌اند که فسفوریلاسیون پروتئین‌های هسته PSII توسط Stn8 و فسفوریلاسیون CP29 توسط Stn7 ممکن است به جداسازی LHCII‌ها از PSII تحت نور شدید کمک کند. جزئیات مکانیزمی بیشتر در مورد چگونگی جداسازی LHCII از PSII هنوز نامشخص است.
@irbioinformatics
پس از جداسازی آنتن‌های محیطی، ترمیم مؤثر PSII آسیب‌دیده همچنین نیازمند تجزیه بیشتر دیمری PSII (PSII-D) و منومر PSII (PSII-M) است. محققان دریافتند که پروتئین MPH2، که یک پروتئین موجود در کپسول لومن تیلاکوئید کلروپلاست است، جداسازی PSII-M را تحریک کرده و تجزیه D1 را در فرآیند ترمیم PSII افزایش می‌دهد. علاوه بر این، آزادسازی PsbO از هسته PSII می‌تواند باعث تجزیه پروتئین D1 آسیب‌دیده شود و بنابراین برای فرآیند ترمیم PSII فوق العاده مهم است. هیدرولیز GTP توسط PsbO و تجزیه PsbO آزاد ممکن است این فرآیند را تسهیل کند. با این حال، زیرواحد PsbO در Chlamydomonas reinhardtii فاقد دامینGTPase است، و عواملی که در مرحله ابتدایی ترمیم PSII در جداسازی PsbO دخیل هستند هنوز به صورت یک راز در این موجود باقی مانده اند.
@irbioinformatics
غیرفعال شدن آسیب نوری و آزادسازی خوشه منگنز از کمپلکس oxygen-evolving complex (OEC) یک رویداد اولیه در فرآیند اختلالات فوتونی کمپلکس PSII است و می‌تواند منجر به تشکیل P680+ طولانی‌مدت و خطرناک شود. چندین مکانیسم برای جلوگیری از پروسه طولانی‌مدت P680+ کشف شده است، از جمله فرآیند ترکیب مجدد بار مستقیم و حمل و نقل الکترون‌های چرخه‌ای PSII. علاوه بر این، یک پروتئین مرتبط با ساخت PSII به نام Psb28 گزارش شده است که سایت اتصال QB را تغییر داده و محیط هماهنگی آهن غیرهمی را اصلاح می‌کند، و به این ترتیب، کمپلکس هسته‌ای PSII را به یک وضعیت محافظتی نوری تبدیل می‌کند.
@irbioinformatics
در این مقاله، ویژگی‌های بیوشیمیایی، ساختاری و عملکردی یک کمپلکس میانی از چرخه ترمیم PSII گزارش شده است. سه عامل پروتئینی مرتبط با یک منومر آسیب‌دیده PSII، به نام‌های عامل غنی‌شده تیلاکوئید 14 (TEF14)، عامل ترمیم فتوسیستم II 1 (PRF1) و عامل ترمیم فتوسیستم II 2 (PRF2) شناسایی و از طریق استفاده از موتانت‌های knockout که با روش CRISPR-Cas9 تولید شده‌اند، و عملکرد آنها شناسایی و مشخص شده است. همچنین، یک مولکول α-توکوفرول کینون در یک ناحیه سطح استروما نزدیک به PsbF شناسایی شده است که ممکن است به عنوان یک پذیرنده الکترون محافظتی فوتویی از سیتوکروم b559 در فرآیند ترمیم PSII عمل کند.

دو درمان بالقوه برای سرطان به همراه مقایسه کارایی آنها با یکدیگر
@irbioinformatics

#برگی_از_تاریخ
وقتی به چراغ‌های تزئینی درخت کریسمس نگاه می‌کنید، به یاد برندگان جایزه نوبل فیزیک، ایسامو آکاساکی، هیروشی آمانو و شوجی ناکامورا باشید که دیود نورافشان آبی (LED) را اختراع کردند و چراغ‌های سفید، کم‌مصرف و بادوام را ساختند. در LED، برق مستقیماً به ذرات نور (فوتون‌ها) تبدیل می‌شود که منجر به افزایش بازدهی در مقایسه با دیگر منابع نوری می‌شود، جایی که بیشتر برق به گرما تبدیل می‌شود و تنها مقدار کمی نور تولید می‌کند.
@irbioinformatics
در آن زمان در حالی که ساخت دیودهای نورافشان قرمز و سبز ممکن بود، ایجاد نور آبی چالشی بزرگ بود تا اینکه این دانشمندان با تولید نور آبی روشن از نیمه‌رساناهای خود، راه را برای تحول بنیادی در فناوری روشنایی هموار کردند. چراغ‌های LED نه تنها انرژی کمتری مصرف می‌کنند، بلکه خنک‌تر (و در نتیجه ایمن‌تر)، مقاوم‌تر و به اندازه حدود 40 کریسمس عمر دارند که این خود جای جشن گرفتن دارد...
پیشاپیش کریسمس هم مبارک باشه....

Chemistry is everywhere.

It is the chemistry around us that makes life special.

Chemistry explains how molecules create the tastes, feelings, and energy we experience every day.

Dopamine brings love.
Caffeine keeps us awake.
Ethanol fuels celebrations.
Serotonin sparks happiness.
Adrenaline fuels our adventures.
Theobromine gives chocolate charm.

#فوری

واتساپ و گوگل‌پلی ، با اجماع رای مثبت اعضای شورای عالی مجازی رفع فیلتر شد

🔹️این اقدام گام اول طرح رفع محدودیت و فیلترینگ در دولت چهاردهم است /ایرنا

الان میتونیم بدون فیلتر به دوستامون تو واتس اپ پیام بدیم بگیم بیان تلگرام

محدوده مجاز پارامترهای بیولوژیک که در برگه آزمایش شما وجود دارند... کم یا زیاد بودن این پارامترها دلالت در بروز اختلالات بیولوژیکی در این بیومارکرها است که ممکن است با بیماری خاصی در ارتباط باشند.

یه نوت بوک خیلی خوب در محیط پایتون برای انالیز داده های Spatial RNAseq

‏هواپیما با اون عظمتش میفته توِ دانشجو که چیزی نیستی.😁😂 حالا هی قهوه دم کن تا صبح بیدار بمون😂

‏موسیقی بی‌کلام این قدرت رو داره
که تو لحظه من رو به هر مکانی که میخوام ببره؛
وسط کویر، سیارات و کهکشان‌ها، دریا، زیر بارون یا حتی ستاره‌ها ✨

تفاوت استیلاسیون و متیلاسیون هیستون ها
الف) استیلاسیون
استیلاسیون باعث کاهش بار مثبت لیزین‌ها می‌شود که تعامل بین دم‌های هیستونی و DNA (که بار منفی دارد) را کاهش می‌دهد.
نتیجه----> ساختار کروماتین باز (Euchromatin) و دسترسی بیشتر به عوامل رونویسی، که منجر به افزایش بیان ژن می‌شود.
ب) متیلاسیون
متیلاسیون اثر مستقیم بر بار الکتریکی ندارد، اما باعث تغییر در برهمکنش هیستون با پروتئین‌های تنظیمی (مانند کروماتین-مدولاتورها) می‌شود.
نتیجه بسته به مکان و نوع متیلاسیون متفاوت است:
افزایش بیان ژن: اگر متیلاسیون روی لیزین 4 هیستون 3 (H3K4me) باشد.
کاهش بیان ژن: اگر متیلاسیون روی لیزین 9 یا 27 هیستون 3 (H3K9me یا H3K27me) باشد.

Are we becoming a post-literate society?
ایا ما در حال تبدیل شدن به یک جامعه پسا-بیسواد هستیم؟ مقاله ای به قلم Sarah O'Connor که در مجله فایننشیال تایمز به چاپ رسیده است که در ادامه خلاصه ای از این مقاله را خواهید خواهند.
ترجمه اختصاصی از کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
ادامه مطلب...
متن مقاله...
https://www.tgoop.com/IRBioinformatics/1564

نگرانی از کاهش سواد در عصر دیجیتال
نیل پستمن، منتقد فرهنگی، در سال 1988 هشدار داد که تصاویر و رسانه‌های بصری در حال جایگزینی کلمات و متن در فرهنگ و سیاست آمریکا هستند. او معتقد بود تلویزیون و رسانه‌های تصویری ذهن انسان را به دیدگاه‌های سطحی و پراکنده عادت می‌دهند و این امر می‌تواند منجر به کاهش توانایی فکری و سواد جامعه شود.

شواهد جدید از کاهش سواد
بر اساس گزارش اخیر OECD، مهارت‌های سواد و عددی افراد بالغ در بسیاری از کشورها طی دهه گذشته کاهش یافته است. از میان 31 کشور بررسی‌شده، تنها فنلاند و دانمارک پیشرفت کرده‌اند، در حالی که در 11 کشور، از جمله کره جنوبی و نیوزلند، افت شدیدی دیده شده است. در ایالات متحده، یک سوم مردم سطح سواد معادل کودکان 10 ساله دارند.
@irbioinformatics
نقش فناوری و رسانه‌های اجتماعی
فناوری و شبکه‌های اجتماعی عامل مهمی در تغییر شیوه مصرف اطلاعات هستند. بسیاری افراد به جای مطالعه متون پیچیده به سمت محتوای کوتاه و سطحی مانند پست‌های اجتماعی و ویدیوها رفته‌اند. این تغییر موجب شده است توانایی تفکیک واقعیت از نظر، مدیریت ابهام و تحلیل محتوای پیچیده کاهش یابد.
@irbioinformatics
اثرات بر سیاست و فرهنگ عمومی
کاهش سواد تأثیرات منفی بر سیاست و کیفیت مباحث عمومی دارد. همان‌طور که نویسندگان گذشته پیش‌بینی کرده بودند، در فرهنگ‌های شفاهی، کلیشه‌ها و تضادها ارزشمندتر هستند و گفتار کمتر مورد بررسی و تصحیح قرار می‌گیرد. اما نمونه‌هایی مانند فنلاند نشان می‌دهند که با آموزش باکیفیت می‌توان سطح سواد را حتی در دنیای دیجیتال حفظ کرد.

تأثیر هوش مصنوعی
ابزارهای هوش مصنوعی مانند ChatGPT می‌توانند مهارت‌های خواندن و نوشتن را بهبود بخشند، به ویژه برای افرادی با مهارت‌های پایین. اما این ابزارها تنها زمانی مفید خواهند بود که افراد از یک پایه سواد مناسب برخوردار باشند. در غیر این صورت، افراد ممکن است به جای استفاده از این ابزارها برای پیشرفت، به آن‌ها وابسته یا تحت سلطه آن‌ها شوند.

Are we becoming a post-literate society?
خلاصه مقاله