مدل ABC برای توسعه گل یکی از مدلهای مهم و شناختهشده در بیولوژی مولکولی است که توسطEnrico S. Coen & Elliot M. Meyerowitzدر دهه ۱۹۹۰ پیشنهاد شد. این مدل توضیح میدهد که چگونه ژنهای مختلف در گیاهان برای تنظیم توسعه گل و تشکیل بخشهای مختلف آن، از جمله گلبرگها، پرچمها و کاسبرگها، فعالیت میکنند.
@irbioinformatics
مدل ABC به سه گروه از ژنها اشاره دارد که به نامهای A، B و C شناخته میشوند و به طور مشترک به تنظیم بیان صفات مختلف گل کمک میکنند. این ژنها در مراحل مختلف توسعه گل فعال میشوند و ترکیب آنها الگوی خاصی را برای تشکیل اندامهای گل ایجاد میکند.
@irbioinformatics
مدل ABC به سه گروه از ژنها اشاره دارد که به نامهای A، B و C شناخته میشوند و به طور مشترک به تنظیم بیان صفات مختلف گل کمک میکنند. این ژنها در مراحل مختلف توسعه گل فعال میشوند و ترکیب آنها الگوی خاصی را برای تشکیل اندامهای گل ایجاد میکند.
کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
مدل ABC برای توسعه گل یکی از مدلهای مهم و شناختهشده در بیولوژی مولکولی است که توسطEnrico S. Coen & Elliot M. Meyerowitzدر دهه ۱۹۹۰ پیشنهاد شد. این مدل توضیح میدهد که چگونه ژنهای مختلف در گیاهان برای تنظیم توسعه گل و تشکیل بخشهای مختلف آن، از جمله گلبرگها،…
1. ژنهای گروه A:
ژنهای گروه A مسئول تشکیل کاسبرگها (sepal) و گلبرگها (petal) در گل هستند. در حقیقت، این ژنها در بخش ابتدایی توسعه گل نقش دارند و مسئول شکلگیری بخشهایی هستند که در جلوی گل قرار میگیرند.
مثال: در گیاه مدل Arabidopsis thaliana، ژن AP1 (A-class) مسئول توسعه کاسبرگها و گلبرگها است.
2. ژنهای گروه B:
ژنهای گروه B مسئول توسعه گلبرگها و پرچمها (stamens) هستند. این ژنها نقش مهمی در تولید بخشهای میانه گل دارند.
این ژنها معمولاً با ژنهای گروه A ترکیب میشوند تا به توسعه گلبرگها و پرچمها کمک کنند.
مثال: در Arabidopsis thaliana، ژنهای AP3 و PI از گروه B هستند که توسعه گلبرگها و پرچمها را هدایت میکنند.
3. ژنهای گروه C:
ژنهای گروه C مسئول توسعه پرچمها و کاسههای گل (carpels) هستند. این ژنها بخشهای داخلی گل را ایجاد میکنند و به تکامل ساختارهای تولید مثل در گل کمک میکنند.
ژنهای گروه C برای تشکیل کاسههای گل (که در واقع اندامهای تولید مثل ماده هستند) و پرچمها که بخشهای مردانه گل هستند، فعال میشوند.
مثال: در Arabidopsis thaliana، ژن AG (AGAMOUS) از گروه C است که برای تکامل پرچمها و کاسههای گل ضروری است.
ترکیب ژنها:
این مدل بیان میکند که ترکیبهای مختلف این ژنها باعث ایجاد ویژگیهای مختلف در اندامهای گل میشود. به طور خاص:
ترکیب A تنها باعث تشکیل کاسبرگها میشود.
ترکیب A و B باعث تشکیل گلبرگها میشود.
ترکیب B و C باعث تشکیل پرچمها میشود.
ترکیب C تنها باعث تشکیل کاسههای گل (ماده) میشود.
ژنهای گروه A مسئول تشکیل کاسبرگها (sepal) و گلبرگها (petal) در گل هستند. در حقیقت، این ژنها در بخش ابتدایی توسعه گل نقش دارند و مسئول شکلگیری بخشهایی هستند که در جلوی گل قرار میگیرند.
مثال: در گیاه مدل Arabidopsis thaliana، ژن AP1 (A-class) مسئول توسعه کاسبرگها و گلبرگها است.
2. ژنهای گروه B:
ژنهای گروه B مسئول توسعه گلبرگها و پرچمها (stamens) هستند. این ژنها نقش مهمی در تولید بخشهای میانه گل دارند.
این ژنها معمولاً با ژنهای گروه A ترکیب میشوند تا به توسعه گلبرگها و پرچمها کمک کنند.
مثال: در Arabidopsis thaliana، ژنهای AP3 و PI از گروه B هستند که توسعه گلبرگها و پرچمها را هدایت میکنند.
3. ژنهای گروه C:
ژنهای گروه C مسئول توسعه پرچمها و کاسههای گل (carpels) هستند. این ژنها بخشهای داخلی گل را ایجاد میکنند و به تکامل ساختارهای تولید مثل در گل کمک میکنند.
ژنهای گروه C برای تشکیل کاسههای گل (که در واقع اندامهای تولید مثل ماده هستند) و پرچمها که بخشهای مردانه گل هستند، فعال میشوند.
مثال: در Arabidopsis thaliana، ژن AG (AGAMOUS) از گروه C است که برای تکامل پرچمها و کاسههای گل ضروری است.
ترکیب ژنها:
این مدل بیان میکند که ترکیبهای مختلف این ژنها باعث ایجاد ویژگیهای مختلف در اندامهای گل میشود. به طور خاص:
ترکیب A تنها باعث تشکیل کاسبرگها میشود.
ترکیب A و B باعث تشکیل گلبرگها میشود.
ترکیب B و C باعث تشکیل پرچمها میشود.
ترکیب C تنها باعث تشکیل کاسههای گل (ماده) میشود.
به طور خلاصه تفاوت مدل ABC و ABCDE توسعه گل به شرح زیر است:
در مدل ABC:
'A' genes control the sepals
'A' and 'B' genes in combination control the petals
'B' and 'C' genes in combination control the stamens
'C' genes control the carpels
در مدل ABCDE:
'A' genes control the sepals and activation of 'B' and 'C' genes
'A' and 'B' genes in combination control the petals
'B' and 'C' genes in combination control the stamens
'C' genes control the carpels
'C' and 'D' genes control ovule identity and development
'E' genes establish a floral context in which the 'A', 'B' and 'C' genes can function
در مدل ABC:
'A' genes control the sepals
'A' and 'B' genes in combination control the petals
'B' and 'C' genes in combination control the stamens
'C' genes control the carpels
در مدل ABCDE:
'A' genes control the sepals and activation of 'B' and 'C' genes
'A' and 'B' genes in combination control the petals
'B' and 'C' genes in combination control the stamens
'C' genes control the carpels
'C' and 'D' genes control ovule identity and development
'E' genes establish a floral context in which the 'A', 'B' and 'C' genes can function
«سلاما علی من یعرفون معنی الحُب ولا یملکون حبیبا.»
سلام بر کسانی که معنی عشق را میدانند ولی محبوبی ندارند.
#جبران_خلیل_جبران
سلام بر کسانی که معنی عشق را میدانند ولی محبوبی ندارند.
#جبران_خلیل_جبران
دوستانی که دنبال ی ریپوزیتوری خیلی خوب برای بررسی بیوبریک های مورد استفاده در مهندسی ژنوم متابولیت ها و همچنین باکتری ها میگردند می تونن از این دیتابیس برای توسعه پرتکل های سینتیتیک بیولوژی استفاده کنن. همچنین اگر biocircuitهایی در دست طراحی دارید یا طراحی کردید می توانید در اینجا سابمیت کنید و با اطلاعات موجود در این دیتابیس اجزای مدارزیستی خود را مقایسه کنید
https://synbiohub.org/
https://synbiohub.org/
اگه دنبال یه pipeline خیلی خوب در رابطه با طراحی مدارهای زیستی، biobricksها و همچنین مدلسازی واکنش های آنزیمی و تست کارایی اونا میگردین که بتونین باهاش پروژه هاتون در حوزه synthetic biology رو مدیریت کنین می تونین از این ابزار استفاده کنین. خیلی خیلی کار باهاش راحته و می تونین حسابی ازش خروجی های کاربردی و دقیقی بگیرین
https://parts.synbiochem.co.uk/
https://parts.synbiochem.co.uk/
منظور از BioBricks# در زیست شناسی مصنوعی چیست؟
ترجمه اختصاصی: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
28 دسامبر 2024
ادامه مطلب...
رفرنس...
ترجمه اختصاصی: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
28 دسامبر 2024
ادامه مطلب...
رفرنس...
کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
Photo
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM