آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
آشنایی با روش Bulk Segregant Analysis (BSA) منبع تصویر پیوست: https://www.nature.com/articles/nbt.2095
روش Bulk Segregant Analysis (#BSA) یک روش ژنتیکی قدرتمند برای شناسایی ژن‌ها یا نواحی ژنومی مرتبط با صفات خاص است. این روش معمولاً در مطالعات ژنتیکی گیاهان و موجودات مدل استفاده می‌شود و به ویژه برای شناسایی ژن‌های مسئول صفات کمی (QTLs#) یا صفات کیفی مفید است. BSA بر اساس مقایسه‌ی فراوانی آلل‌ها در دو گروه از افراد یک جمعیت (معمولاً والدین و فرزندان) کار می‌کند. این دو گروه شامل یک گروه با فنوتیپ مورد نظر (مانند مقاومت به بیماری) و یک گروه بدون آن فنوتیپ (مانند حساسیت به بیماری) است. با مقایسه‌ی تفاوت‌های ژنتیکی بین این دو گروه، می‌توان نواحی ژنومی مرتبط با صفت مورد نظر را شناسایی کرد.
در مرحله‌ی اول، یک جمعیت در حال تفرق مانند F2 یا backcross ایجاد می‌شود که از تلاقی دو والد با فنوتیپ‌های متفاوت (مثلاً مقاوم و حساس) به‌دست می‌آید. سپس، افراد این جمعیت بر اساس فنوتیپ مورد نظر به دو گروه تقسیم می‌شوند: یک گروه با فنوتیپ مورد نظر (مانند مقاومت) و یک گروه بدون آن (مانند حساسیت). DNA این دو گروه به صورت جداگانه استخراج شده و با هم مخلوط می‌شوند تا دو bulk DNA ایجاد شود. این bulkها نماینده‌ی کل ژنوم هر گروه هستند. سپس، از روش‌های توالی‌یابی نسل جدید (NGS) یا نشانگرهای مولکولی (مانند SNPها) برای مقایسه‌ی فراوانی آلل‌ها بین دو bulk استفاده می‌شود.
در نهایت، با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی، نواحی ژنومی که در آنها تفاوت معناداری در فراوانی آلل‌ها بین دو bulk وجود دارد، شناسایی می‌شوند. این نواحی به عنوان کاندیدای مرتبط با صفت مورد نظر در نظر گرفته می‌شوند. سپس، این نواحی با دقت بیشتری بررسی می‌شوند تا ژن‌های خاص مسئول صفت شناسایی شوند. BSA یک روش سریع و مقرون‌به‌صرفه برای شناسایی ژن‌های مرتبط با صفات پیچیده است و به ویژه در مطالعات ژنتیکی گیاهان کاربرد گسترده‌ای دارد.
به طور کلی QTL مخفف عبارت Quantitative Trait Locus (مکان صفت کمی) است و به ناحیه‌ای از ژنوم اشاره دارد که با تغییرات در یک صفت کمی (Quantitative Trait) مرتبط است. صفات کمی، صفاتی هستند که به جای داشتن حالت‌های مجزا (مانند مقاوم یا حساس)، به صورت طیفی از مقادیر پیوسته ظاهر می‌شوند. این صفات معمولاً تحت تأثیر چندین ژن و همچنین عوامل محیطی قرار می‌گیرند. مثال‌هایی از صفات کمی شامل قد، وزن، عملکرد محصولات زراعی، مقاومت به بیماری‌ها و میزان تولید متابولیت‌های خاص هستند.
در مرحله‌ی اول، یک جمعیت در حال تفرق مانند F2 یا backcross ایجاد می‌شود که از تلاقی دو والد با فنوتیپ‌های متفاوت (مثلاً مقاوم و حساس) به‌دست می‌آید. سپس، افراد این جمعیت بر اساس فنوتیپ مورد نظر به دو گروه تقسیم می‌شوند: یک گروه با فنوتیپ مورد نظر (مانند مقاومت) و یک گروه بدون آن (مانند حساسیت). DNA این دو گروه به صورت جداگانه استخراج شده و با هم مخلوط می‌شوند تا دو bulk DNA ایجاد شود. این bulkها نماینده‌ی کل ژنوم هر گروه هستند. سپس، از روش‌های توالی‌یابی نسل جدید (NGS) یا نشانگرهای مولکولی (مانند SNPها) برای مقایسه‌ی فراوانی آلل‌ها بین دو bulk استفاده می‌شود.
تلاقی Backcross (به فارسی: تلاقی بازگشتی) یک روش اصلاحی در ژنتیک و اصلاح نباتات زراعی است که برای انتقال یک یا چند ژن مطلوب از یک والد (معمولاً والد اهداکننده) به ژنوم والد دیگر (معمولاً والد گیرنده یا والد تکرارشونده) استفاده می‌شود. این روش به ویژه زمانی مفید است که بخواهیم یک صفت خاص (مانند مقاومت به بیماری یا یک ویژگی کیفی) را از یک والد به ژنوم والد دیگر منتقل کنیم، در حالی که بقیه ژنوم والد گیرنده حفظ شود.
در نهایت، با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی، نواحی ژنومی که در آنها تفاوت معناداری در فراوانی آلل‌ها بین دو bulk وجود دارد، شناسایی می‌شوند. این نواحی به عنوان کاندیدای مرتبط با صفت مورد نظر در نظر گرفته می‌شوند. سپس، این نواحی با دقت بیشتری بررسی می‌شوند تا ژن‌های خاص مسئول صفت شناسایی شوند. BSA یک روش سریع و مقرون‌به‌صرفه برای شناسایی ژن‌های مرتبط با صفات پیچیده است و به ویژه در مطالعات ژنتیکی گیاهان کاربرد گسترده‌ای دارد.
👍8❤1
اخبار جدید حاکی از ورود ویروس HmPV یا Human metapneumovirusبه ایران دارد؟ این ویروس دارای قدرت تهاجمی بالا می باشد با درگیر کردن سیستم ریوی افراد مسن و خیلی جوان علائم و تظاهرات بالینی شدیدی از خود نشان دهد. برخلاف ویروس کرونا که یک ویروس ناشناخته بود، ویروس HMPV شناخته شده است و در حال حاضر درمان هایی هم برای مقابله با ان در دسترس است که بیشتر از نوع مراقبتی می باشد. با توجه به پیک شیوع سریع ان از #چین، امکان همه گیری جهانی ان طی ماه های اینده وجود دارد و در این خصوص CDC و WHO هشدارهای لازم را صادر کرده اند. بنابراین با رعایت پرتکل های بهداشتی می توانید از ابتلا به این بیماری جلوگیری نمایید.
برونشیولیت، برونشیت، پنومونی، آسم یا تشدید COPD و عفونت گوش (اوتیت میانی) از عوارض ابتلا به HMPV هستند
لینک های مفید
آشنایی با ویروس HMPV
اپدیت روزانهWHO در خصوص HMPV
اخرین بروزرسانی CDCدر خصوص HMPV
اطلاعات ژنومی ویروس HMPV
لینک های مفید
آشنایی با ویروس HMPV
اپدیت روزانهWHO در خصوص HMPV
اخرین بروزرسانی CDCدر خصوص HMPV
اطلاعات ژنومی ویروس HMPV
😢5🔥1
ربات های تلگرامی شبکه گیاهی ایران
شناسایی گیاهان (نسخه ۲)
با ارسال عکس، گیاه شناسایی و مشخصات گیاهان ارسال خواهد شد.
@picNetplantBot
دریافت اطلاعات گیاهان ایران (نسخه ۱)
با جستجو نام علمی، جنس و گونه گیاهان اطلاعات مربوط به گیاهان ایران دریافت کنید.
@netplantbot
در زمینم چه گیاه دارویی بکارم؟ (نسخه ۱)
با ارسال اطلاعات جغرافیایی، خاک و آب اطلاعات کامل چهار گیاه دارویی مناسب کشت دریافت کنید.
@medNetplantbot
شناسایی گیاهان (نسخه ۲)
با ارسال عکس، گیاه شناسایی و مشخصات گیاهان ارسال خواهد شد.
@picNetplantBot
دریافت اطلاعات گیاهان ایران (نسخه ۱)
با جستجو نام علمی، جنس و گونه گیاهان اطلاعات مربوط به گیاهان ایران دریافت کنید.
@netplantbot
در زمینم چه گیاه دارویی بکارم؟ (نسخه ۱)
با ارسال اطلاعات جغرافیایی، خاک و آب اطلاعات کامل چهار گیاه دارویی مناسب کشت دریافت کنید.
@medNetplantbot
👍4
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
اخبار جدید حاکی از ورود ویروس HmPV یا Human metapneumovirusبه ایران دارد؟ این ویروس دارای قدرت تهاجمی بالا می باشد با درگیر کردن سیستم ریوی افراد مسن و خیلی جوان علائم و تظاهرات بالینی شدیدی از خود نشان دهد. برخلاف ویروس کرونا که یک ویروس ناشناخته بود، ویروس…
آشنایی با ژنوم HMPV
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس
ویروس متاپنوموویروس انسانی (Human Metapneumovirus یا HMPV) یک ویروس ns-ssRNA است که متعلق به خانواده Pneumoviridae و زیرخانواده Pneumovirinae می‌باشد. ژنوم HMPV حدود ۱۳ کیلوباز طول دارد و شامل هشت ژن است که پروتئین‌های ساختاری و غیرساختاری را کد می‌کنند. این ژن‌ها شامل پروتئین‌های ضروری مانند پروتئین اتصال (G)، پروتئین فیوژن (F)، پروتئین ماتریکس (M)، و پروتئین نوکلئوکپسید (N) هستند. پروتئین‌های F و G نقش کلیدی در اتصال و ورود ویروس به سلول‌های میزبان ایفا می‌کنند. HMPV به دو ژنوتایپ اصلی A و B تقسیم می‌شود که هر کدام شامل زیرگروه‌های متعددی هستند. این ویروس یکی از عوامل مهم عفونت‌های دستگاه تنفسی در کودکان، افراد مسن و افراد با سیستم ایمنی ضعیف است و علائمی مشابه ویروس سینسیشیال تنفسی (RSV) ایجاد می‌کند.
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس
ویروس متاپنوموویروس انسانی (Human Metapneumovirus یا HMPV) یک ویروس ns-ssRNA است که متعلق به خانواده Pneumoviridae و زیرخانواده Pneumovirinae می‌باشد. ژنوم HMPV حدود ۱۳ کیلوباز طول دارد و شامل هشت ژن است که پروتئین‌های ساختاری و غیرساختاری را کد می‌کنند. این ژن‌ها شامل پروتئین‌های ضروری مانند پروتئین اتصال (G)، پروتئین فیوژن (F)، پروتئین ماتریکس (M)، و پروتئین نوکلئوکپسید (N) هستند. پروتئین‌های F و G نقش کلیدی در اتصال و ورود ویروس به سلول‌های میزبان ایفا می‌کنند. HMPV به دو ژنوتایپ اصلی A و B تقسیم می‌شود که هر کدام شامل زیرگروه‌های متعددی هستند. این ویروس یکی از عوامل مهم عفونت‌های دستگاه تنفسی در کودکان، افراد مسن و افراد با سیستم ایمنی ضعیف است و علائمی مشابه ویروس سینسیشیال تنفسی (RSV) ایجاد می‌کند.
1- Panda et al.2014
2. Hoogen et al. 2001
👍6🤬1
معرفی کتاب بیوتکنولوژی و سیاست گیاهان نوشته مت هاجز
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس
سال انتشار: 2021
ویراست: اول
انتشارات: Routledge
فرمت کتاب: epub
لینک دسترسی
کتاب بیوتکنولوژی و سیاست گیاهان به بررسی پدیده مرموز #آپومیکسی یعنی توانایی برخی گیاهان برای «خود-همسانه‌سازی»، و پتانسیل آن به عنوان ابزاری انقلابی در کشاورزی و افزایش #امنیت_غذایی می‌پردازد، که به زودی ممکن است به واقعیت بپیوندد...
ادامه مطلب
دانلود کتاب در فرمت epub
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس
سال انتشار: 2021
ویراست: اول
انتشارات: Routledge
فرمت کتاب: epub
لینک دسترسی
کتاب بیوتکنولوژی و سیاست گیاهان به بررسی پدیده مرموز #آپومیکسی یعنی توانایی برخی گیاهان برای «خود-همسانه‌سازی»، و پتانسیل آن به عنوان ابزاری انقلابی در کشاورزی و افزایش #امنیت_غذایی می‌پردازد، که به زودی ممکن است به واقعیت بپیوندد...
ادامه مطلب
دانلود کتاب در فرمت epub
👍3🔥1🐳1
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
معرفی کتاب بیوتکنولوژی و سیاست گیاهان نوشته مت هاجز تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس سال انتشار: 2021 ویراست: اول انتشارات: Routledge فرمت کتاب: epub لینک دسترسی کتاب بیوتکنولوژی و سیاست گیاهان به بررسی پدیده مرموز #آپومیکسی یعنی…
کتاب بیوتکنولوژی و سیاست گیاهان به بررسی پدیده مرموز #آپومیکسی یعنی توانایی برخی گیاهان برای «خود-همسانه‌سازی»، و پتانسیل آن به عنوان ابزاری انقلابی در کشاورزی و افزایش امنیت غذایی می‌پردازد، که به زودی ممکن است به واقعیت بپیوندد. مت هاجز، از طریق مطالعه تاریخی، انسان‌شناختی و قوم‌نگارانه، توسعه پروژه آپومیکسی موسسه CIMMYT، یک برنامه تحقیقاتی پیشرو در مرزهای دانش، و بازسازی آن به عنوان یک مشارکت عمومی-خصوصی برجسته را بررسی می‌کند.
@irbioinformatics
در این کتاب هاجز چگونگی انتقال سریع تاریخی از روش‌های اصلاح نباتات مبتنی بر ژنتیک در بخش عمومی، به عصر جدید بیوتکنولوژی کشاورزی و ژنومیکس که در آن مشارکت‌های عمومی-خصوصی به شکل پیشرویی تبدیل شده‌اند، می‌پردازد. در این راستا، هاجز نشان داده است که چگونه زمینه‌های اجتماعی پژوهش، شکل تولید دانش و همچنین آنچه که «ناشناخته» باقی می‌ماند را تحت تأثیر قرار می‌دهند و توسعه یک «فناوری آپومیکسی» را محدود می‌کنند.
@irbioinformatics
این کتاب رویکردی خلاقانه ارائه می‌دهد که از انسان‌شناسی زمان، مطالعات علم و فناوری، و گفت‌وگو با آثار ژیل دلوز، پل رابینو، هانا آرنت، اندرو پیکرینگ و ادواردو ویویروس د کاسترو الهام گرفته است. هاجز روش‌های نوینی برای ادغام مفاهیم تاریخی ارائه می‌دهد و بررسی می‌کند که چگونه آپومیکسی تصویری جایگزین از تفکر را در مقابل مفاهیم نظری شناخته‌شده‌ای مانند «ریزوم» ارائه می‌دهد. کتاب بیوتکنولوژی و سیاست گیاهان سهم ارزشمندی به منابع در حال رشد علوم اجتماعی در مورد ژنومیکس و بیوتکنولوژی، و همچنین بحث‌های اخیر انسان‌شناختی درباره زمان و تاریخ ارائه می‌کند .
انتشار این مطلب با ذکر منبع مجاز است.
درباره نویسنده:
@irbioinformatics
در این کتاب هاجز چگونگی انتقال سریع تاریخی از روش‌های اصلاح نباتات مبتنی بر ژنتیک در بخش عمومی، به عصر جدید بیوتکنولوژی کشاورزی و ژنومیکس که در آن مشارکت‌های عمومی-خصوصی به شکل پیشرویی تبدیل شده‌اند، می‌پردازد. در این راستا، هاجز نشان داده است که چگونه زمینه‌های اجتماعی پژوهش، شکل تولید دانش و همچنین آنچه که «ناشناخته» باقی می‌ماند را تحت تأثیر قرار می‌دهند و توسعه یک «فناوری آپومیکسی» را محدود می‌کنند.
@irbioinformatics
این کتاب رویکردی خلاقانه ارائه می‌دهد که از انسان‌شناسی زمان، مطالعات علم و فناوری، و گفت‌وگو با آثار ژیل دلوز، پل رابینو، هانا آرنت، اندرو پیکرینگ و ادواردو ویویروس د کاسترو الهام گرفته است. هاجز روش‌های نوینی برای ادغام مفاهیم تاریخی ارائه می‌دهد و بررسی می‌کند که چگونه آپومیکسی تصویری جایگزین از تفکر را در مقابل مفاهیم نظری شناخته‌شده‌ای مانند «ریزوم» ارائه می‌دهد. کتاب بیوتکنولوژی و سیاست گیاهان سهم ارزشمندی به منابع در حال رشد علوم اجتماعی در مورد ژنومیکس و بیوتکنولوژی، و همچنین بحث‌های اخیر انسان‌شناختی درباره زمان و تاریخ ارائه می‌کند .
انتشار این مطلب با ذکر منبع مجاز است.
درباره نویسنده:
مت هاجز یک انسان‌شناس اجتماعی و تاریخی است که در دانشکده انسان‌شناسی و حفاظت دانشگاه کنت در بریتانیا فعالیت می‌کند. او در زمینه انسان‌شناسی علم و فناوری و همچنین موضوعاتی مانند تاریخ، زمان و تجربه دگرگونی و گسست فرهنگی در مناطق روستایی اروپا کار می‌کند. این تمرکز به فناوری‌ها و زیرساخت‌هایی که چنین تحولاتی را به وجود می‌آورند، از جمله بیوتکنولوژی کشاورزی، گسترش می‌یابد. کار اخیر او در مورد تاریخ‌نگاری رادیکال فرانسه در مجله Current Anthropology، جلد ۶۰، شماره ۳ منتشر شده است.
برای مطالعه سایر آثار نویسنده می توانید به لینک اسکالر این محقق مراجعه کنید
scholar.google.co.uk
Matt Hodges
Senior Lecturer in Social Anthropology, School of Anthropology and Conservation, University of Kent - Cited by 598 - Europe - time - historical consciousness - rural restructuring - science and technology studies
👍5💅1
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
معرفی کتاب بیوتکنولوژی و سیاست گیاهان نوشته مت هاجز تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس سال انتشار: 2021 ویراست: اول انتشارات: Routledge فرمت کتاب: epub لینک دسترسی کتاب بیوتکنولوژی و سیاست گیاهان به بررسی پدیده مرموز #آپومیکسی یعنی…
Routledge_Focus_on_Anthropology_Matt_Hodges_Biotechnology_and_the.epub
810.4 KB
معرفی کتاب بیوتکنولوژی و سیاست گیاهان نوشته مت هاجز
سال انتشار: 2021
ویراست: اول
انتشارات: Routledge
فرمت کتاب: epub
@irbioinformatics
سال انتشار: 2021
ویراست: اول
انتشارات: Routledge
فرمت کتاب: epub
@irbioinformatics
👍7🎄1
پخش گردابی (چندمسیره) در کروماتوگرافی
تدوین: ح.رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
پخش گردابی (چندمسیره) در کروماتوگرافی یا Eddy diffusion به پدیده‌ای اشاره دارد که در آن مولکول‌های نمونه مسیرهای متفاوتی را هنگام عبور از ستون کروماتوگرافی طی می‌کنند. این تفاوت در مسیرها ناشی از ساختار نامنظم بستر پر شده در ستون (مانند ذرات bead ستون) است، به طوری که برخی مولکول‌ها مسیرهای کوتاه‌تر و مستقیم‌تر را طی می‌کنند، در حالی که سایر مولکول ها مسیرهای طولانی‌تر و پیچیده‌تر را دنبال می‌کنند. این تغییرات در مسیر حرکت باعث گسترده‌تر شدن پیک‌ها و کاهش وضوح جداسازی می‌شود. پخش گردابی یکی از عوامل موثر در کارایی ستون کروماتوگرافی است و به عنوان یکی از مکانیسم‌های اصلی پخش در نظریه صفحه‌بندی ستون مطرح می‌شود.
تدوین: ح.رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
پخش گردابی (چندمسیره) در کروماتوگرافی یا Eddy diffusion به پدیده‌ای اشاره دارد که در آن مولکول‌های نمونه مسیرهای متفاوتی را هنگام عبور از ستون کروماتوگرافی طی می‌کنند. این تفاوت در مسیرها ناشی از ساختار نامنظم بستر پر شده در ستون (مانند ذرات bead ستون) است، به طوری که برخی مولکول‌ها مسیرهای کوتاه‌تر و مستقیم‌تر را طی می‌کنند، در حالی که سایر مولکول ها مسیرهای طولانی‌تر و پیچیده‌تر را دنبال می‌کنند. این تغییرات در مسیر حرکت باعث گسترده‌تر شدن پیک‌ها و کاهش وضوح جداسازی می‌شود. پخش گردابی یکی از عوامل موثر در کارایی ستون کروماتوگرافی است و به عنوان یکی از مکانیسم‌های اصلی پخش در نظریه صفحه‌بندی ستون مطرح می‌شود.
1- Giddings, 1959, Nature
2- Gritti & Guiochon, 2011, J . Chromatogr. A
👍4☃1👏1
دینامیک سیالات درون ستون کروماتوگرافی
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
درک دینامیک سیالات درون ستون کروماتوگرافی برای بهینه‌سازی فرآیند جداسازی و بهبود کارایی سیستم ضروری است. این مفهوم شامل رفتار فاز متحرک (مایع یا گاز) هنگام عبور از فاز ساکن (بستر پر شده یا پوشش داخل ستون) می‌شود. عوامل کلیدی مانند توزیع یکنواخت جریان، افت فشار، پخش گردابی (اثر چندمسیره)، پخش مولکولی، انتقال جرم و پراکندگی بر کارایی جداسازی تأثیر می‌گذارند. جریان آرام و یکنواخت فاز متحرک برای دستیابی به پیک‌های شارپ با وضوح بالا اهمیت دارد، در حالی که جریان آشفته یا انتقال جرم کند می‌تواند باعث پهن‌شدگی پیک و کاهش کیفیت جداسازی شود. با کنترل این عوامل، می‌توان طراحی ستون و شرایط عملیاتی را بهینه‌سازی کرد تا نتایج دقیق‌تری در کروماتوگرافی به دست آید. مطالعه بیشتر...
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
درک دینامیک سیالات درون ستون کروماتوگرافی برای بهینه‌سازی فرآیند جداسازی و بهبود کارایی سیستم ضروری است. این مفهوم شامل رفتار فاز متحرک (مایع یا گاز) هنگام عبور از فاز ساکن (بستر پر شده یا پوشش داخل ستون) می‌شود. عوامل کلیدی مانند توزیع یکنواخت جریان، افت فشار، پخش گردابی (اثر چندمسیره)، پخش مولکولی، انتقال جرم و پراکندگی بر کارایی جداسازی تأثیر می‌گذارند. جریان آرام و یکنواخت فاز متحرک برای دستیابی به پیک‌های شارپ با وضوح بالا اهمیت دارد، در حالی که جریان آشفته یا انتقال جرم کند می‌تواند باعث پهن‌شدگی پیک و کاهش کیفیت جداسازی شود. با کنترل این عوامل، می‌توان طراحی ستون و شرایط عملیاتی را بهینه‌سازی کرد تا نتایج دقیق‌تری در کروماتوگرافی به دست آید. مطالعه بیشتر...
👍3👏1🦄1
اهمیت پانژنومیکس در اصلاح زراعی محصولات فراموش شده
ترجمه و تدوین: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
امنیت غذایی جهانی به شدت به کشت و زرع چند محصول اصلی و استراتژیک وابسته است، در حالی که محصولات فراموش‌شده (orphan crops)، علیرغم مطالعه کمتر، دارای فوایدی مانند سازگاری زیاد با محیط زیست و ویژگی‌های تغذیه‌ای بهبودیافته هستند، به ویژه در عصر تغییرات اقلیمی که به صورت گسترده کشت محصولات زراعی را با چالش مواجه کرده است. محصولات اصلی زراعی در حال حاضر از مزایای اصلاح نژاد مبتنی بر تکنولوژی ژنومیکس بهره برده‌اند که ابتدا از ژنوم‌های منفرد و سپس از پان‌ژنوم‌ها در اصلاح آنها استفاده شده است.
تحقیقات مربوط به محصولات فراموش‌شده اکنون وارد عصر پانژنومیکس شده است و استفاده از این پان‌ژنوم‌ها همراه با روش‌های پیشرفته انتخاب و فناوری‌های ویرایش ژنوم می‌تواند این گونه‌های فراموش شده و نادیده گرفته شده را به محصولاتی با اهمیت کشاورزی گسترده‌تر در سطح جهان تبدیل کند.
ترجمه و تدوین: ح. رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
امنیت غذایی جهانی به شدت به کشت و زرع چند محصول اصلی و استراتژیک وابسته است، در حالی که محصولات فراموش‌شده (orphan crops)، علیرغم مطالعه کمتر، دارای فوایدی مانند سازگاری زیاد با محیط زیست و ویژگی‌های تغذیه‌ای بهبودیافته هستند، به ویژه در عصر تغییرات اقلیمی که به صورت گسترده کشت محصولات زراعی را با چالش مواجه کرده است. محصولات اصلی زراعی در حال حاضر از مزایای اصلاح نژاد مبتنی بر تکنولوژی ژنومیکس بهره برده‌اند که ابتدا از ژنوم‌های منفرد و سپس از پان‌ژنوم‌ها در اصلاح آنها استفاده شده است.
تحقیقات مربوط به محصولات فراموش‌شده اکنون وارد عصر پانژنومیکس شده است و استفاده از این پان‌ژنوم‌ها همراه با روش‌های پیشرفته انتخاب و فناوری‌های ویرایش ژنوم می‌تواند این گونه‌های فراموش شده و نادیده گرفته شده را به محصولاتی با اهمیت کشاورزی گسترده‌تر در سطح جهان تبدیل کند.
Hu et al. Nat Commun 16, 118 (2025)
👍4🔥1👏1
یک #ویروپلاسم، که گاهی اوقات "کارخانه ویروس" یا "اجسام درون‌سلولی ویروسی" نامیده می‌شود، یک ساختار درون‌سلولی است که در آن تکثیر و مونتاژ ویروس اتفاق می‌افتد. این ساختارها را می‌توان به عنوان کارخانه‌های ویروسی در سلول در نظر گرفت. در یک سلول آلوده، تعداد زیادی ویروپلاسم وجود دارد که تحت میکروسکوپ الکترونی به صورت نواحی متراکم دیده می‌شوند. با این حال، مکانیسم تشکیل ویروپلاسم‌ها هنوز به خوبی درک نشده است.
تشکیل ویروپلاسم ناشی از تعاملات بین ویروس و سلول آلوده است، جایی که محصولات ویروسی و عناصر سلولی در یک فضای محدود جمع‌آوری می‌شوند. این ساختارها به عنوان مراکز اصلی تولید ویروس در سلول عمل می‌کنند.
تشکیل ویروپلاسم ناشی از تعاملات بین ویروس و سلول آلوده است، جایی که محصولات ویروسی و عناصر سلولی در یک فضای محدود جمع‌آوری می‌شوند. این ساختارها به عنوان مراکز اصلی تولید ویروس در سلول عمل می‌کنند.
Netherton et al. 2007
👍3🔥1👏1💯1
برای افزایش مخاطبان کانال، ادرس ما را با دوستان خود به اشتراک بگذارید...
@irbioinformatics
چرا باید در این کانال عضو باشید؟
1- دسترسی به بروزرسانی نرم افزارها و فایل های اپدیت هر نرم افزار اختصاصی
2- دسترسی به بروزترین اخبار حوزه بیوتکنولوژی، بیوانفورماتیک و سایر مسائل زیستی مرتبط
3- دسترسی به محتوای آموزشی و علمی متنوع
4- دسترسی به ویدیوها و دوره های آموزشی
5- عدم تبلیغات نابجا و مزاحم
6- دسترسی و تبادل اطلاعات با ادامین کانال
7- دسترسی به شبکه پویا و دینامیک از کتاب ها و مقالات زیستی
8- و دهها مزیت دیگر...
@irbioinformatics
❤3👍3🤮3
سیستم ویرایش ژنومی Fanzor جایگزینی قابل اعتماد برای سیستم ویرایش ژنوم CRISPR-cas؟
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
سیستم Fanzor یک سیستم ویرایش ژنومی بر پایه پروتئین‌های اُلیگونوکلئوتید-هدایت‌شونده است که اخیراً در سلول های یوکاریوتی مانند قارچ ها و برخی موجودات دریایی کشف شده و به عنوان یک جایگزین بالقوه برای سیستم CRISPR-Cas9 مطرح شده است.
@irbioinformatics
این سیستم اولین بار در یوکاریوت‌ها (موجودات دارای سلول‌های هسته‌دار) شناسایی شد و نشان‌دهنده یک مکانیسم دفاعی ضدویروسی در این موجودات است. در مطالعه اخیری که در ژورنال ساینس چاپ شده است محققان گزارش نموده اند که سیستم ویرایش ژنومی Fanzor در واقع توسط نوعی از ترانسپوزون ها یا عوامل جهنده ژنتیکی کد می شود.
انتشار با ذکر منبع مجاز است.
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
سیستم Fanzor یک سیستم ویرایش ژنومی بر پایه پروتئین‌های اُلیگونوکلئوتید-هدایت‌شونده است که اخیراً در سلول های یوکاریوتی مانند قارچ ها و برخی موجودات دریایی کشف شده و به عنوان یک جایگزین بالقوه برای سیستم CRISPR-Cas9 مطرح شده است.
@irbioinformatics
این سیستم اولین بار در یوکاریوت‌ها (موجودات دارای سلول‌های هسته‌دار) شناسایی شد و نشان‌دهنده یک مکانیسم دفاعی ضدویروسی در این موجودات است. در مطالعه اخیری که در ژورنال ساینس چاپ شده است محققان گزارش نموده اند که سیستم ویرایش ژنومی Fanzor در واقع توسط نوعی از ترانسپوزون ها یا عوامل جهنده ژنتیکی کد می شود.
انتشار با ذکر منبع مجاز است.
1- Han Altae-Tran et al. 2021
2- Kazuki Kato et al. 2022
3- تفاوت با سیستم کریسپر
4- مکانیسم برهمکنش با DNA
👍7🔥1