Science – 17 January 2025

Science is the academic journal of the American Association for the Advancement of Science and is considered one of the world’s most prestigious scientific journals.

تفاوت هیبریدهای F1 و F2
هیبرید F1 نتیجه تلاقی دو لاین خالص از گیاهان است که هر دو ویژگی‌های ثابت و یکسانی دارند. این هیبریدها معمولاً همگن و یکدست هستند و به دلیل اثر هتروزیس (پدیده برتری نسل اول) ممکن است قوی‌تر از والدین خود باشند. با این حال، اگر بذرهای حاصل از هیبرید F1 را بکارید، نسل دوم (F2) ایجاد می‌شود که گیاهان آن متنوع و متفاوت خواهند بود.

در نسل F2، برخی گیاهان ممکن است بهتر و برخی بدتر از اجداد خود باشند. برای ایجاد یک واریته جدید، می‌توان از این نسل گیاهان مناسب را انتخاب و طی چند نسل تثبیت کرد. این فرآیند پایه‌ای برای اصلاح نباتات و تولید انواع جدید گیاهان است.
@irbioinformatics

شواهی از کشف زمان منفی به دست آمده است؟
#خبر
در یک آزمایش جدید در حوزه فیزیک کوانتوم، محققان به رهبری دانیلا آنگولو از دانشگاه تورنتو شواهدی یافته‌اند که نشان می‌دهد فوتون‌ها می‌توانند زمان منفی را در عبور از ابری از اتم‌های سرد سپری کنند، به این معنا که به نظر می‌رسد فوتون‌ها قبل از ورود به ماده، از آن خارج می‌شوند.

این پدیده عجیب، که هنوز مورد بررسی بیشتر قرار نگرفته، از طریق اندازه‌گیری تأخیر زمانی در عبور فوتون‌ها از ابر اتم‌های روبیدیوم سرد مشاهده شد. در برخی موارد، اتم‌ها حتی بدون جذب فوتون‌ها برانگیخته می‌شدند، و گاهی فوتون‌ها به سرعت بازتاب می‌کردند، گویی زودتر از حد انتظار از ماده خارج شده‌اند.

این یافته‌ها درک ما از تعامل نور و ماده را به چالش می‌کشد و پدیده‌های ضد شهودی در دنیای کوانتوم را برجسته می‌کند.

Evidence of ‘Negative Time’ Found in Quantum Physics Experiment

شیوه نصب و اجرای کدهای مورد استفاده در روش GGS برای پیش بینی عملکرد پروتئین ها براساس جهش

پیش نیازهای نصب:
1- Python 3.9
2- PyTorch Lightning 2.0 with Hydra
3- PyKeOps.

مراحل دانلود و نصب:

#clone the repository
git clone https://github.com/kirjner/GGS.git

# Navigate into the unzipped directory
cd GGS

# Install and activate the conda environment from the environment.yaml file
# then setup the ggs package
conda env create -f environment.yaml
conda activate ggs
pip install -e .

در آنالیز RNAseq چگونه روش‌های نرمال‌سازی (TPM/RPKM/FPKM) را برای بیان mRNA انتخاب کنیم؟
تدوین: ح.رسولی، دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران

یکسان‌سازی اندازه‌گیری‌های مقدار بیان mRNA در مطالعات مختلف، یا نرمال‌سازی داده‌های mRNA، یک مسئله مهم در آنالیز داده های RNAseq است. فراوانی رونوشت‌ها (transcripts) به صورت دیجیتالی با استفاده از تعداد خوانش‌ها (read counts) اندازه‌گیری می‌شود.

برای حذف سوگیری‌های فنی در داده‌های توالی‌یابی شده، مانند عمق توالی‌یابی (توالی‌یابی عمیق‌تر باعث تولید تعداد خوانش‌های بیشتر برای یک ژن می‌شود) و طول ژن (ژن‌های طولانی‌تر در سطح یکسان توالی‌یابی، تعداد خوانش‌های بیشتری تولید می‌کنند)، نرمال‌سازی اندازه‌گیری‌های بیان ژن ضروری است.

...بیشتر بخوانید...(لینک این فرسته بروزرسانی می شود)

1- Zhao et al. 2021
2- Rashmi, et al. 2016

مولکول DNA - زیبایی شیمی در طبیعت.

مولکول DNA از بلوک‌های شیمیایی ساخته شده است: یک ستون قند-فسفات و چهار باز نیتروژنی.

آدنین (A)
تیمین (T)
سیتوزین (C)
گوانین (G)

این مواد شیمیایی به طور دقیق جفت می‌شوند (A با T و C با G) تا پله‌های نردبان DNA را تشکیل دهند، که توسط پیوندهای هیدروژنی به هم متصل شده‌اند.

مولکول DNA دستورالعمل‌های لازم برای تمام موجودات زنده را حمل می‌کند و رشد، عملکرد و تولید مثل هر سلول را هدایت می‌کند.

بدون این مواد شیمیایی،
زندگی نمی‌توانست وجود داشته باشد.

راهنمای تصویری استفاده از هوش مصنوعی Scispace برای مرور، خلاصه و تجزیه و تحلیل متون علمی.
@irbioinformatics

‏کاش یه مهد کودک بود واسه بزرگسالان.
میرفتیم در سکوت نقاشی میکشیدیم، خمیربازی میکردیم و کارتون میدیدیم🥺