tgoop.com/eternalblizzard/942
Last Update:
Забавная история. Пишут, что у Toxoplasma gondii какой-то очень странный митохондриальный геном, в топологии которого черт ногу сломит [1]. Однако понятно, что геном маленький, белок-кодирующих генов в нем всего три штуки, а гены рРНК разбиты на очень короткие фрагменты.
Вышла работа, в которой получили структуры митохондриальных рибосом T. gondii [2]. Эти миторибосомы собраны из 53 кусков рРНК, все по длине меньше 300 нуклеотидов, а некоторые из рРНК, согласно статье, длиной всего семь нуклеотидов (вероятно, все-таки без poly-A хвоста?). Большинство рРНК полиаденилированы (и в статье предсказан фермент, который, скорее всего, за это ответственен), и poly-A хвосты важны для формирования структуры. И еще прикол - несколько рРНК встречаются в рибосомах в двух копиях, и каждая из копий принимает разные конформации. Еще обнаружили новые рибосомальные белки, которые, видимо, произошли от транскрипционных факторов (такая вот смена функций).
В связи с этой темой сидел и думал о том, как странно бывает, когда в природе что-то начинает деградировать. Мне кажется, тут сложно сказать, что миторисобома упростилась - суммарная длина рРНК большая, ну и вообще число компонентов выросло, и даже появились новые компоненты (рибосомальные белки), которых раньше не было. Вероятно, тут сказалось два фактора - редукция митохондриального генома на фоне большой нестабильности этого самого митохондриального генома. Пытался к этому какую-нибудь бытовую аналогию привязать.
Вот есть известная история про радиоприемник; если в радиоприемнике сломать какую-нибудь из деталей (почти любой электрический компонент), то приемник перестает работать. Рибосома (и вообще аппарат трансляции) это очень сложный молекулярный механизм, и в нормальных клетках поломка почти любой части этого механизма приводит к тому, что клетка либо вообще не может жить, либо ей становится очень плохо. В случае митохондрий часть этого аппарата становится необязательной (у токсоплазмы миторибосомы синтезируют всего три белка, и все три небольшие и гидрофобные), и ей становится как бы разрешено ломаться.
Можно представить себе такую картину - нужда в нормальных радиоприемниках отпала; радиослушателям доступен всего один канал, и при этом весь контент на этом канале - короткие сообщения, зачитанные монотонным голосом, так что и качество звука уже не важно. Радиоприемники собирают из тех же компонентов, из каких собирали старые, но коробки с этими компонентами по дороге пинают ногами, поэтому все платы приходят разломанные, провода разорванные, и это на месте скручивают с помощью изоленты и клея. Радиоприемник выглядит как груда хлама, работает плохо, но никто не жалуется, потому что, будь радиоприемник хорошим, слушать все равно почти нечего.
1. https://genome.cshlp.org/content/31/5/852
2. https://www.nature.com/articles/s41467-025-56057-9
#читаювсякоеговно
В статье, если я верно понял, присутствует ряд опечаток, которые бросаются в глаза:
На стр. 1, "co-translational rRNA folding" - вероятно, имеется в виду "co-transcriptional rRNA folding", рРНК вряд ли транслируются хоть у кого-то;
На стр. 5, "structure-structure comparison tools (foldseq and DALI)" - наверное, имелся в виду Foldseek, а не foldseq.
Наверное, впопыхах писали.
BY Земля без соли
Share with your friend now:
tgoop.com/eternalblizzard/942