Warning: mkdir(): No space left on device in /var/www/tgoop/post.php on line 37
Warning: file_put_contents(aCache/aDaily/post/iogenras/--): Failed to open stream: No such file or directory in /var/www/tgoop/post.php on line 50 ИОГен РАН@iogenras P.558
#семинарИоген На семинаре «Генетика и геномика» 12 декабря в ИОГен РАН выступил д.б.н., профессор М.С. Гельфанд с докладом «Системная биология немодельных организмов». Немодельные организмы — не относящиеся к традиционно используемым генетическим объектам, это, в данном случае, головоногие моллюски, ресничные инфузории и куколки насекомых с полным превращением. Были рассказаны три истории исследований, проведенных в группе М.С. Гельфанда в Сколтехе в сотрудничестве с другими российскими и зарубежными лабораториями.
Герои первой истории — головоногие моллюски (осьминоги, кальмары, каракатицы) у которых происходит постртранскрипционное редактирование мРНК - химическая модификация аденинов в инозины, которые рибосомой читаются как гуанины. У большинства изученных видов это происходит крайне редко, но у головоногих редактируется около 1% аденинов, что очень много. Ученые нашли корреляцию частоты редактирования аденинов с большей структурированностью мРНК. А сравнивая редактируемые аденины у более близких и менее близких видов, они пришли к выводу о консервативности сайтов редактирования. Затем попытались найти признаки отбора на редактирование. Оказалось, что уровень редактирования аденинов коррелирует с превышением несинонимичных замен A на G, то есть приводящих к замене аминокислоты в белке. Это рассматривается как признак положительного отбора на замену аденина на гуанин. Еще одно наблюдение заключается в том, что редактируемые аденины собираются в кластеры, возможно, именно таким способом они создают островок консервативности.
На самый интересный вопрос, зачем это нужно, ответа пока нет. Положительный отбор говорит о функциональности, о том, что замена аденина на гуанин с эволюционной точки зрения хорошо. Михаил Гельфанд сформулировал гипотетическое объяснение так: «Представим себе, что для эволюции полезно, что в тех или иных местах в геноме были бы гуанины. Но ждать, пока случится мутация в геноме, очень долго. Быстрый «хак» путем того, чтобы хотя бы часть аденинов превратить в гуанины на уровне мРНК, это выход. Вопрос о том, зачем нужно много гуанинов в геноме, остается открытым. Это парадоксальная ситуация, потому что эволюцию мы видим, а что является движущей силой этой эволюции — не видим».
Герои второй истории — ресничные инфузории рода Euplotes, которые покусились на святое — трехбуквенный генетический код. Как и у других инфузорий, них есть много интересных особенностей: микронуклеус (зародышевая линия) и макронуклеус (соматический), в котором множество хромосом; у них очень короткие интроны. Но самое интересное, у них случаются «удивительные приключения с генетическим кодом». Вообще, у инфузорий большое разнообразие вариантов кода, когда бывший стоп-кодон кодирует аминокислоту. . А у Euplotes на стоп-кодоне случается сдвиг рамки, когда трансляция не останавливается, а рибосома сдвигается на один нуклеотид и чтение происходит с новой рамки из четырех нуклеотидов. Это происходит всегда в определенном контексте (АААТАА). Подсчитав вероятность приобретения и потери сдвига рамки в тех или иных сайтах, ученые пришли к выводу, что в правильном контексте отбор против сдвига рамки слабый, так что эволюция этого признака почти нейтральная. Видимо, что это явление возникло случайно, причины у него нет, и искать ее не стоит. Поскольку отбор слабый, у эволюции не получается это «вычистить». Как бы то ни было, «это история про генетический код, в котором имеется четверной кодон, — отмечает Михаил Гельфанд. — Есть контекст, который всегда кодирует сдвиг рамки, что эквивалентно тому, что узнаются четыре нуклеотида, хотя механизм, конечно, не такой, как при обычной трансляции триплетного кодона».
#семинарИоген На семинаре «Генетика и геномика» 12 декабря в ИОГен РАН выступил д.б.н., профессор М.С. Гельфанд с докладом «Системная биология немодельных организмов». Немодельные организмы — не относящиеся к традиционно используемым генетическим объектам, это, в данном случае, головоногие моллюски, ресничные инфузории и куколки насекомых с полным превращением. Были рассказаны три истории исследований, проведенных в группе М.С. Гельфанда в Сколтехе в сотрудничестве с другими российскими и зарубежными лабораториями.
Герои первой истории — головоногие моллюски (осьминоги, кальмары, каракатицы) у которых происходит постртранскрипционное редактирование мРНК - химическая модификация аденинов в инозины, которые рибосомой читаются как гуанины. У большинства изученных видов это происходит крайне редко, но у головоногих редактируется около 1% аденинов, что очень много. Ученые нашли корреляцию частоты редактирования аденинов с большей структурированностью мРНК. А сравнивая редактируемые аденины у более близких и менее близких видов, они пришли к выводу о консервативности сайтов редактирования. Затем попытались найти признаки отбора на редактирование. Оказалось, что уровень редактирования аденинов коррелирует с превышением несинонимичных замен A на G, то есть приводящих к замене аминокислоты в белке. Это рассматривается как признак положительного отбора на замену аденина на гуанин. Еще одно наблюдение заключается в том, что редактируемые аденины собираются в кластеры, возможно, именно таким способом они создают островок консервативности.
На самый интересный вопрос, зачем это нужно, ответа пока нет. Положительный отбор говорит о функциональности, о том, что замена аденина на гуанин с эволюционной точки зрения хорошо. Михаил Гельфанд сформулировал гипотетическое объяснение так: «Представим себе, что для эволюции полезно, что в тех или иных местах в геноме были бы гуанины. Но ждать, пока случится мутация в геноме, очень долго. Быстрый «хак» путем того, чтобы хотя бы часть аденинов превратить в гуанины на уровне мРНК, это выход. Вопрос о том, зачем нужно много гуанинов в геноме, остается открытым. Это парадоксальная ситуация, потому что эволюцию мы видим, а что является движущей силой этой эволюции — не видим».
Герои второй истории — ресничные инфузории рода Euplotes, которые покусились на святое — трехбуквенный генетический код. Как и у других инфузорий, них есть много интересных особенностей: микронуклеус (зародышевая линия) и макронуклеус (соматический), в котором множество хромосом; у них очень короткие интроны. Но самое интересное, у них случаются «удивительные приключения с генетическим кодом». Вообще, у инфузорий большое разнообразие вариантов кода, когда бывший стоп-кодон кодирует аминокислоту. . А у Euplotes на стоп-кодоне случается сдвиг рамки, когда трансляция не останавливается, а рибосома сдвигается на один нуклеотид и чтение происходит с новой рамки из четырех нуклеотидов. Это происходит всегда в определенном контексте (АААТАА). Подсчитав вероятность приобретения и потери сдвига рамки в тех или иных сайтах, ученые пришли к выводу, что в правильном контексте отбор против сдвига рамки слабый, так что эволюция этого признака почти нейтральная. Видимо, что это явление возникло случайно, причины у него нет, и искать ее не стоит. Поскольку отбор слабый, у эволюции не получается это «вычистить». Как бы то ни было, «это история про генетический код, в котором имеется четверной кодон, — отмечает Михаил Гельфанд. — Есть контекст, который всегда кодирует сдвиг рамки, что эквивалентно тому, что узнаются четыре нуклеотида, хотя механизм, конечно, не такой, как при обычной трансляции триплетного кодона».
best-secure-messaging-apps-shutterstock-1892950018.jpg With the administration mulling over limiting access to doxxing groups, a prominent Telegram doxxing group apparently went on a "revenge spree." Telegram is a leading cloud-based instant messages platform. It became popular in recent years for its privacy, speed, voice and video quality, and other unmatched features over its main competitor Whatsapp. Healing through screaming therapy Ng was convicted in April for conspiracy to incite a riot, public nuisance, arson, criminal damage, manufacturing of explosives, administering poison and wounding with intent to do grievous bodily harm between October 2019 and June 2020.
from us
