tgoop.com/ir_bioinformtic_academy/1269
Last Update:
🔶 این نوت‌بوک شامل مثال‌هایی از کار با پایگاه داده‌های NCBI با استفاده از هر دو زبان Python و R است.
📌 محتوا:
1⃣ آموزش نصب کتابخانه‌های مورد نیاز (BioPython ،rentrez ،rpy2).
2⃣ نمایش نحوه‌ی جست‌وجو و دریافت اطلاعات از پایگاه‌های داده NCBI (مانند PubMed و Nucleotide).
3⃣ مقایسه کدهای معادل در Python و R برای هر عملیات.
4⃣ استفاده از سلول‌های کد و مارک‌داون برای توضیح و نمایش نتایج.
📍 طرز استفاده:
1⃣ ابتدا سلول نصب کتابخانه‌ها را اجرا کنید تا پکیج‌های مورد نیاز نصب شوند.
2⃣ برای اجرای کدهای R، مطمئن شوید افزونه rpy2 در Jupyter فعال است.
3⃣ هر بخش با عنوان رنگی Python (زرد/آبی) یا R (آبی) مشخص شده‌است.
4⃣ سلول‌های کد را به‌ترتیب اجرا کنید تا نتایج را مشاهده نمایید.
⭕️ در صورت بروز خطا در نصب یا اجرا، مطمئن شوید که اینترنت فعال است و نسخه‌های پایتون و R به‌درستی نصب شده‌اند.
🔅 موفق باشید!
✍🏻 میلاد هاشمی
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
BY کانال آکادمی بیوانفورماتیک ایران
Share with your friend now:
tgoop.com/ir_bioinformtic_academy/1269