tgoop.com/ir_bioinformtic_academy/1275
Last Update:
⚡️تحلیل هوشمند خوشه‌بندی بیان‌ژن⚡️
🧬 بسته‌ی «ICGE» یک ابزار قدرتمند و رایگان در محیط «R» برای شناسایی و ارزیابی ساختارهای خوشه‌ای داده‌های بیان‌ژن است. این بسته به پژوهشگران ژنومیکس و ترنسکریپتومیکس کمک می‌کند تا الگوهای پنهان در داده‌های پیچیده‌ی «omics» را کشف کنند.
📌بسته‌ی «ICGE» با ترکیب الگوریتم‌های خوشه‌بندی پیشرفته، روش‌های آماری دقیق و معیارهای ارزیابی، ابزاری جامع برای تحلیل داده‌های میکرواری و «RNA-seq» فراهم می‌سازد.
🔷 قابلیت‌های ICGE:
1⃣ انتخاب و اجرای روش‌های متنوع خوشه‌بندی (hierarchical ،k-means و SOM و...).
2⃣ ارزیابی کیفیت خوشه‌ها با معیارهایی مانند «Silhouette» ،«Dunn» و «Calinski-Harabasz».
3⃣ شناسایی خوشه‌های پایدار با داده‌های بیولوژیکی واقعی و شبیه‌سازی‌شده.
❓دیگر چه ابزارهایی مانند ICGE در محیط R را می‌شناسید که برای پژوهش در حوزه‌ی omics کاربردی هستند؟ توی کامنت‌ها برامون بنویسید.
✍🏻 پگاه اسدی
🔗 لینک مستندات و نصب:
https://cran.r-project.org/package=ICGE
📍Instagram | Linkedin | Support
╠ آکادمی بیوانفورماتیک ایران
╠ @ir_bioinf_group
BY کانال آکادمی بیوانفورماتیک ایران
Share with your friend now:
tgoop.com/ir_bioinformtic_academy/1275